#SARSCoV2 #ингибиторыРНК #news

Ученые нацелились на ахиллесову пяту РНК вируса SARS-CoV-2.

Когда SARS-CoV-2 инфицирует клетку, он внедряет свою РНК и репрограммирует клетку таким образом, что она начинает производить вирусные белки, а после и целые вирусные частицы. В поисках активных соединений против этого коронавируса ученые в основном фокусировались на вирусных белках и способах их блокирования, видя в этом путь к предупреждению или хотя бы замедлению репликации вирусных частиц. Но оказалось, что привести к остановке или замедлению репликации может также атака на вирусный геном, длинную молекулу РНК.

Исследователи из германского консорциума COVID-19-NMR, работу которого координирует профессор Харальд Швальбе из Института органической химии и химической биологии при Франкфуртском университете имени Иоганна Вольфганга Гёте завершили важный первый этап в создании нового класса таких лекарств против SARS-CoV-2. Они выявили в геноме SARS-CoV-2 15 коротких сегментов, очень сходных у разных коронавирусов и, насколько известно, выполняющих важные регуляторные функции. В течение всего 2020 года эти сегменты почти не затрагивались мутациями.

Имея библиотеку из 768 малых, химически простых молекул, они решили запустить их во взаимодействие с 15 сегментами РНК и проанализировать результаты возможных реакций с помощью ЯМР-спектроскопии. При таком анализе молекулы сначала метят стабильными изотопами и затем помещают в сильное магнитное поле. Атомное ядро возбуждается импульсами коротких радиочастот и излучает частотный спектр, благодаря которому можно определить структуру РНК и белка, а также способ и место прикрепления к ним малых молекул.

Таким образом, профессор Швальбе с коллегами идентифицировали 69 малых молекул, которые связываются с 13 из 15 сегментов РНК, и продемонстрировали, что РНК вируса SARS-CoV-2 очень подходит для того, чтобы быть потенциальной структурой-мишенью для лекарств. Учитывая большое количество мутаций в SARS-CoV-2, консервативные сегменты РНК, подобные идентифицированным франкфуртскими учеными, представляют особый интерес для создателей потенциальных ингибиторов вируса.

«Поскольку вирусная РНК составляет около двух третей всей РНК в пораженной клетке, используя подходящие молекулы мы сможем прервать репликацию вируса в значительной степени», говорит Швальбе. В сообщении Университета Гете он также отмечает, что его группа уже начала испытания с доступными соединениями, которые химически близки к тем из библиотеки соединений, что связываются с консервативными сегментами РНК.