Тошнота, рвота, диарея: опять съел что-то не то, думает человек – и ошибается. В подавляющем большинстве случаев кишечные симптомы связаны совсем не с подтухшей едой, полной вредоносных бактерий, или токсинами. Каковы реальные причины так называемых "пищевых отравлений" и как с ними справляться, поговорим в новом видео у меня на канале [1].
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/z8DCnCylgUI
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/z8DCnCylgUI
June 29, 2022
В начале апреля абсолютно незамеченной прошла новость о том, что ученые наконец расшифровали геном человека. "Что за бред? – скажет читатель, – это же произошло еще 20 лет назад!" Почему никакой ошибки нет, и как за этой новостью скрылась революция в биологии, которую мало кто (из небиологов) заметил, поговорим в новом видео [1] из серии "Кротовые норы".
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/VSiyj7xrnko
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/VSiyj7xrnko
July 1, 2022
И о погоде, в смысле, о ковиде. Пока в Россию пришли сверхзаразные варианты BА.4/5 и одновременно сняли все ограничения, на Западе появляются неприятные данные о том, что паксловид, один из немногих реально эффективных препаратов, предотвращающих тяжелое течение, кажется, в будущем может потерять свою эффективность.
Причина все та же – стремительные мутации коронавируса. Хотя паксловид нацелен и не на чемпиона по мутациям, то есть спайк-белок, а на главную протеазу вируса, по мере того, как, например, в США все больше людей из групп риска получают паксловид, начинает изменяться и она. Пока мутации в протеазе обнаруживаются не слишком часто, но опыты на клеточных культурах показывают, что, если применять паксловид в субоптимальных дозах и долго, то все нужные изменения появляются стремительно, снижая эффективность препарата в десятки раз [1], [2].
Чтобы снизить вероятность такого сценария, предписанная доза пакслолвида сильно превышает ту, что минимально необходима для нейтрализации вируса при заражении, но это работает только в идеальном мире. В реальности люди часто досрочно бросают принимать препараты («Чего организм химией травить»), обеспечивая идеальные условия для отбора устойчивых вариантов. Тем более, что некоторых из «нужных» мутаций периодически спонтанно возникают в популяции [3], [4], так что для закрепления им не хватает только нефатального давления отбора, которое отлично обеспечивают любители прервать лечения на середине.
Более того, паксловид назначают людям с проблемами в работе иммунитета, и они нередко вынуждены принимать его долго, так как без внешней помощи их организм не может справиться с патогеном. Да, таких людей относительно немного, но омикрону для того, чтобы появиться хватило – напомню, основная гипотеза предполагает, что он сформировался именно в организме человека с иммунодефицитом в ходе множества циклов столкновений с ослабленной, но все же пытающейся сопротивляться вирусу иммунной системой. Так что перспективы у SARS-CoV-2 есть.
Ну и чтобы два раза не вставать, еще немного приятных новостей о нашем любимом вирусе. Ученые из Тайланда сообщили о первом достоверном случае передачи ковида от кошки человеку [5]. В августе 2021 года тайская семья, отец и сын, заболели ковидом. Их поместили в изоляционную палату в местной больнице. Но у семьи был кот, и когда его протестировали (очевидно, прежде чем отдать на передержку), выяснилось, что кот тоже подхватил ковид. Когда ветеринар брала мазок, кот чихнул ей в лицо. Через несколько дней у доктора появились характерные симптомы, тест показал ковид, а расшифровка генома – что подхватила она его именно от кота.
Это не значит, что всем владельцам котов следует срочно избавиться от них (как нередко делают в Китае). Передача вируса от животных человеку происходит экстремально редко. Главным, основным и де-факто единственным источником патогена были и остаются люди – хотя в свое время мы и получили вирус от летучих мышей. Кошки, норки, олени могут заражать нас, но для этого надо специально постараться. Так что опасаться надо скорее кошкам.
Причина все та же – стремительные мутации коронавируса. Хотя паксловид нацелен и не на чемпиона по мутациям, то есть спайк-белок, а на главную протеазу вируса, по мере того, как, например, в США все больше людей из групп риска получают паксловид, начинает изменяться и она. Пока мутации в протеазе обнаруживаются не слишком часто, но опыты на клеточных культурах показывают, что, если применять паксловид в субоптимальных дозах и долго, то все нужные изменения появляются стремительно, снижая эффективность препарата в десятки раз [1], [2].
Чтобы снизить вероятность такого сценария, предписанная доза пакслолвида сильно превышает ту, что минимально необходима для нейтрализации вируса при заражении, но это работает только в идеальном мире. В реальности люди часто досрочно бросают принимать препараты («Чего организм химией травить»), обеспечивая идеальные условия для отбора устойчивых вариантов. Тем более, что некоторых из «нужных» мутаций периодически спонтанно возникают в популяции [3], [4], так что для закрепления им не хватает только нефатального давления отбора, которое отлично обеспечивают любители прервать лечения на середине.
Более того, паксловид назначают людям с проблемами в работе иммунитета, и они нередко вынуждены принимать его долго, так как без внешней помощи их организм не может справиться с патогеном. Да, таких людей относительно немного, но омикрону для того, чтобы появиться хватило – напомню, основная гипотеза предполагает, что он сформировался именно в организме человека с иммунодефицитом в ходе множества циклов столкновений с ослабленной, но все же пытающейся сопротивляться вирусу иммунной системой. Так что перспективы у SARS-CoV-2 есть.
Ну и чтобы два раза не вставать, еще немного приятных новостей о нашем любимом вирусе. Ученые из Тайланда сообщили о первом достоверном случае передачи ковида от кошки человеку [5]. В августе 2021 года тайская семья, отец и сын, заболели ковидом. Их поместили в изоляционную палату в местной больнице. Но у семьи был кот, и когда его протестировали (очевидно, прежде чем отдать на передержку), выяснилось, что кот тоже подхватил ковид. Когда ветеринар брала мазок, кот чихнул ей в лицо. Через несколько дней у доктора появились характерные симптомы, тест показал ковид, а расшифровка генома – что подхватила она его именно от кота.
Это не значит, что всем владельцам котов следует срочно избавиться от них (как нередко делают в Китае). Передача вируса от животных человеку происходит экстремально редко. Главным, основным и де-факто единственным источником патогена были и остаются люди – хотя в свое время мы и получили вирус от летучих мышей. Кошки, норки, олени могут заражать нас, но для этого надо специально постараться. Так что опасаться надо скорее кошкам.
July 5, 2022
Ссылки:
[1] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.07.495116v1
[2] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.06.494921v1
[3] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.27.493798v1
[4] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.28.497978v1
[5] - https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35666777/
[1] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.07.495116v1
[2] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.06.494921v1
[3] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.27.493798v1
[4] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.28.497978v1
[5] - https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35666777/
bioRxiv
The substitutions L50F, E166A and L167F in SARS-CoV-2 3CLpro are selected by a protease inhibitor in vitro and confer resistance…
The SARS-CoV-2 main protease (3CLpro) has an indispensable role in the viral life cycle and is a therapeutic target for the treatment of COVID-19. The potential of 3CLpro-inhibitors to select for drug-resistant variants needs to be established. Therefore…
July 5, 2022
Поговорила о ковиде, в том числе в России, где после прихода новых вариантов BA.4/5 наметился рост числа заболевших, с ведущими канала "Популярная политика" [1]. В числе прочего обсудили вопрос о сезонности ковида, которой супротив предсказаний некоторых экспертов так и нет.
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/SwgCznLpuz4
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/SwgCznLpuz4
July 6, 2022
Разобрала [1] у себя на канале историю о том, что коронавирус создали в биолаборатории (опять). На этот раз биолаборатория американская, а сообщил об этом аж целый глава комиссии по расследованию происхождения SARS-CoV-2 при журнале Lancet. Запасаемся попкорном.
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/MrEFA_1lnkc
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/MrEFA_1lnkc
July 7, 2022
В России вслед за Европой наблюдается заметный рост числа заболевших коронавирусом. Причина – новые варианты штамма омикрон BA.4/5. Чего ждать от новой волны и будут ли еще? Стал ли вирус более патогенным? И, наконец, что же в связи со всем этим делать? Обсудили с ведущим программы RTVI "Большой Newstalk" Андреем Ежовым [1].
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/-nDnhHWpVfY
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/-nDnhHWpVfY
YouTube
Новая волна в России: станет ли вирус более патогенным?
В России вслед за Европой наблюдается заметный рост числа заболевших коронавирусом. Причина – новые варианты штамма омикрон BA.4/5. Чего ждать от новой волны и будут ли еще? Стал ли вирус более патогенным? И, наконец, что же в связи со всем этим делать? Обсудили…
July 8, 2022
Поговорила [1] с подкастом "Новой Газеты. Европа" про очередную волну коронавируса. Точнее, о том, как мы будем дальше с ним жить, потому что эта волна вряд ли последняя. Ждать ли новых карантинов, прививаться каждые три месяца и до конца жизни ходить в маске? Или есть иные способы сосуществования?
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/JfSv7-iINPY
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/JfSv7-iINPY
July 12, 2022
Записала новое видео [1] с апдейтом по ковиду, обезьяньей оспе – как раз в России выявили первый случай сегодня – и тяжелым гепатитам у детей неясной природы. Они все еще с нами и уходить пока не собираются (разве что гепатиты, вроде как, собрались, в видео объясняю, почему).
А также завела себе аккаунт на Boosty [2], так что теперь выход новых роликов можно поддерживать не только заморскими еврами на Patreon [3], но и рублями с российских карт.
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/w8Y3axc2mO0
[2] - https://boosty.to/yakutenko
[3] - https://www.patreon.com/yakutenko
А также завела себе аккаунт на Boosty [2], так что теперь выход новых роликов можно поддерживать не только заморскими еврами на Patreon [3], но и рублями с российских карт.
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/w8Y3axc2mO0
[2] - https://boosty.to/yakutenko
[3] - https://www.patreon.com/yakutenko
July 13, 2022
Небольшой апдейт по ковиду. По миру пошла новая волна, связанная с двумя очень похожими разновидностями омикрона BA.4/5. Оба эти варианта – штаммы ухода, то есть мутации в их спайк-белке делают их невидимым для большинства антител, выработанных после встречи с предыдущими версиями ковидных антигенов, неважно после вакцины или после заражения. Проще говоря, вы с высокой вероятностью заболеете, даже если недавно прививались или болели. И с еще большей вероятностью, если давно. От тяжелого течения защита сохраняется лучше, потому что она связана не только с антителами, но и с Т-клетками, которые менее чувствительны к мутациям. Тем не менее, на Западе людям из групп риска (прежде всего пожилым) рекомендовано сделать второй бустер мРНК-вакцинами, а в США обсуждают возможность расширить эту рекомендацию и на молодых людей [1].
Сколько именно народу сейчас заболевает – неизвестно, так как за время затишья после предыдущей омикронной волны государства расслабились, позакрывали тест-центры и не отслеживают контакты. Народ тоже расслабился, никто не носит маски и при простудных симптомах не торопится делать ПЦР. Более того, в Европе и США можно сделать экспресс-тест дома, и многие именно так и поступают, а узнав, что это ковид, тем более не идут делать ПЦР, чтобы не попасть в карантин.
Впрочем, абсолютное число заболевших сейчас не настолько важный показатель, так как большинство людей на Земле так или иначе, но уже имеют иммунитет к коронавирусу, а значит, их шансы на развитие тяжелого течения ниже. Поэтому значимыми критериями становятся заполнение больниц, отделений реанимации и смертность. Они начали расти во многих странах, но пока не радикально.
Все это вместе означает, что сейчас в максимальной опасности оказываются люди из групп риска. Заразиться им сейчас очень легко: и иммунитет от заражения новыми штаммами не предохраняет, и мер никто не соблюдает. А через месяц-полтора закончатся летние каникулы и заработают главные кластеры распространения – школы, вузы и сады. Так что людям с факторами риска важно позаботиться о своей безопасности, сделав бустер и найдя врачей, которые следят за трендами и, в случае болезни, смогут быстро назначить эффективное лечение.
Сейчас у нас есть препараты, способные не только купировать тяжелое течение, но и предотвратить его. Это некоторые моноклональные антитела (хотя новые штаммы сильно снизили их эффективность) и паксловид. В России оригинального паксловида нет, но есть его как бы аналог под названием «Скайвира». Как бы – потому что по составу это паксловид (нирматрелвир 300 мг на дозу + ритонавир 150 мг на дозу), но данных испытаний никто не видел и соответствие рецептуры и стандартов производства не проверял.
Стали ли новые варианты омикрона более патогенными – сказать сложно, потому что сейчас большинство людей в той или иной степени иммунны, поэтому сравнивать абсолютную патогенность BA.4/5 с более ранними версиями, распространявшимися по популяции, в значительной части не имевшей иммунитета, некорректно. Однако первые данные лабораторных исследований указывают, что BA.4/5 поражает легкие лучше, чем ранние версии омикрона, но, видимо, хуже дельты [2], [3]. В практическом смысле это, опять же, означает больший риск тяжелого течения чем в первые омикронные волны, в первую очередь для групп риска.
Про вакцины я позже напишу более подробно, но если коротко, то фармкомпании разрабатывают (и частично уже разработали) вакцины от новых разновидностей омикрона, однако их эффективность не сильно отличается от имеющихся вакцин. Вероятно, дело хотя бы отчасти в так называемом антигенном грехе, склонности иммунной системы при новых встречах с патогеном использовать «наработки», созданные в ходе первой встречи. Так что состав новых вакцин пока дискутируется, вероятнее всего, это будут мультивалентные препараты, содержащие компоненты, которые стимулируют выработку иммунитета к нескольким разновидностям коронавируса.
Сколько именно народу сейчас заболевает – неизвестно, так как за время затишья после предыдущей омикронной волны государства расслабились, позакрывали тест-центры и не отслеживают контакты. Народ тоже расслабился, никто не носит маски и при простудных симптомах не торопится делать ПЦР. Более того, в Европе и США можно сделать экспресс-тест дома, и многие именно так и поступают, а узнав, что это ковид, тем более не идут делать ПЦР, чтобы не попасть в карантин.
Впрочем, абсолютное число заболевших сейчас не настолько важный показатель, так как большинство людей на Земле так или иначе, но уже имеют иммунитет к коронавирусу, а значит, их шансы на развитие тяжелого течения ниже. Поэтому значимыми критериями становятся заполнение больниц, отделений реанимации и смертность. Они начали расти во многих странах, но пока не радикально.
Все это вместе означает, что сейчас в максимальной опасности оказываются люди из групп риска. Заразиться им сейчас очень легко: и иммунитет от заражения новыми штаммами не предохраняет, и мер никто не соблюдает. А через месяц-полтора закончатся летние каникулы и заработают главные кластеры распространения – школы, вузы и сады. Так что людям с факторами риска важно позаботиться о своей безопасности, сделав бустер и найдя врачей, которые следят за трендами и, в случае болезни, смогут быстро назначить эффективное лечение.
Сейчас у нас есть препараты, способные не только купировать тяжелое течение, но и предотвратить его. Это некоторые моноклональные антитела (хотя новые штаммы сильно снизили их эффективность) и паксловид. В России оригинального паксловида нет, но есть его как бы аналог под названием «Скайвира». Как бы – потому что по составу это паксловид (нирматрелвир 300 мг на дозу + ритонавир 150 мг на дозу), но данных испытаний никто не видел и соответствие рецептуры и стандартов производства не проверял.
Стали ли новые варианты омикрона более патогенными – сказать сложно, потому что сейчас большинство людей в той или иной степени иммунны, поэтому сравнивать абсолютную патогенность BA.4/5 с более ранними версиями, распространявшимися по популяции, в значительной части не имевшей иммунитета, некорректно. Однако первые данные лабораторных исследований указывают, что BA.4/5 поражает легкие лучше, чем ранние версии омикрона, но, видимо, хуже дельты [2], [3]. В практическом смысле это, опять же, означает больший риск тяжелого течения чем в первые омикронные волны, в первую очередь для групп риска.
Про вакцины я позже напишу более подробно, но если коротко, то фармкомпании разрабатывают (и частично уже разработали) вакцины от новых разновидностей омикрона, однако их эффективность не сильно отличается от имеющихся вакцин. Вероятно, дело хотя бы отчасти в так называемом антигенном грехе, склонности иммунной системы при новых встречах с патогеном использовать «наработки», созданные в ходе первой встречи. Так что состав новых вакцин пока дискутируется, вероятнее всего, это будут мультивалентные препараты, содержащие компоненты, которые стимулируют выработку иммунитета к нескольким разновидностям коронавируса.
July 14, 2022
Вакцины для маленьких детей пока показывают разочаровывающие результаты: так, эффективность мРНК-вакцины от Pfizer/BioNTech для детей 5-11 лет составляет всего 30% [4], [5]. Это грустно, но лучше, чем ничего. Зато вот FDA одобрил применение в США рекомбинантной (белковой) вакцины от Novavax [6], во вторник ждем одобрения от CDC. Вакцина от Novavax не лучше мРНК-вакцин, но зато это «традиционный» препарат, которым (возможно) разрешат себя привить вакциноскептики. Хотя надежд на это не слишком много, так как в Европе, где Novavax одобрен уже давно, толп желающих привиться именно этим препаратом не наблюдается. Так что, вполне вероятно, Novavax будет переориентировать свой бизнес на бедные страны, что тоже хорошо, там с вакцинацией совсем беда. И именно оттуда к нам приходят новые штаммы – вот, например, в Индии уже некоторое время развивается версия BA.2.75. Пока неясно, насколько она сможет потягаться с BA.5, но кто ж сказал, что BA.2.75 – последняя попытка вируса снова нас всех перезаражать?
July 14, 2022
Ссылки:
[1] - https://www.nytimes.com/2022/07/11/us/politics/second-covid-booster.html
[2] - https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.07.07.22277128v1.full.pdf
[3] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.26.493539v1
[4] - https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/71/wr/mm7111e1.htm
[5] - https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35780801/
[6] - https://www.reuters.com/world/us/us-fda-authorizes-novavax-covid-vaccine-adults-2022-07-13/
[1] - https://www.nytimes.com/2022/07/11/us/politics/second-covid-booster.html
[2] - https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.07.07.22277128v1.full.pdf
[3] - https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.26.493539v1
[4] - https://www.cdc.gov/mmwr/volumes/71/wr/mm7111e1.htm
[5] - https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35780801/
[6] - https://www.reuters.com/world/us/us-fda-authorizes-novavax-covid-vaccine-adults-2022-07-13/
NY Times
Biden Administration May Offer Second Coronavirus Boosters to All Adults
The latest, highly contagious variant has driven up hospitalization rates and deepened worries about waning immunity among those vaccinated or boosted months ago.
July 14, 2022
July 18, 2022
Как, может быть, в курсе многие читатели, я – человек, привитый большим количеством разных коронавирусных вакцин. Зимой 2021-го года я привилась двумя дозами «Спутника» – потому что в Европе исследования и признание вакцин двигались медленно, плюс, мне нужно было часто летать в Россию, где к ограничениям всегда относились прохладно. Ну и да – по итогам тех данных, что были опубликованы (хотя их всегда было мало), «Спутник» показал себя эффективной вакциной против ранних вариантов коронавируса. Потом европейцы признали и разрешили использовать несколько вакцин, и я сделала две дозы Moderna. Наконец, осенью в Европу пришла волна дельты, правила были резко ужесточены, и в январе 2022-го я сделала бустер вакциной от Pfizer/BioNTech.
Подобным образом поступило довольно много людей. Помимо живущих на две страны комбинированную иммунизацию сделали те, у кого были деньги и желание пару раз слетать в условную Армению, Турцию или Сербию, чтобы проставиться пфайзером. И всех этих людей, конечно, интересовало, насколько оправданы были их усилия. Получили ли они лучшую защиту, совместив два типа вакцин.
До недавнего времени ответ на этот вопрос можно было дать только по аналогии: множество статей показывали, что сочетание разных типов вакцин дает более надежный иммунитет, чем использование одной. В статьях рассматривались самые разные комбинации, но «Спутника» среди них не было. И вот наконец в мае на сервере препринтов вышла работа [1], в которой ученые сравнили эффективность двух доз «Спутника» против одной дозы «Спутника» и второй дозы Moderna. Авторы работы, как можно было подумать, не из НИЦ Гамалеи, где был создан «Спутник», а вовсе даже из Аргентины. И поводом к исследованию стал не чисто научный интерес, а неприятная ситуация, сложившаяся в этой стране, когда внезапно выяснилось, что российские производства не справляются со своевременным выпуском второго компонента вакцины, и тысячи людей, привитые первым компонентом «Спутника», остались без второй дозы. Когда стало ясно, что временные перебои затягиваются на неопределенный срок, правительство Аргентины активизировало другие договоренности, и привитые одной дозой «Спутника» смогли завершить иммунизацию мРНК-вакциной от Moderna.
В результате у ученых появилась отличная выборка для сравнения иммунологической эффективности двух схем вакцинации. Ее результат вы видите на иллюстрации к этому посту. Картинка А – привитые, которые до этого переболели ковидом, В – те, кто получил обе дозы, не встречаясь до этого с SARS-CoV-2. SpV/SpV – привитые только «Спутником», SpV/Mod – получившие первый компонент «Спутника», а второй – Moderna. Длина прямоугольников – разбег в количестве выработанных антител, высота их расположения – собственно количество. То есть, чем выше прямоугольник (точнее, его центр), тем больше в крови привитых антител против коронавируса. Графики очевидно показывают, что самая эффективная схема – переболеть (и при этом не умереть), а потом привиться сначала «Спутником», а потом модерной. Но эта схема, как мы понимаем, нас не устраивает. На втором месте вариант не болеть и привиться «Спутником и модерной. Прививка только «Спутником» во всех случаях дает меньше антител против спайк-белка SARS-CoV-2.
Тут сразу нужно сказать, что к работе полно вопросов. Во-первых, авторы оценивали только количество антител, но не реальную защиту. Транслируется ли двукратная (в случае переболевших) или пятикратная (для неболевших) разница в количестве выработанных антител в реально значимое отличие клинической эффективности – неизвестно. Можно предположить, что двукратное, скорее, нет, а пятикратное – скорее, да. Авторы в статье тоже пытаются теоретически это предсказать, на основании данных других работ, но без реальных клинических данных это только предположения. Помимо антител вакцинация стимулирует и наработку защитных Т-клеток, которые очень существенно влияют на риск тяжелого течения.
Во-вторых, авторы не добавили очень важную группу сравнения – привитых двумя дозами модерны.
Подобным образом поступило довольно много людей. Помимо живущих на две страны комбинированную иммунизацию сделали те, у кого были деньги и желание пару раз слетать в условную Армению, Турцию или Сербию, чтобы проставиться пфайзером. И всех этих людей, конечно, интересовало, насколько оправданы были их усилия. Получили ли они лучшую защиту, совместив два типа вакцин.
До недавнего времени ответ на этот вопрос можно было дать только по аналогии: множество статей показывали, что сочетание разных типов вакцин дает более надежный иммунитет, чем использование одной. В статьях рассматривались самые разные комбинации, но «Спутника» среди них не было. И вот наконец в мае на сервере препринтов вышла работа [1], в которой ученые сравнили эффективность двух доз «Спутника» против одной дозы «Спутника» и второй дозы Moderna. Авторы работы, как можно было подумать, не из НИЦ Гамалеи, где был создан «Спутник», а вовсе даже из Аргентины. И поводом к исследованию стал не чисто научный интерес, а неприятная ситуация, сложившаяся в этой стране, когда внезапно выяснилось, что российские производства не справляются со своевременным выпуском второго компонента вакцины, и тысячи людей, привитые первым компонентом «Спутника», остались без второй дозы. Когда стало ясно, что временные перебои затягиваются на неопределенный срок, правительство Аргентины активизировало другие договоренности, и привитые одной дозой «Спутника» смогли завершить иммунизацию мРНК-вакциной от Moderna.
В результате у ученых появилась отличная выборка для сравнения иммунологической эффективности двух схем вакцинации. Ее результат вы видите на иллюстрации к этому посту. Картинка А – привитые, которые до этого переболели ковидом, В – те, кто получил обе дозы, не встречаясь до этого с SARS-CoV-2. SpV/SpV – привитые только «Спутником», SpV/Mod – получившие первый компонент «Спутника», а второй – Moderna. Длина прямоугольников – разбег в количестве выработанных антител, высота их расположения – собственно количество. То есть, чем выше прямоугольник (точнее, его центр), тем больше в крови привитых антител против коронавируса. Графики очевидно показывают, что самая эффективная схема – переболеть (и при этом не умереть), а потом привиться сначала «Спутником», а потом модерной. Но эта схема, как мы понимаем, нас не устраивает. На втором месте вариант не болеть и привиться «Спутником и модерной. Прививка только «Спутником» во всех случаях дает меньше антител против спайк-белка SARS-CoV-2.
Тут сразу нужно сказать, что к работе полно вопросов. Во-первых, авторы оценивали только количество антител, но не реальную защиту. Транслируется ли двукратная (в случае переболевших) или пятикратная (для неболевших) разница в количестве выработанных антител в реально значимое отличие клинической эффективности – неизвестно. Можно предположить, что двукратное, скорее, нет, а пятикратное – скорее, да. Авторы в статье тоже пытаются теоретически это предсказать, на основании данных других работ, но без реальных клинических данных это только предположения. Помимо антител вакцинация стимулирует и наработку защитных Т-клеток, которые очень существенно влияют на риск тяжелого течения.
Во-вторых, авторы не добавили очень важную группу сравнения – привитых двумя дозами модерны.
July 18, 2022
Как много у них антител? Это позволило бы оценить не только гетерологическую схему «Спутник» плюс Moderna, но и две гомологические (два «Спутника» или две модерны). Авторы объясняют отсутствие этой группы тем, что в Аргентине в момент сбора данных для статьи были проблемы не только со вторым компонентом «Спутника», но и с вакциной от Moderna. Технические трудности ясны, но без этой группы результаты неполны. Как неполны они и без групп: полный курс «Спутника» + бустер модерной, полный курс модерны + бустер «Спутником».
В-третьих, авторы сравнивали количество антител против спайк-белка коронавируса, а они бывают очень разные. Клиническую значимость имеют так называемые нейтрализующие антитела, то есть те, связывание которых со спайк-белком не дает вирусу проникнуть в клетку. Далеко не все антитела против спайка такие, многие прикрепляются к его «безопасным» местам, не препятствуя собственно соединению с рецепторами клетки. Тесты на нейтрализацию более трудоемкие и дорогие, здесь авторы ограничились тем, что просто посмотрели все антитела против спайк-белка. В общем случае, чем больше всех антител против спайка, тем больше и нейтрализующих, но а) необязательно и б) важна разница в эффекте от количества, а ее тут не видно.
Проще говоря, это довольно слабая работа (там еще много косяков по мелочи типа маленькой выборки), для того чтобы она стала реально значимой, ее нужно существенно доделывать. Но (пока?) это единственное исследование, в котором в принципе сравнили смешанные схемы с использованием «Спутника». Если бы 24 февраля мир не сломался, его результаты были бы вполне полезны хотя бы как отправная точка. Теперь же вряд ли значительное количество народу в ближайшие годы будут сочетать «Спутник» с какими-нибудь западными вакцинами. Но это уже вопрос не про науку.
В-третьих, авторы сравнивали количество антител против спайк-белка коронавируса, а они бывают очень разные. Клиническую значимость имеют так называемые нейтрализующие антитела, то есть те, связывание которых со спайк-белком не дает вирусу проникнуть в клетку. Далеко не все антитела против спайка такие, многие прикрепляются к его «безопасным» местам, не препятствуя собственно соединению с рецепторами клетки. Тесты на нейтрализацию более трудоемкие и дорогие, здесь авторы ограничились тем, что просто посмотрели все антитела против спайк-белка. В общем случае, чем больше всех антител против спайка, тем больше и нейтрализующих, но а) необязательно и б) важна разница в эффекте от количества, а ее тут не видно.
Проще говоря, это довольно слабая работа (там еще много косяков по мелочи типа маленькой выборки), для того чтобы она стала реально значимой, ее нужно существенно доделывать. Но (пока?) это единственное исследование, в котором в принципе сравнили смешанные схемы с использованием «Спутника». Если бы 24 февраля мир не сломался, его результаты были бы вполне полезны хотя бы как отправная точка. Теперь же вряд ли значительное количество народу в ближайшие годы будут сочетать «Спутник» с какими-нибудь западными вакцинами. Но это уже вопрос не про науку.
July 18, 2022
July 18, 2022
July 19, 2022
July 19, 2022
Сижу работаю, закрыв балкон и окна и занавесив шторы. Потому что в Берлине +38, и это у нас еще ничего. В Португалии температура доходит до +47, в прохладной Англии +40. Европейцы называют такую длительную ясную экстремально жаркую погоду heat wave, волна тепла. И кажется, теперь такие эпизоды станут новой нормой. Почему это так, и что теперь делать, обсудм в новом видео [1].
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/6l-BEY2q98A
Ссылки:
[1] - https://youtu.be/6l-BEY2q98A
July 20, 2022
Написала более или менее подробно про новую волну и вызывающие ее штаммы для The Insider [1]. Как обычно, тут фрагменты, целиком текст со всеми источниками по ссылке.
Симптомы ранних стадий заболевания мало изменились: заразившиеся версиями BA.4/5 жалуются на слабость, головную боль, чихание, насморк и боль в горле. По данным, собранным приложением по отслеживанию симптомов Zoe, температура поднимается только у трети заболевших, а изматывающий кашель имеет место, в основном, у непривитых. Потеря запахов также встречается, но насколько часто, сказать пока сложно. До сих пор каждый новый доминирующий вариант вызывал этот симптом реже предыдущих, и для первой волны омикрона, связанной с вариантами BA.1 и BA.2, он был совсем нехарактерен: частота аносмии составляла всего 17% от того, что было в начале пандемии.
Пока эксперты избегают делать какие-либо предсказания, так как волна только начинается и динамика госпитализаций в ОРИТ и смертей неясна. Однако по опыту с первыми разновидностями омикрона мы знаем, что менее патогенные (в нынешней ситуации не важно, в принципе или для иммунной популяции), но более заразные штаммы способны убить примерно столько же людей. Абсолютное количество погибших в ходе волн, вызванных вариантами дельта и омикрон, оказалось одинаковым, хотя в омикронную волну заразилось намного больше народа.
28 июня экспертная комиссия при американском регуляторе FDA рекомендовала обновить состав вакцин, включив туда компоненты, стимулирующие выработку антител к варианту омикрон. Однако вовсе не факт, что это решение поможет радикально сократить количество новых инфекций.
Предварительные испытания и тесты показывают, что бустер двухкомпонентными вакцинами дает лишь незначительный – около двух раз – прирост нейтрализующих (самых эффективных) антител по сравнению с уже существующими препаратами. Имеет ли такая разница в количестве антител клинический эффект – большой вопрос, но, вероятнее всего, нет.
Неожиданно низкая эффективность новых версий вакцин хотя бы отчасти может быть связана с так называемым антигенным грехом, склонностью иммунной системы при новых встречах с патогеном использовать «наработки», созданные в ходе первой встречи. Если это так, можно ожидать, что для привитых и переболевших прежними вариантами коронавируса изменение существующих вакцин не будет давать радикального улучшения защиты.
При этом существующие вакцины по-прежнему хорошо защищают людей от тяжелого течения, особенно если бустер сделан недавно. Учитывая это, медицинские регуляторы в США и Европе уже рекомендовали пожилым сделать второй бустер мРНК-препаратами, а в США идут дискуссии о том, чтобы расширить эту рекомендацию и на молодых. Тем не менее, скорее всего, и в США, и в Европе одобрят двухкомпонентные вакцины.
В России единственной вакциной, для которой есть доказательства эффективности, является «Спутник», он же Gam-COVID-Vac. Однако до сих пор его разработчики не публиковали результатов исследований, показывающих, насколько этот препарат сохранил действенность против BA.4/5. Последняя статья на сайте препринтов посвящена иммунологической эффективности «Спутника» против первых разновидностей омикрона, то есть не данным о реальных заболеваниях, а оценке количества антител против коронавируса в крови привитых.
В одном из интервью старший научный сотрудник НИЦ имени Гамалеи, где был разработан «Спутник», Анатолий Альштейн рассказал, что вакцина была менее эффективна против варианта дельта и еще менее эффективна против омикрона. Впрочем, Альштейн не принимал участие в создании и исследованиях эффективности «Спутника», так что надежных данных о том, насколько иммунизация этим препаратам защищает от заражения BA.4/5 и вызванного этими разновидностями тяжелого течения, у нас нет.
Симптомы ранних стадий заболевания мало изменились: заразившиеся версиями BA.4/5 жалуются на слабость, головную боль, чихание, насморк и боль в горле. По данным, собранным приложением по отслеживанию симптомов Zoe, температура поднимается только у трети заболевших, а изматывающий кашель имеет место, в основном, у непривитых. Потеря запахов также встречается, но насколько часто, сказать пока сложно. До сих пор каждый новый доминирующий вариант вызывал этот симптом реже предыдущих, и для первой волны омикрона, связанной с вариантами BA.1 и BA.2, он был совсем нехарактерен: частота аносмии составляла всего 17% от того, что было в начале пандемии.
Пока эксперты избегают делать какие-либо предсказания, так как волна только начинается и динамика госпитализаций в ОРИТ и смертей неясна. Однако по опыту с первыми разновидностями омикрона мы знаем, что менее патогенные (в нынешней ситуации не важно, в принципе или для иммунной популяции), но более заразные штаммы способны убить примерно столько же людей. Абсолютное количество погибших в ходе волн, вызванных вариантами дельта и омикрон, оказалось одинаковым, хотя в омикронную волну заразилось намного больше народа.
28 июня экспертная комиссия при американском регуляторе FDA рекомендовала обновить состав вакцин, включив туда компоненты, стимулирующие выработку антител к варианту омикрон. Однако вовсе не факт, что это решение поможет радикально сократить количество новых инфекций.
Предварительные испытания и тесты показывают, что бустер двухкомпонентными вакцинами дает лишь незначительный – около двух раз – прирост нейтрализующих (самых эффективных) антител по сравнению с уже существующими препаратами. Имеет ли такая разница в количестве антител клинический эффект – большой вопрос, но, вероятнее всего, нет.
Неожиданно низкая эффективность новых версий вакцин хотя бы отчасти может быть связана с так называемым антигенным грехом, склонностью иммунной системы при новых встречах с патогеном использовать «наработки», созданные в ходе первой встречи. Если это так, можно ожидать, что для привитых и переболевших прежними вариантами коронавируса изменение существующих вакцин не будет давать радикального улучшения защиты.
При этом существующие вакцины по-прежнему хорошо защищают людей от тяжелого течения, особенно если бустер сделан недавно. Учитывая это, медицинские регуляторы в США и Европе уже рекомендовали пожилым сделать второй бустер мРНК-препаратами, а в США идут дискуссии о том, чтобы расширить эту рекомендацию и на молодых. Тем не менее, скорее всего, и в США, и в Европе одобрят двухкомпонентные вакцины.
В России единственной вакциной, для которой есть доказательства эффективности, является «Спутник», он же Gam-COVID-Vac. Однако до сих пор его разработчики не публиковали результатов исследований, показывающих, насколько этот препарат сохранил действенность против BA.4/5. Последняя статья на сайте препринтов посвящена иммунологической эффективности «Спутника» против первых разновидностей омикрона, то есть не данным о реальных заболеваниях, а оценке количества антител против коронавируса в крови привитых.
В одном из интервью старший научный сотрудник НИЦ имени Гамалеи, где был разработан «Спутник», Анатолий Альштейн рассказал, что вакцина была менее эффективна против варианта дельта и еще менее эффективна против омикрона. Впрочем, Альштейн не принимал участие в создании и исследованиях эффективности «Спутника», так что надежных данных о том, насколько иммунизация этим препаратам защищает от заражения BA.4/5 и вызванного этими разновидностями тяжелого течения, у нас нет.
July 22, 2022
В отличие от первых волн SARS-CoV-2, сегодня у нас есть сразу несколько групп препаратов, предотвращающих тяжелое течение и снижающих его последствия. К первой группе относится, прежде всего, паксловид (нирматрелвир 300 мг на дозу + ритонавир 150 мг на дозу) и некоторые моноклональные антитела. Паксловид блокирует работу главной протеазы вируса, которая нужна ему, чтобы разрезать синтезированную с генома белковую «заготовку» на отдельные белки.
В России паксловид, разработанный компанией Pfizer, недоступен, однако весной там были зарегистрированы два аналога – «Скайвира» и миробивир. В конце февраля появилась информация, что в стране будут проведены I-II фазы клинический испытаний комбинации нирматрелвир/ритонавир, однако до регистрации обоих препаратов о результатах этих испытаний ничего не сообщалось.
Про другие лекарства от ковида, лонгковид после омикрона, свойства новых вариантов – на сайте The Insider [1].
В России паксловид, разработанный компанией Pfizer, недоступен, однако весной там были зарегистрированы два аналога – «Скайвира» и миробивир. В конце февраля появилась информация, что в стране будут проведены I-II фазы клинический испытаний комбинации нирматрелвир/ритонавир, однако до регистрации обоих препаратов о результатах этих испытаний ничего не сообщалось.
Про другие лекарства от ковида, лонгковид после омикрона, свойства новых вариантов – на сайте The Insider [1].
July 22, 2022