Скоро выйдет статья, которую мы долго ждали. Она посвящена методам трехмерной визуализации эпифиза - шишковидной железы. Эпифизы были исследованы при помощи рентгеновской фазово-контрастной томографии и сравнен с гистологией образцов. Получилось вроде неплохо :), и при этом (что важно) не потребовалось дополнительного контрастирования. Эта статья - продукт совместной работы с нашими физиками и итальянскими коллегами. Статья уже опубликована онлайн. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S104784772030232X
#эпифиз #методы #промоушен
#эпифиз #методы #промоушен
October 28, 2020
Вот такую прекрасную новость нашли вчера: "Нейробиологи ТГУ, Бельгии и США разработали способ отслеживать передвижение молодых нейронов" https://scientificrussia.ru/news/nejrobiologi-tgu-belgii-i-ssha-razrabotali-sposob-otslezhivat-peredvizhenie-molodyh-nejronov?fbclid=IwAR3z8Pi0zpkjZocCdaT9bB3Xdy1dMp0yuFjwTkIxiujY9FsWWSypOYLjiWU По прочтении осталось много вопросов :) Чтение пресс-релиза не помогло. Статьи пока нет. Зато еще разок посмотрели на возможности #МРТ, в частности упоминаемого в статье "самого мощного в России высокопольного магнитно-резонансного томографа, предназначенного для исследований на мелких лабораторных животных" . Оказалось, что это BioSpec 117/16. Для любопытствующих его технические характеристики и образцы изображений, полученных с его помощью можно увидеть по ссылке https://www.bruker.com/ru/products/mr/preclinical-mri/biospec-11716.html
Понятно, почему пресс-релиз проиллюстрирован иммунофлуоресцентными изображениями, ждем теперь статью.
#методы #нейрогенез
Понятно, почему пресс-релиз проиллюстрирован иммунофлуоресцентными изображениями, ждем теперь статью.
#методы #нейрогенез
«Научная Россия» — наука в деталях!
Нейробиологи ТГУ, Бельгии и США разработали способ отслеживать передвижение молодых нейронов
Ученые помечают новые клетки головного мозга специальным маркером, который виден на МРТ. «Курьером» для доставки выступают инактивированные вирусы, способные легко проникать в клетку
October 30, 2020
Нашлось интересное занятие на досуге. В ноябре в журнале Nature появилась статья полного доступа о новой on-line платформе, позволяющей по срезам достраивать 3-Д изображение. https://www.nature.com/articles/s41467-020-19303-w?utm_source=twitter&utm_medium=social&utm_content=organic&utm_campaign=NGMT_USG_JC01_GL_NRJournals&fbclid=IwAR0wHHCYB0Q5vKckthJsY3gYlgt1LPT3WKa5ii7UZrfJByvkxA-g7znKwXw
А у нас, как раз, есть на чем ее попробовать. Всем хороших выходных!
#методы #атласмозга
А у нас, как раз, есть на чем ее попробовать. Всем хороших выходных!
#методы #атласмозга
Nature Communications
Introducing Biomedisa as an open-source online platform for biomedical image segmentation
Manual segmentation of biological images is a time-consuming task. Here the authors present Biomedisa, an open-source online platform for segmentation of large volumetric images starting from sparsely presegmented slices.
November 28, 2020
Обновление на сайте - срезы головного мозга миноги со схемами (фото 1), окраска по Пишингеру (фото 2). https://brainmicroscopy.com/509/kruglorotye/
Еще больше в календаре про миногу на 21 год, но там окраска по Маллори.
#минога #методы #окраскапоПишингеру
Еще больше в календаре про миногу на 21 год, но там окраска по Маллори.
#минога #методы #окраскапоПишингеру
February 17, 2021
#техническийпост #поджелудочнаяжелеза #методы
Давно ничего не писали о поджелудочной железе. Нашли препринт интересной статьи о принципиальных моментах 3-Д микроанатомии на основе гистологии поджелудочной. Схожие методы можно применять к любому органу.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.08.416909v1.full
Давно ничего не писали о поджелудочной железе. Нашли препринт интересной статьи о принципиальных моментах 3-Д микроанатомии на основе гистологии поджелудочной. Схожие методы можно применять к любому органу.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.08.416909v1.full
bioRxiv
In situ characterization of the 3D microanatomy of the pancreas and pancreatic cancer at single cell resolution
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is one of the deadliest forms of cancer. Accumulating evidence indicates the tumor microenvironment is highly associated with tumorigenesis through regulation of cellular physiology, signaling systems, and gene expression…
March 15, 2021
#методы
После праздников и по такой прекрасной погоде как-то сложно сразу включаться в работу :) Поэтому сегодня у нас #техническийпост о новым методе Пока мы в своей работе используем либо традиционную #ИГХ на серийных срезах, либо различные варианты двойного или тройного окрашивания. В этой статье идет речь о других вариантах множественного окрашивания на одном срезе. Возможно, когда-нибудь нам удастся попробовать эти методы тоже :) https://biomolecula.ru/articles/zhizn-i-sudba-vizualiziruem-kletochnyi-sostav-tkani
После праздников и по такой прекрасной погоде как-то сложно сразу включаться в работу :) Поэтому сегодня у нас #техническийпост о новым методе Пока мы в своей работе используем либо традиционную #ИГХ на серийных срезах, либо различные варианты двойного или тройного окрашивания. В этой статье идет речь о других вариантах множественного окрашивания на одном срезе. Возможно, когда-нибудь нам удастся попробовать эти методы тоже :) https://biomolecula.ru/articles/zhizn-i-sudba-vizualiziruem-kletochnyi-sostav-tkani
Биомолекула
Жизнь и судьба: визуализируем клеточный состав ткани
Методы, которыми пользуются клеточная биология и гистология для визуализации белков в тканях, постоянно совершенствуются, и на сегодняшний день позвол
May 11, 2021
Предлагаем сегодня просто посмотреть на красивые картинки #методы
https://loni.usc.edu/SVG?topic=Any&media=Any&keyword=&pageno=1&#visu-content
https://loni.usc.edu/SVG?topic=Any&media=Any&keyword=&pageno=1&#visu-content
October 20, 2021
Вот, пожалуй, главная новость на сегодня - при помощи фазово-контрастной томографии впервые удалось визуализировать целый мозг человека при клеточном разрешении.
Ссылка на статью - https://www.nature.com/articles/s41592-021-01317-x?utm_source=facebook&utm_medium=social&utm_content=organic&utm_campaign=NGMT_USG_JC01_GL_NRJournals&fbclid=IwAR1OfG-2qMufOZrqu2g87iANcGCP8ou9qTiAc1lUlIRLycM0_Y3LVoR3ouw
Ссылка на видео https://www.youtube.com/watch?v=9yL6D7TtN9w
#методы
Ссылка на статью - https://www.nature.com/articles/s41592-021-01317-x?utm_source=facebook&utm_medium=social&utm_content=organic&utm_campaign=NGMT_USG_JC01_GL_NRJournals&fbclid=IwAR1OfG-2qMufOZrqu2g87iANcGCP8ou9qTiAc1lUlIRLycM0_Y3LVoR3ouw
Ссылка на видео https://www.youtube.com/watch?v=9yL6D7TtN9w
#методы
Nature
Imaging intact human organs with local resolution of cellular structures using hierarchical phase-contrast tomography
Nature Methods - Hierarchical phase-contrast tomography (HiP-CT) enables multiscale imaging of any region within an intact human organ down to cellular resolution. HiP-CT of five organ types...
November 11, 2021
Тем временем в Nature появился список технологий, которые "встряхнут" науку в 2022 году https://www.nature.com/articles/d41586-022-00163-x?utm_term=Autofeed&utm_campaign=nature&utm_medium=Social&utm_source=Facebook&fbclid=IwAR0kxbSrCGVyEfKIocpIdXMMmpyerAPVQOXH23AfWKxSOHJ1ktqWry_sKb8#Echobox=1643143989
В списке из 7 пунктов шесть относятся к области биологии:
1) Полное прочтение генома человека (проект "от теломеры к теломере")
2) Изучение структуры белка при помощи #ИИ
3) Новый, более точный метод редактирования генома, так как традиционный #CRISPR–Cas9 больше подходит для инактивации генов, чем для их починки
4)Таргетная генная терапия на основе не аденовирусных векторов, а с применением липидных наночастиц
5) Пространственное профилирование генома
6) Диагностика основанная на #CRISPR
Посмотрим, что из всего этого выйдет. Надо сказать, что кое-что из этого списка заинтересовало и нас, но стоит вся эта "молекулярная кухня" очень и очень прилично, а вместе с нашей "морфологической кухней" - совсем неприлично (((
#методы
В списке из 7 пунктов шесть относятся к области биологии:
1) Полное прочтение генома человека (проект "от теломеры к теломере")
2) Изучение структуры белка при помощи #ИИ
3) Новый, более точный метод редактирования генома, так как традиционный #CRISPR–Cas9 больше подходит для инактивации генов, чем для их починки
4)Таргетная генная терапия на основе не аденовирусных векторов, а с применением липидных наночастиц
5) Пространственное профилирование генома
6) Диагностика основанная на #CRISPR
Посмотрим, что из всего этого выйдет. Надо сказать, что кое-что из этого списка заинтересовало и нас, но стоит вся эта "молекулярная кухня" очень и очень прилично, а вместе с нашей "морфологической кухней" - совсем неприлично (((
#методы
Nature
Seven technologies to watch in 2022
Nature - Our fifth annual round-up of the tools that look set to shake up science this year.
January 28, 2022
#методы #FISH
Первую картинку мы нашли в сообществе Histology Professionals с подписью "I've made a mistake" :), а вторая картинка - это обложка книги 2019 года выпуска, где есть глава, написанная в нашей лаборатории, ну а третья - собственно
#FISH - метод, который мы очень хотим наладить у нас (картинка с сайта https://www.genome.gov/genetics-glossary/in-situ-hybridization)
Больше не путайте :)
Первую картинку мы нашли в сообществе Histology Professionals с подписью "I've made a mistake" :), а вторая картинка - это обложка книги 2019 года выпуска, где есть глава, написанная в нашей лаборатории, ну а третья - собственно
#FISH - метод, который мы очень хотим наладить у нас (картинка с сайта https://www.genome.gov/genetics-glossary/in-situ-hybridization)
Больше не путайте :)
January 30, 2023