С начальных этапов внедрения метода секвенирования ДНК по Сэнгеру основным собственником «идеи метода» и единственным производителем секвенаторов, а также реактивов и расходных материалов для этого метода была американская компания Applied Biosystems. Эта компания ввиду полного отсутствия конкурентов, могла устанавливать какие угодно цены на оборудование и реактивы. Сейчас в мире существует несколько компаний, осуществляющих производство оборудование, реактивов и расходных материалов для секвенирования по Сэнгеру. Американская компания Life Technologies, куда недавно влилась Applied Biosystems, производит секвенаторы ABI 3500 и 3500xl и всю оригинальную химию и расходные материалы; нидерландская компания Nimagen, производящая альтернативную химию для секвенаторв; китайская компания SuperBio International Co., Ltd. – производит секвенаторы Honor-1616, а также российская компания «Синтол», которая с 2015 года внедрила в серийное производство генетические анализаторы Нанофор-05. Поэтому в настоящее время в условиях сложной геополитической обстановки наличие и доступность отечественных генетических анализаторов значительно облегчает работу научных и медицинских учреждений.
На рис. 1 - принцип работы секвенатора
Фото - Д.М. Атопкин
Автор текста Д.М. Атопкин, к.б.н., в.н.с. лаб. паразитологии
#буднинауки
#bd_equipment
На рис. 1 - принцип работы секвенатора
Фото - Д.М. Атопкин
Автор текста Д.М. Атопкин, к.б.н., в.н.с. лаб. паразитологии
#буднинауки
#bd_equipment
Дорогие читатели! Сегодня пятница, а это значит, пришло время рубрики #буднинауки. Сегодня мы расскажем об открытой базе данных «Определитель вместимости среды обитания копытных животных Дальнего Востока», размещенной на сайте ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН.
О проекте
Каждый, кто имел повод оценить величину какого-либо биологического ресурса, задавался вопросом о том, чем определяются «рыбные и грибные места». Современный уровень пользования биологическими ресурсами отражает затянувшийся переход от «как и где больше добыть» к «как сделать воспроизводство более интенсивным». Начав эту работу, авторы ментально перенеслись в рай будущего, где всё, что плохо лежало уже добыто и съедено, а перебить и потребить можно только произведенное.
Бухгалтерия пользования и воспроизводства ресурсов состоит из бесконечного количества «сколько?». Но заполнение инновационного вакуума в этой сфере мы начали с вместимости среды обитания. В охотоведении и других практических приложениях экологии чаще используется термин ёмкость среды или ёмкость охотничьих угодий. Несмотря на русскоязычную формулировку, в собственно экологии фундаментальный термин «вместимость» (carrying capacity) - это количественный параметр конкретной экосистемы, а точнее, видимого наблюдателю среза этой экосистемы в отношении включенного в нее определенного вида или той части популяции этого вида, которая может считаться ограниченной видимыми наблюдателю границами этой экосистемы.
На фото самка изюбря (благородного оленя), автор фото О.Н. Ухваткина
#буднинауки
О проекте
Каждый, кто имел повод оценить величину какого-либо биологического ресурса, задавался вопросом о том, чем определяются «рыбные и грибные места». Современный уровень пользования биологическими ресурсами отражает затянувшийся переход от «как и где больше добыть» к «как сделать воспроизводство более интенсивным». Начав эту работу, авторы ментально перенеслись в рай будущего, где всё, что плохо лежало уже добыто и съедено, а перебить и потребить можно только произведенное.
Бухгалтерия пользования и воспроизводства ресурсов состоит из бесконечного количества «сколько?». Но заполнение инновационного вакуума в этой сфере мы начали с вместимости среды обитания. В охотоведении и других практических приложениях экологии чаще используется термин ёмкость среды или ёмкость охотничьих угодий. Несмотря на русскоязычную формулировку, в собственно экологии фундаментальный термин «вместимость» (carrying capacity) - это количественный параметр конкретной экосистемы, а точнее, видимого наблюдателю среза этой экосистемы в отношении включенного в нее определенного вида или той части популяции этого вида, которая может считаться ограниченной видимыми наблюдателю границами этой экосистемы.
На фото самка изюбря (благородного оленя), автор фото О.Н. Ухваткина
#буднинауки
Объекты исследования
На Дальнем Востоке России обитает 9 видов диких парнокопытных:
🐗 кабан Sus scrofa Linnaeus, 1758;
🦌 кабарга Moschus moschiferus Linnaeus, 1758;
🦌 сибирская косуля Capreolus pygargus Pallas, 1771;
🦌 пятнистый олень Cervus nippon Temminck, 1838;
🦌 благородный олень Cervus elaphus Linnaeus, 1758;
🫎 лось Alces alces Linnaeus, 1758;
🦌 северный олень Rangifer tarandus Linnaeus, 1758;
🐐 амурский горал Nemorhaedus caudatus Milne-Edwards, 1867;
🐐 снежный баран Ovis nivicola Eschscholtz, 1829.
Недавно реинтродуцированный на севере овцебык пока остается не изученным. Дополнительно приводятся данные по кормовым спектрам домашних животных, которые объединены, поскольку в литературе видовая принадлежность скота, поедающего тот или иной вид растения не всегда конкретизирована. Информацию по видам диких парнокопытных можно найти ЗДЕСЬ
Цель проекта
Определение вместимости среды обитания парнокопытных Дальнего Востока России, связанной с кормовыми ресурсами.
На фото пятнистый олень, автор фото О.Н. Ухваткина
#буднинауки
На Дальнем Востоке России обитает 9 видов диких парнокопытных:
🐗 кабан Sus scrofa Linnaeus, 1758;
🦌 кабарга Moschus moschiferus Linnaeus, 1758;
🦌 сибирская косуля Capreolus pygargus Pallas, 1771;
🦌 пятнистый олень Cervus nippon Temminck, 1838;
🦌 благородный олень Cervus elaphus Linnaeus, 1758;
🫎 лось Alces alces Linnaeus, 1758;
🦌 северный олень Rangifer tarandus Linnaeus, 1758;
🐐 амурский горал Nemorhaedus caudatus Milne-Edwards, 1867;
🐐 снежный баран Ovis nivicola Eschscholtz, 1829.
Недавно реинтродуцированный на севере овцебык пока остается не изученным. Дополнительно приводятся данные по кормовым спектрам домашних животных, которые объединены, поскольку в литературе видовая принадлежность скота, поедающего тот или иной вид растения не всегда конкретизирована. Информацию по видам диких парнокопытных можно найти ЗДЕСЬ
Цель проекта
Определение вместимости среды обитания парнокопытных Дальнего Востока России, связанной с кормовыми ресурсами.
На фото пятнистый олень, автор фото О.Н. Ухваткина
#буднинауки
Содержание проекта
Подход к оценке вместимости среды обитания парнокопытных основан на представлении их взаимосвязей с кормовыми растениями в виде трофических сетей. Эти данные в виде матрицы сообщества с видами потребителей в столбцах, видами растений в строках и рангом кормовых предпочтений в ячейках, уже пригодны для расчетов вместимости, если известна масса видов растений. Таким образом, для определения вместимости используются два типа данных: данные присутствия/отсутствия видов растений в кормовых спектрах видов парнокопытных и данные о количестве (массе в тоннах на 1000 га) этих видов растений в природе.
Эта база данных позволяет непосредственно оценить ресурсное пространство копытных Дальнего Востока, то есть то множество ресурсных измерений, которое ограничено кормовыми объектами. Запас трофических ресурсов является одним из важнейших ограничителей роста плотности популяций: на участке не может быть больше особей, чем это позволяет запас корма.
Авторы и основные исполнители проекта
И.С. Шереметьев, д.б.н., с.н.с. лаб. териологии
А.А. Воронков, начальник отдела информации и компьютерных технологий
Е.В. Жабыко, к.б.н., начальник научно-организационного отдела
Вы можете связаться с нами, оставить свои комментарии и вопросы по адресу электронной почты: [email protected]
На фото косуля сибирская, автор фото О.Н. Ухваткина
Автор текста И.С. Шереметьев, д.б.н., с.н.с. лаб. териологии
#буднинауки
Подход к оценке вместимости среды обитания парнокопытных основан на представлении их взаимосвязей с кормовыми растениями в виде трофических сетей. Эти данные в виде матрицы сообщества с видами потребителей в столбцах, видами растений в строках и рангом кормовых предпочтений в ячейках, уже пригодны для расчетов вместимости, если известна масса видов растений. Таким образом, для определения вместимости используются два типа данных: данные присутствия/отсутствия видов растений в кормовых спектрах видов парнокопытных и данные о количестве (массе в тоннах на 1000 га) этих видов растений в природе.
Эта база данных позволяет непосредственно оценить ресурсное пространство копытных Дальнего Востока, то есть то множество ресурсных измерений, которое ограничено кормовыми объектами. Запас трофических ресурсов является одним из важнейших ограничителей роста плотности популяций: на участке не может быть больше особей, чем это позволяет запас корма.
Авторы и основные исполнители проекта
И.С. Шереметьев, д.б.н., с.н.с. лаб. териологии
А.А. Воронков, начальник отдела информации и компьютерных технологий
Е.В. Жабыко, к.б.н., начальник научно-организационного отдела
Вы можете связаться с нами, оставить свои комментарии и вопросы по адресу электронной почты: [email protected]
На фото косуля сибирская, автор фото О.Н. Ухваткина
Автор текста И.С. Шереметьев, д.б.н., с.н.с. лаб. териологии
#буднинауки
Сегодня пятница, а значит пришло время рубрики #буднинауки, и сегодня будет про методологию.
Итак, речь пойдет о геометрической морфометрии (ГМ). Это комплекс методов, позволяющих исследовать форму объектов, исключая влияние размерных характеристик. С помощью ГМ можно сравнивать по форме как отдельные экземпляры, так и целые выборки. ГМ применяется в самых различных областях науки: биологии, антропологии, археологии, истории архитектуры и т.п.
Первым предложил сравнивать форму объектов шотландский биолог-математик Д’Арси Вентворт Томпсон еще в 1917 г., используя трансформационную решетку (рис. 2). Современная геометрическая морфометрия соединяет метод трансформационных решеток с совокупностью алгебраических методов многомерного анализа координат меток.
В нашем Центре геометрическая морфометрия активно применяется сотрудниками лаборатории териологии для исследования формы жевательной поверхности полевок, коронок зубов и нижней челюсти землероек, как современных, так и ископаемых. В таких исследованиях целью может быть описание морфотипов, исследование географической и других видов изменчивости, диагностика ископаемых образцов и т.п.
Итак, речь пойдет о геометрической морфометрии (ГМ). Это комплекс методов, позволяющих исследовать форму объектов, исключая влияние размерных характеристик. С помощью ГМ можно сравнивать по форме как отдельные экземпляры, так и целые выборки. ГМ применяется в самых различных областях науки: биологии, антропологии, археологии, истории архитектуры и т.п.
Первым предложил сравнивать форму объектов шотландский биолог-математик Д’Арси Вентворт Томпсон еще в 1917 г., используя трансформационную решетку (рис. 2). Современная геометрическая морфометрия соединяет метод трансформационных решеток с совокупностью алгебраических методов многомерного анализа координат меток.
В нашем Центре геометрическая морфометрия активно применяется сотрудниками лаборатории териологии для исследования формы жевательной поверхности полевок, коронок зубов и нижней челюсти землероек, как современных, так и ископаемых. В таких исследованиях целью может быть описание морфотипов, исследование географической и других видов изменчивости, диагностика ископаемых образцов и т.п.
Для геометрической морфометрии используют цифровые двух- или трехмерные изображения объектов. Для описания объектов используют метки (ландмарки) или полуметки (семиландмарки), которые расставляются при помощи специального программного обеспечения (tpsDig). Метки на разных объектах должны быть гомологичны друг другу. Если на объекте нет гомологичных структур, используют полуметки. Методы геометрической морфометрии основаны на анализе координат точек в многомерном пространстве, в совокупности описывающих конфигурацию объекта.
Возможность визуализации позволяет увидеть смещение меток на разных объектах относительно друг друга (рис. 1-3) или выборок относительно усредненной формы или относительно друг друга (рис. 4).
При этом описание формы и все проведенные сравнения можно выразить математически. У каждой метки и полуметки есть свои координаты в многомерном пространстве. С помощью специализированных программ (tpsRelw, tpsUtil, tpsRelw) и дополнительных файлов получают первичные данные: консенсус и прокрустовы координаты. Их в дальнейшем можно обрабатывать с помощью стандартных статистических методов, например, анализ главных компонент (рис. 4).
Дискриминантный анализ выборок, классификацию исследуемых объектов и процент ошибочной классификации проводят обычно в MorphoJ.
#буднинауки
Авторы Омелько В.Е., к.б.н., н.с. лаб териологии, Винокурова М.А., вед. инж. лаб. териологии
Возможность визуализации позволяет увидеть смещение меток на разных объектах относительно друг друга (рис. 1-3) или выборок относительно усредненной формы или относительно друг друга (рис. 4).
При этом описание формы и все проведенные сравнения можно выразить математически. У каждой метки и полуметки есть свои координаты в многомерном пространстве. С помощью специализированных программ (tpsRelw, tpsUtil, tpsRelw) и дополнительных файлов получают первичные данные: консенсус и прокрустовы координаты. Их в дальнейшем можно обрабатывать с помощью стандартных статистических методов, например, анализ главных компонент (рис. 4).
Дискриминантный анализ выборок, классификацию исследуемых объектов и процент ошибочной классификации проводят обычно в MorphoJ.
#буднинауки
Авторы Омелько В.Е., к.б.н., н.с. лаб териологии, Винокурова М.А., вед. инж. лаб. териологии
Дорогие коллеги, после перерыва продолжаем рассказывать про оборудование.
Сегодня речь пойдет о комплексе оборудовании, которое сотрудники лаборатории почвоведения и экологии почв используют для анализа элементного состава почв и растений. Оборудование подобрано с учётом специфики массовой концентрации различных элементов в образцах.
Приборы обладают высокой чувствительностью к уровням концентрации различных элементов и позволяют без сложной пробоподготовки получать информацию об элементном составе почв и смежных с почвой объектов: растений, донных отложений, геологических проб, газопылевых потоков.
Имеющийся комплекс оборудования включает два основных прибора и вспомогательное оборудование (технические и аналитические весы, анализаторы влажности, пресс).
На фото 1 специалисты по определению элементного состава почв и растений: Яна Олеговна Тимофеева, к.б.н., в. н. с. лаборатории почвоведения и экологии почв и М.Л. Бурдуковский, к.б.н., с.н.с. лаборатории почвоведения и экологии почв
На фото 2 и 3 - подготовленные для анализа пробы
#bd_equipment
#буднинауки
Сегодня речь пойдет о комплексе оборудовании, которое сотрудники лаборатории почвоведения и экологии почв используют для анализа элементного состава почв и растений. Оборудование подобрано с учётом специфики массовой концентрации различных элементов в образцах.
Приборы обладают высокой чувствительностью к уровням концентрации различных элементов и позволяют без сложной пробоподготовки получать информацию об элементном составе почв и смежных с почвой объектов: растений, донных отложений, геологических проб, газопылевых потоков.
Имеющийся комплекс оборудования включает два основных прибора и вспомогательное оборудование (технические и аналитические весы, анализаторы влажности, пресс).
На фото 1 специалисты по определению элементного состава почв и растений: Яна Олеговна Тимофеева, к.б.н., в. н. с. лаборатории почвоведения и экологии почв и М.Л. Бурдуковский, к.б.н., с.н.с. лаборатории почвоведения и экологии почв
На фото 2 и 3 - подготовленные для анализа пробы
#bd_equipment
#буднинауки
Подробнее расскажем про два основных прибора:
1. Элементный анализатор Flash 2000 предназначен для изменения концентраций элементов определяющий уровень почвенного плодородия (азот (N), углерод (С) и водород (H)), а также содержания таких элементов в растениях, осадках и фильтратах. Прибор характеризуется высокой точностью и воспроизводимостью результатов, скорость анализа и простота использования являются наиболее важными характеристиками прибора. Принцип определения содержания элементов основан на полном сгорании опытного образца в высокотемпературной камере (900° С) и последующем сверхточном определении элементов в газообразных продуктах. Диапазон определения содержания элементов: от 1 мг/кг до 100%. Предварительная подготовка проб включает высушивание, измельчение и запаивание опытных образцов в капсулы из инертного олова.
На фото Элементный анализатор Flash 2000
#bd_equipment
#буднинауки
1. Элементный анализатор Flash 2000 предназначен для изменения концентраций элементов определяющий уровень почвенного плодородия (азот (N), углерод (С) и водород (H)), а также содержания таких элементов в растениях, осадках и фильтратах. Прибор характеризуется высокой точностью и воспроизводимостью результатов, скорость анализа и простота использования являются наиболее важными характеристиками прибора. Принцип определения содержания элементов основан на полном сгорании опытного образца в высокотемпературной камере (900° С) и последующем сверхточном определении элементов в газообразных продуктах. Диапазон определения содержания элементов: от 1 мг/кг до 100%. Предварительная подготовка проб включает высушивание, измельчение и запаивание опытных образцов в капсулы из инертного олова.
На фото Элементный анализатор Flash 2000
#bd_equipment
#буднинауки
2. Энергодисперсионный рентгенофлуоресцентный спектрометр EDX-800HS-P используется для количественного определения содержания широкого спектра элементов, относящихся к группе макро- (Si, Al, Ti, P, K, Ca, Fe, Na, Mg) и микроэлементов (Mn, Ni, Zn, Mo, V, Sr, Co, Rb, Zr, Cs), а также тяжелых металлов (Pb, Cu, Cr) в объектах окружающей среды. Принцип действия прибора основан на сборе и анализе спектра, полученного путём воздействия на исследуемый материал рентгеновского излучения. Определение концентрации элементов в почвах и растениях проводится в формате количественного анализа в вакуумной среде с использованием государственных стандартных образцов сравнения по аттестованным методикам. Основной областью применения прибора в ФНЦ Биоразнообразия является оценка загрязнения почвенного и растительного покрова и контроль качества растительной продукции. Подготовка опытных образцов состоит из цикла последовательного высушивания образцов, измельчения и прессования на специализированном прессе под давлением 10 т.
Фото 1 - Энергодисперсионный рентгенофлуоресцентный спектрометр EDX-800HS-P
Фото 2 - Спектры и количественное содержание элементов в образце почв (EDX-800HS-P)
Фото 3 - Спектр содержания серебра в образце наночастиц (EDX-800HS-P)
Автор текста Я.О. Тимофеева, к.б.н., в.н.с. лаб. почвоведения и экологии почв
#bd_equipment
#буднинауки
Фото 1 - Энергодисперсионный рентгенофлуоресцентный спектрометр EDX-800HS-P
Фото 2 - Спектры и количественное содержание элементов в образце почв (EDX-800HS-P)
Фото 3 - Спектр содержания серебра в образце наночастиц (EDX-800HS-P)
Автор текста Я.О. Тимофеева, к.б.н., в.н.с. лаб. почвоведения и экологии почв
#bd_equipment
#буднинауки
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Сегодня в рамках рубрики #буднинауки расскажем о работе с эталонной остеологической коллекцией.
Сотрудники лаборатории териологии ФНЦ занимаются в том числе аспектами исторической териологии и исследуют костные остатки млекопитающих из природных пещерных отложений и археологических памятников. Это позволяет выяснить, кто обитал на Дальнем Востоке в прошлом, а также роль древнего человека в преобразовании экосистем.
Чтобы определить найденные зубы, кости и фрагменты костей (которые попадаются существенно чаще) можно использовать определители и атласы, но обычно их не достаточно и для достоверной диагностики видов требуется сравнение с целыми костями современных животных, чью видовую принадлежность мы точно знаем.
Для этого у нас есть эталонная коллекция современных млекопитающих (как крупных, так и мелких, как диких, так и домашних), которая включает в себя скелеты более 70 видов современных животных, среди них насекомоядные, рукокрылые, зайцеобразные грызуны, хищные, парнокопытные и непарнокопытные. Мы стараемся пополнять коллекцию недостающими видами и элементами скелета. Чем полнее коллекция, тем больше у нас возможностей определить найденные кости и их фрагменты.
Съемка и монтаж видео В.М. Казарин, вед. лаборант лаб. клеточной биологии и биологии развития
Текст В.Е. Омелько, к.б.н., с.н.с. лаб. териологии
Сотрудники лаборатории териологии ФНЦ занимаются в том числе аспектами исторической териологии и исследуют костные остатки млекопитающих из природных пещерных отложений и археологических памятников. Это позволяет выяснить, кто обитал на Дальнем Востоке в прошлом, а также роль древнего человека в преобразовании экосистем.
Чтобы определить найденные зубы, кости и фрагменты костей (которые попадаются существенно чаще) можно использовать определители и атласы, но обычно их не достаточно и для достоверной диагностики видов требуется сравнение с целыми костями современных животных, чью видовую принадлежность мы точно знаем.
Для этого у нас есть эталонная коллекция современных млекопитающих (как крупных, так и мелких, как диких, так и домашних), которая включает в себя скелеты более 70 видов современных животных, среди них насекомоядные, рукокрылые, зайцеобразные грызуны, хищные, парнокопытные и непарнокопытные. Мы стараемся пополнять коллекцию недостающими видами и элементами скелета. Чем полнее коллекция, тем больше у нас возможностей определить найденные кости и их фрагменты.
Съемка и монтаж видео В.М. Казарин, вед. лаборант лаб. клеточной биологии и биологии развития
Текст В.Е. Омелько, к.б.н., с.н.с. лаб. териологии
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Для создания Российской системы климатического мониторинга (ВИП ГЗ) и задач консорциума «РИТМ углерода» пополняется приборная база лабораторного и полевого оборудования.
Сегодня мы рассказываем о метеостанции, установленной в октябре этого года в рамках Проекта на территории Верхнеуссурийского стационара ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН.
Метеостанция позволяет выполнять мониторинговые наблюдения за температурой воздуха, влажностью воздуха, фотосинтетическиактивной радиацией (ФАР)*, скоростью и направлением ветра, температурой и влажностью верхнего слоя почвы.
Метеостанция рассчитана на круглогодичную работу в автономном режиме. Питание происходит от солнечных батарей.
Благодаря постоянной работе метеостанций на территории Верхнеуссурийского стационара ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН в распоряжении ученых имеются данные об основных климатических показателях, начиная с 1973 г.
Подробнее в видео.
Видео и закадровый голос: О.Н. Ухваткина
Монтаж и музыка: В.М. Казарин
*ФАР - фотосинтетически активная радиация - часть спектра солнечного освещения, улавливаемая растениями в процессе фотосинтеза
📱 ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
#bd_field
#bd_equipment
#буднинауки
#исследование_РИТМуглерода
Сегодня мы рассказываем о метеостанции, установленной в октябре этого года в рамках Проекта на территории Верхнеуссурийского стационара ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН.
Метеостанция позволяет выполнять мониторинговые наблюдения за температурой воздуха, влажностью воздуха, фотосинтетическиактивной радиацией (ФАР)*, скоростью и направлением ветра, температурой и влажностью верхнего слоя почвы.
Метеостанция рассчитана на круглогодичную работу в автономном режиме. Питание происходит от солнечных батарей.
Благодаря постоянной работе метеостанций на территории Верхнеуссурийского стационара ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН в распоряжении ученых имеются данные об основных климатических показателях, начиная с 1973 г.
Подробнее в видео.
Видео и закадровый голос: О.Н. Ухваткина
Монтаж и музыка: В.М. Казарин
*ФАР - фотосинтетически активная радиация - часть спектра солнечного освещения, улавливаемая растениями в процессе фотосинтеза
#bd_field
#bd_equipment
#буднинауки
#исследование_РИТМуглерода
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Продолжаем рубрику #bd_katalog. Сегодня напомним, о каком оборудовании Центра мы уже рассказали, а также о методах, используемых нашими исследователями.
1. Сканирующий электронный микроскоп Мерлин (SEM MERLIN ZEISS)🔬
2. Тандемный времяпролетный масс-спектрометр Autoflex Speed Bruker 🖱
3. Комплекс для дендрохронологических измерений и мини-урок по сбору дендрохронологических образцов и их первичной обработке🪵
4. Хроматограф Agilent 126🌈
5. Криостат CryoStar NX70🥶
6. Стерео микроскоп SteREO Discovery.V12🔬
7. Секвенирование ДНК и комплекс оборудования, необходимый для этого - генетический анализатор (секвенатор) Applied Biosystems 3500 и амплификатор BIO-RAD T100 🧬
8. Элементный анализатор Flash 2000⚛️
9. Энергодисперсионный рентгенофлуоресцентный спектрометр EDX-800HS-P🩻
10. Метеостанция, установленная на территории ВУС ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН🌦
11. Методы геометрической морфометрии 🔲
12. Эталонная остеологическая коллекция, как инструмент определения ископаемых и полуископаемых костей животных🦴
13. Открытая база данных «Определитель вместимости среды обитания копытных животных Дальнего Востока»🦌
*Если хотите присоединиться к рубрике #буднинауки - пишите, мы опубликуем информацию о приборах и методах, которые Вы используете в своей работе
#bd_equipment
#буднинауки
📱 ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
1. Сканирующий электронный микроскоп Мерлин (SEM MERLIN ZEISS)
2. Тандемный времяпролетный масс-спектрометр Autoflex Speed Bruker 🖱
3. Комплекс для дендрохронологических измерений и мини-урок по сбору дендрохронологических образцов и их первичной обработке
4. Хроматограф Agilent 126
5. Криостат CryoStar NX70
6. Стерео микроскоп SteREO Discovery.V12
7. Секвенирование ДНК и комплекс оборудования, необходимый для этого - генетический анализатор (секвенатор) Applied Biosystems 3500 и амплификатор BIO-RAD T100 🧬
8. Элементный анализатор Flash 2000
9. Энергодисперсионный рентгенофлуоресцентный спектрометр EDX-800HS-P
10. Метеостанция, установленная на территории ВУС ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
11. Методы геометрической морфометрии 🔲
12. Эталонная остеологическая коллекция, как инструмент определения ископаемых и полуископаемых костей животных
13. Открытая база данных «Определитель вместимости среды обитания копытных животных Дальнего Востока»
*Если хотите присоединиться к рубрике #буднинауки - пишите, мы опубликуем информацию о приборах и методах, которые Вы используете в своей работе
#bd_equipment
#буднинауки
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Добрый день!
Мы продолжаем рубрику #буднинауки, где рассказываем про оборудование и про методы, которыми пользуются сотрудники нашего Центра в своей работе.
Сегодня наш специалист-хироптеролог Ульяна Горобейко, кандидат биологических наук, расскажет, как она с коллегами ловит летучих мышей и что с ними делает дальше.
Как поймать летучую мышь🦇 ?
Проще всего, конечно, подгадать момент, пока мышь спит в дневном убежище, – и взять ее тепленькой (или холодненькой, если дело происходит на зимовке).
Однако чаще всего ее убежище так просто не найдешь и летучую мышь из него не достанешь... Например, если она затаилась в дупле или трещине в скале на высоте 5-10 метров. Поэтому специалисты-хироптерологи летом переходят на ночной образ жизни и отлавливают рукокрылых паутинными сетями.
Паутинные сети не зря так называются, они сделаны из очень тонких нитей, толщиной с волос (из монофиламента или капрона), с ячеёй 16-18 мм. Длина и высота сети бывают различными, но чаще всего используются сети 4-10 м на 2,5-4,5 м. Способы установки также бывают различными, однако удобней всего растягивать их на телескопических маховых удилищах длиной 5-7 м, закрепляя несколькими растяжками.
Рабочая высота сетей напрямую зависит от размера хироптеролога: если вам досталась компактная версия ученого, дополнительно потребуется табуреточка, либо тщательно подобранные удилища с коленами небольшой длины.
По сути дела, методика отлова почти такая же, как у орнитологов, только в ночную смену.
Где установить сеть?
Устанавливаются сети на предполагаемых местах пролета летучих мышей – к местам водопоя, кормовым стациям, на вылет из убежища. То есть, буквально: если хочешь поймать летучую мышь, ты должен думать как летучая мышь. Дело в том, что даже самую тонкую сеть мышь способна «услышать» ультразвуком, красиво увернуться и облететь ее. К счастью для хироптерологов, пролетая по знакомому маршруту, мышки обычно менее внимательны и чаще натыкаются на неожиданные препятствия в виде сети. Хотя место, где стояла сеть, летучая мышь почти наверняка запомнит, и следующей ночью уже в неё не попадется.
Как показывает практика, наиболее «уловистыми» оказываются сети, протянутые над неглубокими и неширокими лесными реками, через лесные дороги, у входов в гроты, пещеры или заброшенные постройки. Пик активности мышей приходится на вечерний вылет от заката до полуночи, однако правильней и продуктивней ловить всю ночь – от заката до рассвета.
📱 ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
Мы продолжаем рубрику #буднинауки, где рассказываем про оборудование и про методы, которыми пользуются сотрудники нашего Центра в своей работе.
Сегодня наш специалист-хироптеролог Ульяна Горобейко, кандидат биологических наук, расскажет, как она с коллегами ловит летучих мышей и что с ними делает дальше.
Как поймать летучую мышь
Проще всего, конечно, подгадать момент, пока мышь спит в дневном убежище, – и взять ее тепленькой (или холодненькой, если дело происходит на зимовке).
Однако чаще всего ее убежище так просто не найдешь и летучую мышь из него не достанешь... Например, если она затаилась в дупле или трещине в скале на высоте 5-10 метров. Поэтому специалисты-хироптерологи летом переходят на ночной образ жизни и отлавливают рукокрылых паутинными сетями.
Паутинные сети не зря так называются, они сделаны из очень тонких нитей, толщиной с волос (из монофиламента или капрона), с ячеёй 16-18 мм. Длина и высота сети бывают различными, но чаще всего используются сети 4-10 м на 2,5-4,5 м. Способы установки также бывают различными, однако удобней всего растягивать их на телескопических маховых удилищах длиной 5-7 м, закрепляя несколькими растяжками.
Рабочая высота сетей напрямую зависит от размера хироптеролога: если вам досталась компактная версия ученого, дополнительно потребуется табуреточка, либо тщательно подобранные удилища с коленами небольшой длины.
По сути дела, методика отлова почти такая же, как у орнитологов, только в ночную смену.
Где установить сеть?
Устанавливаются сети на предполагаемых местах пролета летучих мышей – к местам водопоя, кормовым стациям, на вылет из убежища. То есть, буквально: если хочешь поймать летучую мышь, ты должен думать как летучая мышь. Дело в том, что даже самую тонкую сеть мышь способна «услышать» ультразвуком, красиво увернуться и облететь ее. К счастью для хироптерологов, пролетая по знакомому маршруту, мышки обычно менее внимательны и чаще натыкаются на неожиданные препятствия в виде сети. Хотя место, где стояла сеть, летучая мышь почти наверняка запомнит, и следующей ночью уже в неё не попадется.
Как показывает практика, наиболее «уловистыми» оказываются сети, протянутые над неглубокими и неширокими лесными реками, через лесные дороги, у входов в гроты, пещеры или заброшенные постройки. Пик активности мышей приходится на вечерний вылет от заката до полуночи, однако правильней и продуктивней ловить всю ночь – от заката до рассвета.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Что дальше?
И вот, хироптерологам улыбнулась удача, и летучая мышь попала в руки исследователей. Что теперь её ожидает? Во-первых, сразу после выпутывания из сети мышь поместят в стерильный тканевой мешочек-отсадник («мышочек»), и уже в спокойной обстановке произведут тщательный осмотр (на видео 1 - мышь только достали из мышочка) на предмет видовой идентификации, определения пола, возраста – а у самок еще и уточнят подробности личной жизни (рожала? кормила? беременная?). Мышь взвесят (фото 5) и промерят штангенциркулем предплечье (видео 4), а в некоторых случаях и голень. Свежий помет из «мышочка» отправится в пробирке в жидкий азот (видео 8) – на вирусологический анализ. Биопсия крыловой перепонки (фото 2) и эктопаразиты, если таковые обнаружатся на мышке, будут собраны в пробирку с 96% спиртом (фото 3).
📱 ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
#буднинауки
И вот, хироптерологам улыбнулась удача, и летучая мышь попала в руки исследователей. Что теперь её ожидает? Во-первых, сразу после выпутывания из сети мышь поместят в стерильный тканевой мешочек-отсадник («мышочек»), и уже в спокойной обстановке произведут тщательный осмотр (на видео 1 - мышь только достали из мышочка) на предмет видовой идентификации, определения пола, возраста – а у самок еще и уточнят подробности личной жизни (рожала? кормила? беременная?). Мышь взвесят (фото 5) и промерят штангенциркулем предплечье (видео 4), а в некоторых случаях и голень. Свежий помет из «мышочка» отправится в пробирке в жидкий азот (видео 8) – на вирусологический анализ. Биопсия крыловой перепонки (фото 2) и эктопаразиты, если таковые обнаружатся на мышке, будут собраны в пробирку с 96% спиртом (фото 3).
#буднинауки
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
И после всех проведенных манипуляций, целая и невредимая летучая мышь будет благополучно выпущена этой же или следующей ночью в месте поимки. В светлое время суток выпуск мыши возможен только в исключительных случаях, поскольку зверьки при ярком свете совершенно беспомощны и дезориентированы.
Автор текста У.В. Горобейко, к.б.н., с.н.с. лаб. эволюционной зоологии и генетики
Фотографии и видео из архива У.В. Горобейко
Монтаж и музыка - В. Казарин
📱 ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
#буднинауки
Автор текста У.В. Горобейко, к.б.н., с.н.с. лаб. эволюционной зоологии и генетики
Фотографии и видео из архива У.В. Горобейко
Монтаж и музыка - В. Казарин
#буднинауки
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
"Среда" в четверг
Сотрудники сектора микроклонального размножения готовят и разливают питательные среды для культивирования микрорастений🙂
#буднинауки
Сотрудники сектора микроклонального размножения готовят и разливают питательные среды для культивирования микрорастений
#буднинауки
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Талантливый человек талантлив во всем!
А иногда в нашем Центре #буднинауки проходят и так 👆🏻✨ Играет на гитаре Дмитрий Матвеевич Атопкин (лаб. паразитологии), разбирает пробы Лидия Сергеевна Яковченко (лаб. ботаники).
А как проходят ваши рабочие будни? Делитесь в комментариях!
Хорошего окончания недели!❤️
📽️ "Подсматривала" за процессом и наслаждалась вживую Н.В. Бухарова
📱 ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
А иногда в нашем Центре #буднинауки проходят и так 👆🏻
А как проходят ваши рабочие будни? Делитесь в комментариях!
Хорошего окончания недели!
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
С добрым утром! ⏰
Настала суббота и самое время прогуляться по снежном лесу🫶 .
Наша прогулка проходит по территории Верхнеуссурийского стационара ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН.
Такой белый снег🐻❄️ ❄️ и зимний приятный морозец 👍 трудно найти ещё где-нибудь.
А при прогулке можно заметить следы косули🦌 , кабана 🐗 и, иногда, полосатого хозяина тайги 🐅 (в видео не попали).
Бодрости вам и отличных выходных!
📽️ Гулял по лесу с камерой и заодно проводил измерения в рамках проекта "РИТМ Углерода" А.В. Куприн
🎞 Монтаж и музыка: В.М. Казарин
📱 ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
#исследование_РИТМуглерода
#буднинауки
#bd_field
Настала суббота и самое время прогуляться по снежном лесу
Наша прогулка проходит по территории Верхнеуссурийского стационара ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН.
Такой белый снег
А при прогулке можно заметить следы косули
Бодрости вам и отличных выходных!
#исследование_РИТМуглерода
#буднинауки
#bd_field
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Дорогие коллеги,
Делимся с вами впечатлениями вчерашнего дня❤️ !
Подарочки для тех, кто создавал удивительные елочки, подарочки для активистов Канала, подарочки "Тайных Дедушек Морозов" - всё это сложилось в удивительно праздничную, чудесную и волшебную атмосферу.
Добра вам и уюта в эти дни и всегда!
📸 Фото: Валерий Локтионов, Виталий Казарин
🎞 Монтаж, музыка: Ольга Ухваткина
📱 ФНЦ Биоразнообразия ДВО РАН
#буднинауки #bd_event
Делимся с вами впечатлениями вчерашнего дня
Подарочки для тех, кто создавал удивительные елочки, подарочки для активистов Канала, подарочки "Тайных Дедушек Морозов" - всё это сложилось в удивительно праздничную, чудесную и волшебную атмосферу.
Добра вам и уюта в эти дни и всегда!
#буднинауки #bd_event
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM