#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Разработка новых контрастируюших агентов для МРТ продолжается во многих группах по всему миру. Казанские химики из ИОФХ #РАН @IOPCArbuzov, КФУ @kznuniversity и КНИТУ-КХТУ совместно с биологами из КИББ РАН и ИЦиГ СО РАН @icgsoran (Новосибирск) создали бимодальные контрастеры, способные эффективно работать в режимах T1- и Т2-взвешенной МРТ. В основе - наночастицы оксида железа и ионы марганца (эта комбинация и дает эффект бимодальности), вокруг - силикатная оболочка, которую можно модицифировать под накопление в разных тканях - например, под кишечник, печень или и почки (на мышах, по крайней мере, это работает ок).

Работа опубликована в Journal of Alloys and Compounds (IF = 5.8)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0925838824031682

#зоопарк_одобряет

Мы давно следим за успехами замечательного проекта КоЛаб @colaboratory - это "российский ResearchGate", но с кучей полезных фишечек, которых в зарубежных научных соцсетях пока что нет. Если еще не зарегались - обязательно присоединяйтесь (там уже больше 9000 пользователей, причем из самых разных стран).

Но то, что мы увидели сегодня, нас удивило по-настоящему - КоЛабовцы сделали с нуля свой собственный портал для научных журналов, и на него уже переехала англоязычная версия журнала "Успехи химии" - Russian Chemical Reviews (IF=7.0), которые недавно были вынуждены покинуть зарубежную платформу.

Что по этому поводу можно сказать?

1) У журнала появилась система подачи и рецензирования статей, а сами обзоры можно прочитать в веб-версии (не только в PDF). Это уже отлично (да, это база, но есть множество наших изданий, где этих очевидных с точки зрения современного издательского дела вещей нет до сих пор).

2) Очень советуем редакторам всех хороших российских журналов присмотреться к платформе CoLab, оценить ее и, если понравится, подумать насчет "переезда". Проект явно будет развиваться и дальше.

3) Еще раз повторим: энтузиасты с небольшой командой сделали полноценную журнальную платформу. На аналогичную задачу некоторые небезызвестные госструктуры получили примерно на два порядка больше денег и выдали в результате откровенное убожество. Не то чтобы ситуация была редкой, но тем не менее. Пожелаем КоЛабовцам удачи - они большие молодцы, и именно поэтому они сейчас и наживут себе врагов. Таков путь (с)

https://yangx.top/colaboratory/1637

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Растения можно и нужно рассматривать как "биофабрики" для многих полезных биоактивных соединений, но селективно извлечь нужные вещества - не такая простая задача. Петербуржские химики-аналитики (СПбГУ) уже давно разрабатывают новые методы экстракции с помощью так называемых глубоких эвтектических растворителей (ГЭР) - эта техника позволяет часто получать результаты, недостижимые другими способами. В свежей же работе авторы придумали своего рода "тандемный" способ экстракции - вначале ГЭР, потом ионные жидкости. Оказалось, что в таком варианте можно селективно извлекать полярные (в ГЭР) и малополярные (в ИЖ) вещества, и так анализировать химический состав растений получается гораздо проще и эффективнее.

Статья опубликована в Talanta (IF = 5.6)

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0039914024013262

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Существуют бактерии, которые умеют окислять нефть - и это можно использовать для очистки от загрязнения (например, когда случаются всякие аварии при транспортировке). Проблема там, однако, состоит в том, что в процессе окисления вырабатываются активные формы кислорода (АФК). Избыток АФК провоцирует окислительный стресс, и это уже может быть губительно для бактерий.

В свежей работе биологов из ЮФУ @sfedu_study на примере почвенной "нефтепожирающей" бактерии Rhodococcus erythropolis было обнаружено, что окислительный стресс в процессе утилизации углеводородов активирует регулоны антиоксидантной защиты (SoxR, OxyR) и другие стрессовые регулоны (SOS-ответ, SigF и SigH), причем каталазы здесь регулируются не OxyR, как в классической схеме, а SigF. В результате работы стрессовых регулонов, как полагают авторы, кроме репарации клеточных компонентов, происходит дестабилизация генома, что способно ускорить адаптивную эволюцию. Попросту говоря, эти бактерии в итоге могут и сами (без генной инженерии) адаптироваться к тому, чтобы перерабатывать нефть лучше.

Статья опубликована в Microbiological Research (IF = 6.1)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0944501324003215

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Ученые ЮУрГУ @news_susu в сотрудничестве с коллегами из Казани (КФУ @kznuniversity) и Белграда разработали сенсор, способный определять наличие производных фенола в водной среде, причем в таких концентрациях, что это вполне можно использовать на практике для мониторинга сточных вод. Основа - электрод, модицифированный ванадатом церия, метод сравнительно дешевый и поэтому весьма перспективный.

Статья опубликована в Journal of Physics and Chemistry of Solids (IF = 4.3)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0022369724004906

#зоопарк_одобряет

Красивое от Сеченовки @sechenov_ru: робоманипулятор их разработки, который они показывали на форуме БИОПРОМ-2024. В перспективе - компонент автоматизированных лабораторных систем и хирургических комплексов

#зоопарк_одобряет

А вот это новость замечательная.

Про конкурсы ПП-208 мы, помнится, узнали еще в мае 2022. Суть там, в общем, простая: объявляется список важных и нужных для страны вещей, для которых нужно создать технологию производства (то есть практически во всех случаях это реверс-инжиниринг - так эту программу и анонсировали), выдать документацию и пилотную партию. Кто готов - получает хорошие деньги, во много раз больше, чем эти ваши гранты РНФ, но и ответственность там очень и очень серьезная, отчитаться тезисами конференций точно не получится.

Программе уже почти два года, но РАНовские институты не спешили в нее входить, хотя многие точно могли. Причина понятна: страшновато и непривычно. И вот, наконец, свершилось - один хороший сибирский институт (ИрИХ СО РАН, Иркутск) выиграл сразу несколько конкурсов и в течение года должен выдать технологии производства нескольких веществ, нужных для вулканизации каучука (это и шины для авто, и много чего еще), но долгое время не производившихся в России.

Одобряем, благословляем и приветствуем, надеемся, что почин сибиряков будет подхвачен коллегами по всей стране. Фундаменталка - это прекрасно, но если есть навыки, чтобы заниматься прикладными проектами, то сейчас как раз и есть то самое время, чтобы их таки задействовать. Принести пользу нашей промышленности и заработать на этом очень и очень хорошие деньги

https://yangx.top/rasofficial/10054

#зоопарк_одобряет

Региональные каналы РБК (Юг - @rbcrostov, @rbc_krasnodar и Северный Кавказ - @rbc_kavkaz) запустили новый проект - серию видеоинтервью с учёными нашего Юга на разные животрепещущие темы. Вот, например, комментарий профессора химфака ЮФУ по поводу водородной энергетики, а вот мнение спецов по поводу развития сельскохозяйственных дронов - в общем, спектр тематик широкий.

Когда-то (страшно подумать, но аж три года назад) у нас был чуть другой, но тоже "региональный" проект интервью, который мы делали совместно с Indicator.ru и коллегами из СМУ СКФО - #наукавказ, так что нам инициатива РБКшников очень даже нравится. Иногда по настроению будем репостить самое толковое из этой их рубрики сюда

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Надоели боты, постящие в комментах ссылки на ресурсы о кетогенной диете? Ловите кое-что новенькое на эту тему от ученых.

Коллеги из МГУ, ИФАВ #РАН (Черноголовка) и Воронежского госуниверситета @vsumain изучили влияние кетогенной диеты (для непосвященных: это когда в еде преобладают жиры и белки и содержится минимальное количество углеводов) на транскриптом головного мозга крыс, микрофлору кишечника и всякие интересные параметры крови. Причем все эти изменения были изучены не только при самой диете, но и при экспериментально вызванном инсульте (сравнения ради).

Изучив экспрессию нескольких тысяч генов и сотен видов бактерий кишечника, исследователи показали, что такая диета, действительно, влияет на метаболизм клеток мозга, работу митохондрий и процесс воспаления. Сам инсульт изменял функционирование куда большего числа генов, что неудивительно для такой тяжелой патологии. К сожалению, направление изменений в экспрессии генов при диете во многих случаях совпадало с эффектами инсульта, поэтому неврологические проблемы, вызванные поражением мозга, при диете проявлялись еще сильнее. Хотя такая диета давно и довольно успешно применяется для лечения эпилепсии, при инсульте ее применять, очевидно, не стоит.

Статья опубликована в Brain, Behavior, and Immunity (IF = 8.8)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0889159124006457

(вот пока еще активная ссылка для бесплатного скачивания: https://authors.elsevier.com/a/1jvxO3AAzzl3Ov)

#зоопарк_одобряет

Как мы уже не раз писали, мы люто, бешено одобряем "импортозамещение здорового человека", когда в России начинают выпускать товары годного качества и по вменяемым ценам. А особенно мы это ценим в сфере науки, где долго безраздельно властвовал буржуйский производитель, в последние годы потихоньку вытесняемый китайско-социалистическим, но от того не легче.

Мы это к чему? К нам тут постучались ребятки-биологи из Питера унд столицы. Делают антитела, в перспективе хотят расширяться на ферменты для работы с ДНК и РНК.

Сами мы их продукцию не тестировали, однако призываем коллег-биологов обратить-внимание и писать потом нам, нраицца или не нраицца. Если в России взлетит еще один биотех-стартап, мы точно порадуемся.

Ну и две ремарки:

1) Зоопарк с удовольствием рассказывает о российских производителях научного оборудования и реагентики, причем саршенна бесплатно (во всяком случае, если речь идет о 1-2 постах). Кто принадлежит к этой категории и хочет, чтобы об его товарах узнало больше людей - пишите в ЛС.

2) А вообще есть хороший некоммерческий проект НАША ЛАБА, который как раз для того и создавался - чтобы продвигать "товары научного обихода" российских (и еще белорусских) производителей. Кто еще не знает об этом проекте - заходите на сайт, там огромный каталог научных товаров made in Russia.

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Расшифровка механизмов, регулирующих активность генов - одна из ключевых проблем современных молбиологии и генетики. Как показывают последние работы, геномных данных может быть недостаточно, и для решения задачи необходимы данные о экспрессии миллионов случайных регуляторных последовательностей, получаемые в ходе массовых экспериментов. В поисках способа, как работать с этой информацией, появился конкурс DREAM-2022.

Первое место заняла полносверточная нейросеть от российской команды autosome.ru с участниками из МГУ и двух институтов #РАН - белка (Пущино) и общей генетики (Москва). Они и вошли в число ключевых авторов работы, на днях опубликованной в Nature Biotechnology (IF = 33.1)

В работе организаторы конкурса вместе с авторами победившей архитектуры провели анализ решений, представленных в конкурсе, и показали, что метод на основе комбинации этих решений не только позволяет решать задачи наподобие исходных, но и в других задачах, связанных с эпигенетикой и регуляторной геномикой, показывает state-of-the-art результаты.

https://www.nature.com/articles/s41587-024-02414-w

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Электрохимические процессы очень широко применяются в технологии материалов. Начиналось там все с постоянного тока (взять хотя бы гальванопластику), если же говорить о переменном, то именно на нем держится целое важное направление - нестационарный электролиз (в том числе импульсный). Большинство исследований в этой области были связаны с проблемой разрушения или растворения электродов под действием переменного тока, то есть это всегда рассматривалось как негативное явление, с которым надо бороться.

В свежей работе химиков ЮРГПУ(НПИ) @urgpunpi_official импульсный электролиз был, наоборот, использован для создания новых дисперсных электро- и каталитически активных материалов на основе платины, палладия, олова и графеноподобных наноструктур. Цель - применение в катализе и устройствах преобразования энергии. Такой способ позволяет их получать сравнительно просто, без использования дорогостоящих реагентов и дополнительной обработки. Более того, авторы предложили общую модель получения таких дисперсных материалов с учетом разных параметров - температуры, концентраций и прочего.

Статья опубликована в одном из ведущих журналов по материаловедению - Nano Materials Science (IF = 12.6)

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S258996512400134X

#зоопарк_одобряет

На платформе НАША ЛАБА появилось своего рода "научно-промышленное YouDo" - сервис "Задачи от промышленных предприятий".

Идея простая: индустриалы постят свои задачи - товарищи ученые и инженеры смотрят и, если что-то заинтересовало, связываются с заказчиками и обсуждают условия. Концепция эта не новая, нечто похожее было, например, у Сколково (RnD маркет), но как минимум одно важное отличие здесь в том, что тут это бесплатно, а контракт можно заключать совершенно независимо от портала.

Уже сейчас свои задачи загрузило два предприятия - это Сибур Полилаб (ни много ни мало, да) и Абинский ЭлектроМеталлургический завод; полагаем, что заказчиков будет куда больше. Так что советуем всем желающим попробовать себя в прикладе (и, соответственно, иметь хороший внебюджет) заглянуть на сайт уже сейчас и мониторить его в будущем - повторяем, задачи там явно будут пополняться. Хватит всем - физикам, химикам, биологам.

https://lab.scienceid.net/prom-cooperation/

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Диаман или "двумерный алмаз" - новый углеродный материал, который имеет довольно любопытную структуру. Ее можно представить как два листа графена, которые под действием давления и температуры объединились ковалентными связями в алмазную решетку. Как и у графена, у него есть два основных направления решетки - зигзаг и кресло, а также промежуточные хиральные направления. Важнейшее же его отличие от графена - у него есть запрещенная зона.

В свежей работе из Уфы (Институт проблем сверхпластичности металлов #РАН, группа проф. Баимовой @budni_professora) впервые была исследована зависимость прочности диамана от направления растяжения.
При изменении направления от зигзага к креслу, происходит немонотонное увеличение прочности (максимум - при угле растяжения 10 градусов). Еще более интересно фазовое превращение, которое может происходить в процессе растяжения: например, диаман с хиральностью 5 градусов трансформируется в диаман с хиральностью 10. Скорее всего, этот параметр должен сказываться и на параметрах запрещенной зоны - а это уже интересно для применения этого материала в микроэлектронике.

Статья опубликована в Applied Surface Science (IF = 6.3)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0169433224021561

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Металлическое стекло обладает уникальным набором свойств: прочностью, эластичностью, высоким пределом текучести, большими упругими деформациями, высокой твердостью. Проблема с получением новых вариантов этого типа материалов (то есть аморфных сплавов) заключается в том, что они образуются в: 1) многокомпонентных системах и 2) очень узком диапазоне концентраций, так что искать их обычным перебором - "скринингом" очень и очень трудно, а то и вовсе невозможно.

Ученые из Института металлургии УрО #РАН (Екатеринбург) создали новую теоретическую модель, которая позволяет предсказывать составы четырехкомпонентных стекол в системе Gd-Sc-Co-Al. Один из таких теоретически смоделированных вариантов стекла (Sc33Gd32Co19Al16) был впервые получен экспериментально - и он явно не последний, ибо модель позволяет найти множество новых материалов.

Результаты опубликованы в Intermetallics (IF = 4.3)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0966979524003418

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Новая экспресс-методика биохимического анализа крови на основе ИК-спектроскопии и машинного обучения, не требующая реагентов? Нет, это не фантастика, это новая разработка Института спектроскопии #РАН (Троицк), ИТМО и их китайских коллег. Разработанный ими подход позволяет оценивать активность ферментов печени, уровень кальция, железа, холестерина и много чего еще. Для анализа нужно всего 2 мкл (микролитра) крови. Метод вполне может стать отличной альтернативой традиционным анализам, особенно в мобильных условиях, тем более что он занимает очень мало времени.

В настоящий момент успешные испытания прошли в 67ой ГКБ (Москва), идет подготовка к совместным исследованиям с Сеченовским Университетом и НИИ Склифосовского.

Статья опубликована в Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy (IF = 4.3)

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1386142524014495

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Коллеги из Института глазных болезней им. Краснова (Москва), КФУ @kznuniversity и Уфы (Институт биохимии и генетики #РАН) разработали клеточный краситель на основе неодима и с его помощью визуализировали в клетках ранее не описанные зоны накопления неорганического фосфата (Pi).

Pi играет ключевую роль в энергетическом обмене между клетками. Оригинальный метод визуализации Pi позволил исследователям описать особенности межклеточного энергетического транспорта, в том числе показав, что при апоптозе Pi через филоподии активнее передается от умирающих клеток к соседним здоровым. Возможность "подсветки" зон обмена Pi потенциально может помочь в создании методов точечного терапевтического воздействия на зоны с нарушенным энергетическим обменом, что актуально для лечения, например, таких заболеваний, как сердечная недостаточность и миопатии.

Статья вышла в International Journal of Molecular Sciences (IF = 4.9)

https://www.mdpi.com/1422-0067/25/20/11076

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Первичная открытоугольная глаукома (ПОУГ) – серьезное заболевание, которое может привести к слепоте. До сих пор точно неизвестны все причины развития ПОУГ, но известно, что в ее патогенезе участвуют как факторы, зависящие от внутриглазного давления (ВГД), так и независимые от него.
В свежей китайско-российско-британской работе (Россия там представлена славным Казанским медуниверситетом, одним из старейших в стране @meduniversitetkazan) были изучены генетические факторы, ассоциированные ВГД-независимым компонентом глаукомы. Исследователи использовали метод моделирования структурными уравнениями (genomic SEM) для «вычитания» генетического эффекта, установленного в GWAS ВГД, из GWAS ПОУГ.
В результате было обнаружено 17 независимых однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), ассоциированных с компонентом ПОУГ, не зависящим от ВГД. Примечательно, что 7 из них расположены вне известных локусов ПОУГ, 11 – вне известных локусов ВГД, а 2 являются впервые выявленными локусами ПОУГ.
Было показано, что ВГД-независимый компонент ассоциирован с эндофенотипами глаукомы. В то же время, генетический компонент, зависящий от ВГД, ассоциирован с артериальным давлением и проницаемостью сосудов. То есть в целом результаты свидетельствуют в поддержку «сосудистой теории» глаукомы.

Работа опубликована в Nature Communications (IF = 14.7)

https://www.nature.com/articles/s41467-024-53331-0

#зоопарк_одобряет #дорогая_редакция

Разработка новых сенсоров, позволяющих быстро и надежно определять концентрацию глюкозы в крови, важна по вполне понятным причинам (диабет никуда не девался). Особенно интересны малоинвазивные системы, и здесь соревнование идет за несколько параметров - стабильность, чувствительность и биосовместимость.

Ученые из ТулГУ @tulauniversity совместно с коллегами из ИОХ РАН @ziocras (если точнее, то это команда академика Ананикова @ananikovlab), ЮРГПУ @urgpunpi_official (Ростов-на-Дону) и ИФХЭ #РАН разработали новый гибридный нанокомпозитный материал на основе кремнийорганического полимера с параметрами, делающими его прекрасным кандидатом для создания таких сенсоров. А использование методов машинного обучения позволяет существенно повысить селективность анализа глюкозы в сложных многокомпонентных пробах.

Статья вышла в ACS Applied Polymer Materials (IF = 4.5)

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsapm.4c01394

#зоопарк_одобряет

МИФИ запустил сайт, на котором можно смотреть лекции их преподавателей онлайн. Дело однозначно полезное

https://yangx.top/mephi_of/11470