#омикрон #происхождение #версии #news
Для объяснения происхождения омикрона ученые выдвинули три альтернативные версии.
Чрезвычайно быстро распространяющийся вариант коронавируса SARS-CoV-2 под названием омикрон снабжен непредвиденным набором мутаций, и у специалистов нет ясного представления о предшественниках этого варианта. По оценкам эволюционных вирусологов его ближайший из известных генетический предок мог возникнуть приблизительно в середине 2020-го. Происхождению омикрона была посвящена январская встреча созданной недавно Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) Научной консультативной группы по изучению происхождения новых патогенов (Scientific Advisory Group for the Origins of Novel Pathogens), SAGO, которая должна опубликовать свой доклад в начале февраля.
В ожидании этого Nature News публикует мнения ученых о трех основных теориях природы омикрона. Вопрос о происхождении омикрона представляет не только научный интерес. Выяснение условий, породивших этот высокозаразный вариант, позволит оценить риск возникновения новых подобных вариантов и предложить меры для его минимизации. Одна из рассматриваемых версий предполагает, что, несмотря на миллионы прочитанных геномов вируса SARS-CoV-2, серии мутаций, приведшие к омикрону, могли быть просто упущены, причем то, что его выявили в Южной Африке, еще не означает, что возник он именно там, считают специалисты. В этом варианте по сравнению с оригинальным уханьским SARS-CoV-2 более 50 новых мутаций, 30 из которых – в белке шипа. Более десятка мутаций чрезвычайно редкие и некоторые из них быстро исчезли, очевидно, из-за своей вредности для вируса.
Еще одна генетическая особенность омикрона – он состоит из трех подлиний, BA.1, BA.2 и BA.3, возникших приблизительно одновременно. По мнению одних ученых накопление большого количества омикронных мутаций всего за полтора года не могло произойти так же постепенно, при передаче от человека к человеку, как накапливались немногочисленные мутации в прежних вариантах. Другие считают, что накопление происходило незаметно в отдаленном уголке мира, где плохо с генетическим секвенированием и людей тестировали мало, возможно, потому что они болели бессимптомно. Альтернативное объяснение заключается в накоплении мутаций у одного человека с долговременной инфекцией коронавирусом на фоне ослабленной иммунной системы. По выражению биоинформатика Сергея Понда (Sergei Pond) из Университета Темпл (Temple University) в Пенсильвании, такой организм позволяет вирусу «играть с иммунной системой в кошки-мышки». Или же омикрон возник незаметно в организме каких-то животных, таких как мыши или крысы.
Для объяснения происхождения омикрона ученые выдвинули три альтернативные версии.
Чрезвычайно быстро распространяющийся вариант коронавируса SARS-CoV-2 под названием омикрон снабжен непредвиденным набором мутаций, и у специалистов нет ясного представления о предшественниках этого варианта. По оценкам эволюционных вирусологов его ближайший из известных генетический предок мог возникнуть приблизительно в середине 2020-го. Происхождению омикрона была посвящена январская встреча созданной недавно Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) Научной консультативной группы по изучению происхождения новых патогенов (Scientific Advisory Group for the Origins of Novel Pathogens), SAGO, которая должна опубликовать свой доклад в начале февраля.
В ожидании этого Nature News публикует мнения ученых о трех основных теориях природы омикрона. Вопрос о происхождении омикрона представляет не только научный интерес. Выяснение условий, породивших этот высокозаразный вариант, позволит оценить риск возникновения новых подобных вариантов и предложить меры для его минимизации. Одна из рассматриваемых версий предполагает, что, несмотря на миллионы прочитанных геномов вируса SARS-CoV-2, серии мутаций, приведшие к омикрону, могли быть просто упущены, причем то, что его выявили в Южной Африке, еще не означает, что возник он именно там, считают специалисты. В этом варианте по сравнению с оригинальным уханьским SARS-CoV-2 более 50 новых мутаций, 30 из которых – в белке шипа. Более десятка мутаций чрезвычайно редкие и некоторые из них быстро исчезли, очевидно, из-за своей вредности для вируса.
Еще одна генетическая особенность омикрона – он состоит из трех подлиний, BA.1, BA.2 и BA.3, возникших приблизительно одновременно. По мнению одних ученых накопление большого количества омикронных мутаций всего за полтора года не могло произойти так же постепенно, при передаче от человека к человеку, как накапливались немногочисленные мутации в прежних вариантах. Другие считают, что накопление происходило незаметно в отдаленном уголке мира, где плохо с генетическим секвенированием и людей тестировали мало, возможно, потому что они болели бессимптомно. Альтернативное объяснение заключается в накоплении мутаций у одного человека с долговременной инфекцией коронавирусом на фоне ослабленной иммунной системы. По выражению биоинформатика Сергея Понда (Sergei Pond) из Университета Темпл (Temple University) в Пенсильвании, такой организм позволяет вирусу «играть с иммунной системой в кошки-мышки». Или же омикрон возник незаметно в организме каких-то животных, таких как мыши или крысы.
Nature
Where did Omicron come from? Three key theories
Nature - The highly transmissible variant emerged with a host of unusual mutations. Now scientists are trying to work out how it evolved.