#SARSCoV2 #news
Новое исследование подтвердило носительство коронавирусов, близкородственных SARS-CoV-2, у летучих мышей и панголинов Юго-Восточной Азии.
В то время как миссия Всемирной организации здравоохранения в Ухане продолжает исследовать происхождение и начало распространения вируса SARS-CoV-2, ученые объединенного медицинского факультета американского Университета Дьюка и Национального университета Сингапура (Duke-NUS Medical School), а также Университета Чулалонгкорна (Chulalongkorn University) в Таиланде получили данные, свидетельствующие о циркуляции родственных SARS-CoV-2 коронавирусов (SC2r-CoVs) среди восточно-азиатских животных.
Статья об этом опубликована в Nature Communications и в ней авторы сообщают о высоком уровне нейтрализующих вирус антител в организме как летучих мышей, так и покрытых чешуей млекопитающих – панголинов, что предполагает большую вероятность обнаружения здесь и самого вируса. Юго-Восточная Азия с ее большими и разнообразными популяциями летучих мышей - ожидаемый природный очаг таких вирусов, отмечает издание MedicalXpress.
Авторы исследования обнаружили способность антител из сыворотки крови животных нейтрализовать суррогатный вирус SARS-CoV-2 в лабораторных условиях. Образцы крови брали в колонии летучих мышей-обитателей таиландской пещеры, и у дико живущих на юге страны панголинов.
«Наше исследование расширило географическое распространение генетически разнообразных коронавирусов, родственных SARS-CoV-2, на 4800 км - от Японии и Китая до Таиланда. Чтобы обнаружить ближайшего предшественника этого вируса необходим строгий трансграничный надзор», — говорит один из авторов исследования доктор Че Ва Тан (Chee Wah Tan) из Сингапура.
Одобренный Управлением по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами США (FDA) в ускоренном порядке тест на способность антител нейтрализовать суррогатный вирус SARS-CoV-2 был разработан учеными Университета Дьюка и их коллегами в Сингапуре в основном для оценки по сыворотке крови человека эффективности вакцин и выявления перенесенных инфекций, но он может быть использован и для отслеживания вирусов животного происхождения, а также случаев их межвидового перехода, отмечают исследователи.
«Работы, подобные этой, чрезвычайно важны для оценки многих SARS-CoV-2-подобных вирусов в дикой природе, и эта работа также своевременна в контексте выяснения происхождения вируса, вызвавшего пандемию. Такие исследования помогают лучше подготовиться к будущим пандемиям, потому что дают детальную карту природно-очаговых угроз», — отмечает заместитель декана американо-сингапурского факультета Патрик Кейси (Patrick Casey).
Новое исследование подтвердило носительство коронавирусов, близкородственных SARS-CoV-2, у летучих мышей и панголинов Юго-Восточной Азии.
В то время как миссия Всемирной организации здравоохранения в Ухане продолжает исследовать происхождение и начало распространения вируса SARS-CoV-2, ученые объединенного медицинского факультета американского Университета Дьюка и Национального университета Сингапура (Duke-NUS Medical School), а также Университета Чулалонгкорна (Chulalongkorn University) в Таиланде получили данные, свидетельствующие о циркуляции родственных SARS-CoV-2 коронавирусов (SC2r-CoVs) среди восточно-азиатских животных.
Статья об этом опубликована в Nature Communications и в ней авторы сообщают о высоком уровне нейтрализующих вирус антител в организме как летучих мышей, так и покрытых чешуей млекопитающих – панголинов, что предполагает большую вероятность обнаружения здесь и самого вируса. Юго-Восточная Азия с ее большими и разнообразными популяциями летучих мышей - ожидаемый природный очаг таких вирусов, отмечает издание MedicalXpress.
Авторы исследования обнаружили способность антител из сыворотки крови животных нейтрализовать суррогатный вирус SARS-CoV-2 в лабораторных условиях. Образцы крови брали в колонии летучих мышей-обитателей таиландской пещеры, и у дико живущих на юге страны панголинов.
«Наше исследование расширило географическое распространение генетически разнообразных коронавирусов, родственных SARS-CoV-2, на 4800 км - от Японии и Китая до Таиланда. Чтобы обнаружить ближайшего предшественника этого вируса необходим строгий трансграничный надзор», — говорит один из авторов исследования доктор Че Ва Тан (Chee Wah Tan) из Сингапура.
Одобренный Управлением по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами США (FDA) в ускоренном порядке тест на способность антител нейтрализовать суррогатный вирус SARS-CoV-2 был разработан учеными Университета Дьюка и их коллегами в Сингапуре в основном для оценки по сыворотке крови человека эффективности вакцин и выявления перенесенных инфекций, но он может быть использован и для отслеживания вирусов животного происхождения, а также случаев их межвидового перехода, отмечают исследователи.
«Работы, подобные этой, чрезвычайно важны для оценки многих SARS-CoV-2-подобных вирусов в дикой природе, и эта работа также своевременна в контексте выяснения происхождения вируса, вызвавшего пандемию. Такие исследования помогают лучше подготовиться к будущим пандемиям, потому что дают детальную карту природно-очаговых угроз», — отмечает заместитель декана американо-сингапурского факультета Патрик Кейси (Patrick Casey).
Medicalxpress
Bats and pangolins in Southeast Asia harbor SARS-CoV-2-related coronaviruses, reveals new study
While the World Health Organization (WHO) continues its mission to Wuhan investigating the origin and early transmission of SARS-CoV-2, a new study led by scientists from Duke-NUS Medical School, Singapore, ...
#SARSCoV2 #зоонозы #news
Открытый недавно коронавирус летучих мышей идентичен SARS-CoV-2 на 94,5%.
Ученые из Китая и Австралии сообщили об открытии новых коронавирусов летучих мышей, что дополняет картину разнообразия и сложной эволюционной истории этих вирусов, пишет News-Medical.net. Вэй-Фэн Ши (Weifeng Shi) из Шандуньского первого медицинского университета и Шаньдуньской академии медицинских наук (Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences) в китайском городе Тайань и его соавторы провели мета-транскриптомный анализ, то есть анализ активных генов, в образцах, собранных у двух десятков видов летучих мышей.
«Наше исследование подчеркнуло поразительное разнообразие вирусов летучих мышей в местных масштабах, а также выявило циркуляцию родственных вирусам SARS-CoV-2 and SARS-CoV штаммов в дикой природе обширного географического региона юго-восточной Азии и юга Китая», говорят ученые.
Результаты исследования представлены на сервере препринтов bioRxiv. Летучие мыши – носители широкого спектра вирусов, вызывающих тяжелые заболевания человека, в числе которых, кроме COVID-19, энцефалит Хендра и лихорадка Эбола. Четыре из семи известных поражающих человека коронавирусов – природно-очаговые. К ним относится вирус SARS-CoV, который вызвал вспышки тяжелых респираторных заболеваний 2002 и 2012 годов. И хотя летучие мыши наиболее вероятные источники этих коронавирусов, возникновение инфекции у людей может происходить с участием промежуточного хозяина, например маленьких тропических хищников-млекопитающих цивет или верблюдов-дромадеров.
В новом исследовании разнообразия, экологии и эволюции вирусов летучих мышей Ши с коллегами проанализировали совокупность транскриптов, то есть всех РНК, образующихся при считывании генетической информации и свидетельствующих об активности генов, в 411 образцах, собранных у 23 видов летучих мышей на одном гектаре в провинции Юньнань с мая 2019 по ноябрь 2020 года.
Из полученных данных авторы собрали 24 полных новых коронавирусных генома, включая четыре генома родственных SARS-CoV-2 и три близких SARS-CoV. Генетическая последовательность одного из ранее неизвестных коронавирусов летучих мышей – он обозначен RpYN06 – совпадает с SARS-CoV-2 на 94,5% по всей длине, а по нескольким отдельным генам новый вирус – ближайший к SARS-CoV-2 среди идентифицированных до сих пор. Но ни один из этих генов не имеет отношения к последовательности ключевого спайкового белка, посредством которого вирус инфицирует клетки хозяйского организма.
Открытый недавно коронавирус летучих мышей идентичен SARS-CoV-2 на 94,5%.
Ученые из Китая и Австралии сообщили об открытии новых коронавирусов летучих мышей, что дополняет картину разнообразия и сложной эволюционной истории этих вирусов, пишет News-Medical.net. Вэй-Фэн Ши (Weifeng Shi) из Шандуньского первого медицинского университета и Шаньдуньской академии медицинских наук (Shandong First Medical University & Shandong Academy of Medical Sciences) в китайском городе Тайань и его соавторы провели мета-транскриптомный анализ, то есть анализ активных генов, в образцах, собранных у двух десятков видов летучих мышей.
«Наше исследование подчеркнуло поразительное разнообразие вирусов летучих мышей в местных масштабах, а также выявило циркуляцию родственных вирусам SARS-CoV-2 and SARS-CoV штаммов в дикой природе обширного географического региона юго-восточной Азии и юга Китая», говорят ученые.
Результаты исследования представлены на сервере препринтов bioRxiv. Летучие мыши – носители широкого спектра вирусов, вызывающих тяжелые заболевания человека, в числе которых, кроме COVID-19, энцефалит Хендра и лихорадка Эбола. Четыре из семи известных поражающих человека коронавирусов – природно-очаговые. К ним относится вирус SARS-CoV, который вызвал вспышки тяжелых респираторных заболеваний 2002 и 2012 годов. И хотя летучие мыши наиболее вероятные источники этих коронавирусов, возникновение инфекции у людей может происходить с участием промежуточного хозяина, например маленьких тропических хищников-млекопитающих цивет или верблюдов-дромадеров.
В новом исследовании разнообразия, экологии и эволюции вирусов летучих мышей Ши с коллегами проанализировали совокупность транскриптов, то есть всех РНК, образующихся при считывании генетической информации и свидетельствующих об активности генов, в 411 образцах, собранных у 23 видов летучих мышей на одном гектаре в провинции Юньнань с мая 2019 по ноябрь 2020 года.
Из полученных данных авторы собрали 24 полных новых коронавирусных генома, включая четыре генома родственных SARS-CoV-2 и три близких SARS-CoV. Генетическая последовательность одного из ранее неизвестных коронавирусов летучих мышей – он обозначен RpYN06 – совпадает с SARS-CoV-2 на 94,5% по всей длине, а по нескольким отдельным генам новый вирус – ближайший к SARS-CoV-2 среди идентифицированных до сих пор. Но ни один из этих генов не имеет отношения к последовательности ключевого спайкового белка, посредством которого вирус инфицирует клетки хозяйского организма.
News-Medical.net
Newly-discovered bat coronavirus 94.5% identical to SARS-CoV-2
Researchers in China and Australia have reported the discovery of novel bat coronaviruses that further reveal the diversity and complex evolutionary history of these viruses.
#SARSCoV2 #слюнныежелезы #COVID-19 #news
Новый коронавирус поражает клетки ротовой полости.
С самого начала изучения заболевания COVID-19 стало ясно, что вызывающий его вирус SARS-CoV-2 в первую очередь инфицирует верхние дыхательные пути и легкие.
В то же время были указания и на то, что этот вирус проникает в клетки других частей организма, таких как желудочно-кишечный тракт, кровеносные сосуды и почки.
Новое исследование дополнило этот ряд ротовой полостью, а точнее – слюнными железами. Способностью вируса инфицировать множество мест в нашем теле можно объяснить широкий диапазон симптомов, испытываемых пациентами с COVID-19, включая связанные с ротовой полостью. Это потеря вкусовых ощущений, сухость и высыпания во рту. Более того, новое исследование не исключает, что именно ротовая полость играет ключевую роль в передаче вируса SARS-CoV-2 в легкие или пищеварительную систему через слюну, содержащую вирус, попавший в нее из инфицированных клеток ротовой полости.
Новые данные, опубликованные в журнале Nature Medicine, могут способствовать выработке стратегий снижения вирусной передачи внутри организма и вне его. Исследование проведено международной группой авторов под эгидой Национальных институтов здоровья США (National Institutes of Health, NIH). Ученым уже было известно, что слюна людей с COVID-19 может содержать высокий уровень SARS-CoV-2, и многие исследования предполагали, что для диагностирования заболевания слюнные тесты почти так же надежны, как анализ мазка из носовой полости. Но было не вполне ясно, откуда коронавирус попадает в слюну. У людей с респираторными симптомами он мог попасть из носовой слизи или мокроты, выкашливаемой из легких. Но для вируса в слюне бессимптомных больных объяснения не было.
«Исходя из данных наших лабораторий мы подозревали, что по крайней мере какое-то количество вируса в слюне может быть из инфицированных тканей самой ротовой полости», приводит слова Блейка Уорнера (Blake M. Warner) из NIH документ, распространенный американским агентством медицинских исследований. Для проверки этого предположения ученые обследовали ткани ротовой полости здоровых людей, чтобы выявить среди них подверженные инфекции SARS-CoV-2. Уязвимые клетки содержали РНК, «инструкции» для производства белков, которые необходимы вирусу для проникновения в клетки. РНК для двух ключевых белков – рецептора ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2 receptor) и фермента трансмембранной сериновой протеазы 2 (TMPRSS2) – нашли в определенных клетках слюнных желёз и тканей, выстилающих ротовую полость. Продолжив исследование, авторы обнаружили РНК, характерную для SARS-CoV-2, в образцах слюнных желёз пациентов, умерших от COVID-19.
Новый коронавирус поражает клетки ротовой полости.
С самого начала изучения заболевания COVID-19 стало ясно, что вызывающий его вирус SARS-CoV-2 в первую очередь инфицирует верхние дыхательные пути и легкие.
В то же время были указания и на то, что этот вирус проникает в клетки других частей организма, таких как желудочно-кишечный тракт, кровеносные сосуды и почки.
Новое исследование дополнило этот ряд ротовой полостью, а точнее – слюнными железами. Способностью вируса инфицировать множество мест в нашем теле можно объяснить широкий диапазон симптомов, испытываемых пациентами с COVID-19, включая связанные с ротовой полостью. Это потеря вкусовых ощущений, сухость и высыпания во рту. Более того, новое исследование не исключает, что именно ротовая полость играет ключевую роль в передаче вируса SARS-CoV-2 в легкие или пищеварительную систему через слюну, содержащую вирус, попавший в нее из инфицированных клеток ротовой полости.
Новые данные, опубликованные в журнале Nature Medicine, могут способствовать выработке стратегий снижения вирусной передачи внутри организма и вне его. Исследование проведено международной группой авторов под эгидой Национальных институтов здоровья США (National Institutes of Health, NIH). Ученым уже было известно, что слюна людей с COVID-19 может содержать высокий уровень SARS-CoV-2, и многие исследования предполагали, что для диагностирования заболевания слюнные тесты почти так же надежны, как анализ мазка из носовой полости. Но было не вполне ясно, откуда коронавирус попадает в слюну. У людей с респираторными симптомами он мог попасть из носовой слизи или мокроты, выкашливаемой из легких. Но для вируса в слюне бессимптомных больных объяснения не было.
«Исходя из данных наших лабораторий мы подозревали, что по крайней мере какое-то количество вируса в слюне может быть из инфицированных тканей самой ротовой полости», приводит слова Блейка Уорнера (Blake M. Warner) из NIH документ, распространенный американским агентством медицинских исследований. Для проверки этого предположения ученые обследовали ткани ротовой полости здоровых людей, чтобы выявить среди них подверженные инфекции SARS-CoV-2. Уязвимые клетки содержали РНК, «инструкции» для производства белков, которые необходимы вирусу для проникновения в клетки. РНК для двух ключевых белков – рецептора ангиотензинпревращающего фермента 2 (ACE2 receptor) и фермента трансмембранной сериновой протеазы 2 (TMPRSS2) – нашли в определенных клетках слюнных желёз и тканей, выстилающих ротовую полость. Продолжив исследование, авторы обнаружили РНК, характерную для SARS-CoV-2, в образцах слюнных желёз пациентов, умерших от COVID-19.
National Institutes of Health (NIH)
Scientists find evidence that novel coronavirus infects the mouth’s
NIH-funded findings point to a role for saliva in SARS-CoV-2 transmission.
#SARSCOV2 #COVID19 #селинексор #news
Лекарство от рака уменьшает токсичность белка, вырабатываемого ковидным вирусом.
Исследователи из Мэрилендского университета (University of Maryland) выявили наиболее токсичные белки, производимые вирусом SARS-COV-2, а затем использовали одобренные Управлением по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами (FDA) противораковые препараты для снижения вредного воздействия вирусных белков. В экспериментах на плодовых мушках и культурах человеческих клеток они открыли клеточный процесс, который использует в своих целях вирус, а это указывает на новые потенциально применимые лекарства для лечения тяжелых форм COVID-19. Результаты этих исследований опубликованы в двух статьях, появившихся одновременно в журнале Cell & Bioscience.
«Наша работа предполагает существование пути предупреждения поражений тканей и существенного вреда организму, причиняемого SARS-COV-2», цитирует руководителя исследований Чжэ «Цион» Ханя (Zhe «Zion» Han) MedicalXpress. Ученый отметил при этом, что самое эффективное на сегодняшний день лекарство от COVID-19, ремдесивир, только предотвращает размножение вируса, но не защищает уже инфицированные клетки от вреда, вызываемого вирусными белками. SARS-COV-2 вирус проникает в клетки и использует их для производства белков, контролируемых всеми своими 27 генами. Хань с коллегами вносили каждый из 27 генов коронавируса в культивируемые клетки человека, где изучали токсичность синтезируемых вирусных белков. Также они получили 12 линий плодовых мушек, в которых производились белки коронавируса, чтобы посмотреть на токсические эффекты, ожидаемые исходя из структуры и предсказанных функций этих белков.
Авторы установили, что наиболее токсичным, убившим половину человеческих клеток в культуре, оказался вирусный белок, который называется Orf6. Два других белка (Nsp6 and Orf7a) также были токсичными и погубили около 30-40 процентов популяции человеческих клеток. Плодовые мушки, производящие один из этих трех токсичных белков в своем организме, редко доживали до взрослого состояния. В легких таких плодовых мушек образовывалось меньше ветвей, а в клетках их мышц было меньше митохондрий, структур, ответственных за выработку энергии.
В других экспериментах ученые обнаружили, что самый токсичный из вирусных белков, Orf6, прикрепляется к белкам, способствующим движению различных молекул из клеточного ядра наружу. Далее им удалось установить, что один из этих белков блокируется онкологическим препаратом селинексор. После добавления селинексора к культуре человеческих клеток, инфицированных вирусом, выживаемость последних повысилась на 12 процентов, а плодовых мушек – производителей вирусных белков – на 15 процентов.
Лекарство от рака уменьшает токсичность белка, вырабатываемого ковидным вирусом.
Исследователи из Мэрилендского университета (University of Maryland) выявили наиболее токсичные белки, производимые вирусом SARS-COV-2, а затем использовали одобренные Управлением по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными средствами (FDA) противораковые препараты для снижения вредного воздействия вирусных белков. В экспериментах на плодовых мушках и культурах человеческих клеток они открыли клеточный процесс, который использует в своих целях вирус, а это указывает на новые потенциально применимые лекарства для лечения тяжелых форм COVID-19. Результаты этих исследований опубликованы в двух статьях, появившихся одновременно в журнале Cell & Bioscience.
«Наша работа предполагает существование пути предупреждения поражений тканей и существенного вреда организму, причиняемого SARS-COV-2», цитирует руководителя исследований Чжэ «Цион» Ханя (Zhe «Zion» Han) MedicalXpress. Ученый отметил при этом, что самое эффективное на сегодняшний день лекарство от COVID-19, ремдесивир, только предотвращает размножение вируса, но не защищает уже инфицированные клетки от вреда, вызываемого вирусными белками. SARS-COV-2 вирус проникает в клетки и использует их для производства белков, контролируемых всеми своими 27 генами. Хань с коллегами вносили каждый из 27 генов коронавируса в культивируемые клетки человека, где изучали токсичность синтезируемых вирусных белков. Также они получили 12 линий плодовых мушек, в которых производились белки коронавируса, чтобы посмотреть на токсические эффекты, ожидаемые исходя из структуры и предсказанных функций этих белков.
Авторы установили, что наиболее токсичным, убившим половину человеческих клеток в культуре, оказался вирусный белок, который называется Orf6. Два других белка (Nsp6 and Orf7a) также были токсичными и погубили около 30-40 процентов популяции человеческих клеток. Плодовые мушки, производящие один из этих трех токсичных белков в своем организме, редко доживали до взрослого состояния. В легких таких плодовых мушек образовывалось меньше ветвей, а в клетках их мышц было меньше митохондрий, структур, ответственных за выработку энергии.
В других экспериментах ученые обнаружили, что самый токсичный из вирусных белков, Orf6, прикрепляется к белкам, способствующим движению различных молекул из клеточного ядра наружу. Далее им удалось установить, что один из этих белков блокируется онкологическим препаратом селинексор. После добавления селинексора к культуре человеческих клеток, инфицированных вирусом, выживаемость последних повысилась на 12 процентов, а плодовых мушек – производителей вирусных белков – на 15 процентов.
BioMed Central
Characterization of SARS-CoV-2 proteins reveals Orf6 pathogenicity, subcellular localization, host interactions and attenuation…
Background SARS-CoV-2 causes COVID-19 which has a widely diverse disease profile. The mechanisms underlying its pathogenicity remain unclear. We set out to identify the SARS-CoV-2 pathogenic proteins that through host interactions cause the cellular damages…
#SARSCoV2 #происхождениекоронавируса #news
Издание Science News опубликовало ответы на три главных вопроса о происхождении нового коронавируса.
По всему миру поднялась новая волна дискуссий относительно происхождения вируса, вызвавшего пандемию COVID-19. Общество ждет однозначного ответа на вопрос об источнике коронавируса: природа или лаборатория? Третьего не дано.
Президент США Байден в конце мая обратился к разведывательным службам с призывом «удвоить усилия по сбору и анализу информации, которая может приблизить нас к окончательному выводу». Он потребовал отчета в течение 90 дней. К открытому и прозрачному расследованию и серьезному отношению ко всем гипотезам призывают и ведущие вирусологи мира, авторы письма, опубликованного в Science 14 мая.
Идея утечки вируса из лаборатории возродилась после публикации в одном из майских выпусков Wall Street Journal истории о трех исследователях из Уханьского института вирусологии, которые заболели с ковидными симптомами в ноябре 2019 года. Хотя до сих пор неизвестно, какое именно респираторное заболевание было у этих людей.
Ранее, в конце апреля, Всемирная организация здравоохранения обнародовала предварительное заключение своей комиссии, которое склоняется к версии попадания вируса к человеку от животных. Издание Science News рассматривает три главных вопроса, касающихся происхождения пандемического вируса.
Первый вопрос: почему гипотеза лабораторной утечки так живуча? Основная причина этого в неизвестности. Пробелы в знаниях заполняются мириадами гипотез, пишет Science News. Анализ генома вируса дает основания ученым быть уверенными в том, что он не продукт генной инженерии. Однако один из вероятных сценариев предполагает, что кто-то в лаборатории мог случайно заразиться этим коронавирусом в ходе исследований и стать источником распространения среди людей. Подобные случайности происходили ранее, но были локализованы в пределах лаборатории. И коронавирусы переходили от животных к людям за последние два десятилетия многократно.
Второй вопрос: какие доказательства укажут на точное происхождение вируса? На обнаружение вируса почти идентичного вирусу SARS-CoV-2 у диких животных уйдут годы, и такой вирус может никогда и не найтись. Для поиска доказательств лабораторного происхождения необходимо, чтобы исследовательские лаборатории сделали свои записи полностью открытыми.
Третий вопрос: почему нас вообще волнует происхождение вируса? Потому что, узнав, откуда он взялся, можно будет принять меры, предупреждающие возникновение новых вспышек подобных заболеваний. Но даже если вирус лабораторный, изначальное его происхождение животное, в лаборатории его только исследовали, подчеркивает Science News.
Издание Science News опубликовало ответы на три главных вопроса о происхождении нового коронавируса.
По всему миру поднялась новая волна дискуссий относительно происхождения вируса, вызвавшего пандемию COVID-19. Общество ждет однозначного ответа на вопрос об источнике коронавируса: природа или лаборатория? Третьего не дано.
Президент США Байден в конце мая обратился к разведывательным службам с призывом «удвоить усилия по сбору и анализу информации, которая может приблизить нас к окончательному выводу». Он потребовал отчета в течение 90 дней. К открытому и прозрачному расследованию и серьезному отношению ко всем гипотезам призывают и ведущие вирусологи мира, авторы письма, опубликованного в Science 14 мая.
Идея утечки вируса из лаборатории возродилась после публикации в одном из майских выпусков Wall Street Journal истории о трех исследователях из Уханьского института вирусологии, которые заболели с ковидными симптомами в ноябре 2019 года. Хотя до сих пор неизвестно, какое именно респираторное заболевание было у этих людей.
Ранее, в конце апреля, Всемирная организация здравоохранения обнародовала предварительное заключение своей комиссии, которое склоняется к версии попадания вируса к человеку от животных. Издание Science News рассматривает три главных вопроса, касающихся происхождения пандемического вируса.
Первый вопрос: почему гипотеза лабораторной утечки так живуча? Основная причина этого в неизвестности. Пробелы в знаниях заполняются мириадами гипотез, пишет Science News. Анализ генома вируса дает основания ученым быть уверенными в том, что он не продукт генной инженерии. Однако один из вероятных сценариев предполагает, что кто-то в лаборатории мог случайно заразиться этим коронавирусом в ходе исследований и стать источником распространения среди людей. Подобные случайности происходили ранее, но были локализованы в пределах лаборатории. И коронавирусы переходили от животных к людям за последние два десятилетия многократно.
Второй вопрос: какие доказательства укажут на точное происхождение вируса? На обнаружение вируса почти идентичного вирусу SARS-CoV-2 у диких животных уйдут годы, и такой вирус может никогда и не найтись. Для поиска доказательств лабораторного происхождения необходимо, чтобы исследовательские лаборатории сделали свои записи полностью открытыми.
Третий вопрос: почему нас вообще волнует происхождение вируса? Потому что, узнав, откуда он взялся, можно будет принять меры, предупреждающие возникновение новых вспышек подобных заболеваний. Но даже если вирус лабораторный, изначальное его происхождение животное, в лаборатории его только исследовали, подчеркивает Science News.
Science News
Here are answers to 3 persistent questions about the coronavirus’s origins
Calls to double down on investigations into where SARS-CoV-2 came from — nature or a lab accident — are rising as answers remain scarce.
#SARSCoV2 #врожденныйиммунитет #diABZI #news
Новый лекарственный препарат эффективно предотвращает тяжелую форму COVID-19 у мышей, зараженных SARS-CoV-2.
Препарат diABZI, активирующий врожденный иммунный ответ организма, оказался высоко эффективным в предупреждении развития тяжелого течения COVID-19 у мышей, которых инфицировали SARS-CoV-2, сообщает издание News-medical.net.
Исследование провели ученые медицинского факультета Перельмана Пенсильванского университета, результаты опубликованы в майском номере журнала Science Immunology и свидетельствуют также о способности diABZI нейтрализовать и другие респираторные коронавирусы.
«Не так много лекарств, которые радикально блокируют инфекцию SARS-CoV-2. Эта статья – первая, в которой показано, что терапевтическая активация раннего иммунного ответа единственной дозой препарата может быть многообещающей стратегией для контролирования вируса, включая вызывающий обеспокоенность во всем мире южноафриканский вариант B.1.351. Разработка эффективных противовирусных средств остро необходима, чтобы контролировать инфекцию SARS-CoV-2 и вызываемое ею заболевание, особенно по мере появления все более опасных вариантов вируса», – говорит ведущий автор исследования Сара Черри, профессор Пенсильванского университета.
Вирус SARS-CoV-2 изначально нацелен на эпителиальные клетки дыхательных путей. Первой линией защиты против инфекции служит система врожденного иммунитета дыхательных путей, распознающая вирусные патогены по их молекулярным особенностям. Изучая это явление, Черри с коллегами рассматривали под микроскопом инфицированные SARS-CoV-2 линии клеток легких человека и обнаружили, что вирус способен прятаться, задерживая таким образом его раннее распознавание иммунной системой и, следовательно, иммунный ответ. Ученые предположили, что можно найти препарат или малые молекулы с лекарственными свойствами, которые запустят иммунный ответ в клетках дыхательных путей раньше и предупредят тяжелое поражение SARS-CoV-2.
Для выявления антивирусных агонистов, которые будут блокировать SARS-CoV-2, авторы провели высокопроизводительный скрининг 75 препаратов, которые воздействуют на сенсорные структуры в легких. Проанализировав эффект, оказываемый ими на вирусную инфекцию, они идентифицировали девять кандидатных соединений, включая два циклических динуклеотида (CDNs), в значительной степени супрессирующих инфекцию путем активирования стимулятора интерфероновых генов, который называется STING (the stimulation of interferon genes).
Поскольку CDNs не обладают сильным действием, Черри с соавторами решили также протестировать недавно созданную молекулу – не-нуклеотидного агониста STING, который называется diABZI. Этот препарат не одобрен FDA, но в настоящее время проходит испытания для лечения некоторых видов рака. Ученые установили, что diABZI является мощным ингибитором инфекции SARS-CoV-2 разных штаммов, включая угрожающий вариант B.1.351. Это соединение стимулирует сигнальные пути выработки интерферона.
Эффективность diABZI оценивали на трансгенных мышах, зараженных SARS-CoV-2. Препарат попадал в легкие через слизистую оболочку носа. Мыши, получившие этот препарат, меньше теряли в весе, чем контрольные инфицированные мыши, у них была значительно меньшая вирусная нагрузка в легких и носовой полости и повышенная продукция цитокинов. Все это свидетельствовало о том, что diABZI стимулирует выработку интерферона для защитного иммунитета.
Новый лекарственный препарат эффективно предотвращает тяжелую форму COVID-19 у мышей, зараженных SARS-CoV-2.
Препарат diABZI, активирующий врожденный иммунный ответ организма, оказался высоко эффективным в предупреждении развития тяжелого течения COVID-19 у мышей, которых инфицировали SARS-CoV-2, сообщает издание News-medical.net.
Исследование провели ученые медицинского факультета Перельмана Пенсильванского университета, результаты опубликованы в майском номере журнала Science Immunology и свидетельствуют также о способности diABZI нейтрализовать и другие респираторные коронавирусы.
«Не так много лекарств, которые радикально блокируют инфекцию SARS-CoV-2. Эта статья – первая, в которой показано, что терапевтическая активация раннего иммунного ответа единственной дозой препарата может быть многообещающей стратегией для контролирования вируса, включая вызывающий обеспокоенность во всем мире южноафриканский вариант B.1.351. Разработка эффективных противовирусных средств остро необходима, чтобы контролировать инфекцию SARS-CoV-2 и вызываемое ею заболевание, особенно по мере появления все более опасных вариантов вируса», – говорит ведущий автор исследования Сара Черри, профессор Пенсильванского университета.
Вирус SARS-CoV-2 изначально нацелен на эпителиальные клетки дыхательных путей. Первой линией защиты против инфекции служит система врожденного иммунитета дыхательных путей, распознающая вирусные патогены по их молекулярным особенностям. Изучая это явление, Черри с коллегами рассматривали под микроскопом инфицированные SARS-CoV-2 линии клеток легких человека и обнаружили, что вирус способен прятаться, задерживая таким образом его раннее распознавание иммунной системой и, следовательно, иммунный ответ. Ученые предположили, что можно найти препарат или малые молекулы с лекарственными свойствами, которые запустят иммунный ответ в клетках дыхательных путей раньше и предупредят тяжелое поражение SARS-CoV-2.
Для выявления антивирусных агонистов, которые будут блокировать SARS-CoV-2, авторы провели высокопроизводительный скрининг 75 препаратов, которые воздействуют на сенсорные структуры в легких. Проанализировав эффект, оказываемый ими на вирусную инфекцию, они идентифицировали девять кандидатных соединений, включая два циклических динуклеотида (CDNs), в значительной степени супрессирующих инфекцию путем активирования стимулятора интерфероновых генов, который называется STING (the stimulation of interferon genes).
Поскольку CDNs не обладают сильным действием, Черри с соавторами решили также протестировать недавно созданную молекулу – не-нуклеотидного агониста STING, который называется diABZI. Этот препарат не одобрен FDA, но в настоящее время проходит испытания для лечения некоторых видов рака. Ученые установили, что diABZI является мощным ингибитором инфекции SARS-CoV-2 разных штаммов, включая угрожающий вариант B.1.351. Это соединение стимулирует сигнальные пути выработки интерферона.
Эффективность diABZI оценивали на трансгенных мышах, зараженных SARS-CoV-2. Препарат попадал в легкие через слизистую оболочку носа. Мыши, получившие этот препарат, меньше теряли в весе, чем контрольные инфицированные мыши, у них была значительно меньшая вирусная нагрузка в легких и носовой полости и повышенная продукция цитокинов. Все это свидетельствовало о том, что diABZI стимулирует выработку интерферона для защитного иммунитета.
News-Medical.net
New drug effectively prevents severe COVID-19 in mice infected with SARS-CoV-2
The drug diABZI which activates the body's innate immune response -- was highly effective in preventing severe COVID-19 in mice that were infected with SARS-CoV-2, according to scientists in the Perelman School of Medicine at the University of Pennsylvania
#SARSCoV2 #IgG #IgM #назальныйспрей #news
Назальный спрей с антителами может защитить от коронавируса и даже вылечить ковид.
Пульверизатор с гибридными антителами существенно снижал количество частиц вируса SARS-CoV-2 в легких инфицированных мышей, сообщает Nature News. С самого начала пандемии ученые задумались о создании антител для лечения COVID-19. Сегодня некоторые из таких антител проходят последние стадии клинических испытаний, а несколько одобрены для использования в чрезвычайных ситуациях.
Среди врачей, однако, лечение антителами не очень популярно, сказал в комментарии Nature News Чжицянь Ань (Zhiqiang An), конструктор антител из Центра медицинских наук при Техасском университете (University of Texas Health Science Center) в Хьюстоне. Отчасти это связано с тем, что доступные для использования антитела вводятся внутривенно, а не непосредственно в дыхательные пути, где в основном находится вирус, и при такой доставке для достижения эффекта требуются высокие дозы антительных препаратов.
Ань с коллегами задались целью сконструировать антитела, которые можно было бы доставлять непосредственно в носовую полость. Они просканировали библиотеку антител от здоровых людей и сосредоточили внимание на тех антителах, которые были способны распознавать компоненты SARS-CoV-2, используемые вирусом для прикрепления к клеткам и проникновения в них. Среди перспективных кандидатов были антитела IgG, которые после инфекции появляются относительно поздно, но довольно точно подогнаны под вторгающийся патоген. Фрагменты таких антител ученые сшили с молекулой другого типа, антителами IgM, которые действуют как агенты быстрого реагирования на широкий спектр инфекций.
Сконструированные антитела IgM обладали более сильным нейтрализующим эффектом против более 20 вариантов SARS-CoV-2, чем одни только IgG. После впрыскивания в носы мышей либо за шесть часов до инфицирования, либо через шесть часов после, сконструированные IgM быстро снижали количество вируса в легких грызунов спустя два дня после инфицирования, сообщают исследователи в журнале Nature.
Эта работа – «большое достижение в биоинженерии», считает Гай Горохов (Guy Gorochov), иммунолог из Парижского университета Сорбонна (Sorbonne University), но пока неизвестно как долго эти антитела продержатся в организме человека. Чжицянь Ань представляет себе сконструированные антитела как своего рода химическую маску для тех, кто сталкивается с SARS-CoV-2, а также как дополнительную защиту для не полностью вакцинированных людей. Поскольку молекулы IgM относительно стабильны, они подходят для создания из них назального спрея, который можно купить в аптеке и держать при себе на всякий случай, добавляет Ань.
Назальный спрей с антителами может защитить от коронавируса и даже вылечить ковид.
Пульверизатор с гибридными антителами существенно снижал количество частиц вируса SARS-CoV-2 в легких инфицированных мышей, сообщает Nature News. С самого начала пандемии ученые задумались о создании антител для лечения COVID-19. Сегодня некоторые из таких антител проходят последние стадии клинических испытаний, а несколько одобрены для использования в чрезвычайных ситуациях.
Среди врачей, однако, лечение антителами не очень популярно, сказал в комментарии Nature News Чжицянь Ань (Zhiqiang An), конструктор антител из Центра медицинских наук при Техасском университете (University of Texas Health Science Center) в Хьюстоне. Отчасти это связано с тем, что доступные для использования антитела вводятся внутривенно, а не непосредственно в дыхательные пути, где в основном находится вирус, и при такой доставке для достижения эффекта требуются высокие дозы антительных препаратов.
Ань с коллегами задались целью сконструировать антитела, которые можно было бы доставлять непосредственно в носовую полость. Они просканировали библиотеку антител от здоровых людей и сосредоточили внимание на тех антителах, которые были способны распознавать компоненты SARS-CoV-2, используемые вирусом для прикрепления к клеткам и проникновения в них. Среди перспективных кандидатов были антитела IgG, которые после инфекции появляются относительно поздно, но довольно точно подогнаны под вторгающийся патоген. Фрагменты таких антител ученые сшили с молекулой другого типа, антителами IgM, которые действуют как агенты быстрого реагирования на широкий спектр инфекций.
Сконструированные антитела IgM обладали более сильным нейтрализующим эффектом против более 20 вариантов SARS-CoV-2, чем одни только IgG. После впрыскивания в носы мышей либо за шесть часов до инфицирования, либо через шесть часов после, сконструированные IgM быстро снижали количество вируса в легких грызунов спустя два дня после инфицирования, сообщают исследователи в журнале Nature.
Эта работа – «большое достижение в биоинженерии», считает Гай Горохов (Guy Gorochov), иммунолог из Парижского университета Сорбонна (Sorbonne University), но пока неизвестно как долго эти антитела продержатся в организме человека. Чжицянь Ань представляет себе сконструированные антитела как своего рода химическую маску для тех, кто сталкивается с SARS-CoV-2, а также как дополнительную защиту для не полностью вакцинированных людей. Поскольку молекулы IgM относительно стабильны, они подходят для создания из них назального спрея, который можно купить в аптеке и держать при себе на всякий случай, добавляет Ань.
Nature
Antibody-laden nasal spray could provide COVID protection — and treatment
Scientists create a hybrid antibody that can sharply cut the amount of SARS-CoV-2 in the lungs of infected mice.
#SARSCoV2 #ингибиторыРНК #news
Ученые нацелились на ахиллесову пяту РНК вируса SARS-CoV-2.
Когда SARS-CoV-2 инфицирует клетку, он внедряет свою РНК и репрограммирует клетку таким образом, что она начинает производить вирусные белки, а после и целые вирусные частицы. В поисках активных соединений против этого коронавируса ученые в основном фокусировались на вирусных белках и способах их блокирования, видя в этом путь к предупреждению или хотя бы замедлению репликации вирусных частиц. Но оказалось, что привести к остановке или замедлению репликации может также атака на вирусный геном, длинную молекулу РНК.
Исследователи из германского консорциума COVID-19-NMR, работу которого координирует профессор Харальд Швальбе из Института органической химии и химической биологии при Франкфуртском университете имени Иоганна Вольфганга Гёте завершили важный первый этап в создании нового класса таких лекарств против SARS-CoV-2. Они выявили в геноме SARS-CoV-2 15 коротких сегментов, очень сходных у разных коронавирусов и, насколько известно, выполняющих важные регуляторные функции. В течение всего 2020 года эти сегменты почти не затрагивались мутациями.
Имея библиотеку из 768 малых, химически простых молекул, они решили запустить их во взаимодействие с 15 сегментами РНК и проанализировать результаты возможных реакций с помощью ЯМР-спектроскопии. При таком анализе молекулы сначала метят стабильными изотопами и затем помещают в сильное магнитное поле. Атомное ядро возбуждается импульсами коротких радиочастот и излучает частотный спектр, благодаря которому можно определить структуру РНК и белка, а также способ и место прикрепления к ним малых молекул.
Таким образом, профессор Швальбе с коллегами идентифицировали 69 малых молекул, которые связываются с 13 из 15 сегментов РНК, и продемонстрировали, что РНК вируса SARS-CoV-2 очень подходит для того, чтобы быть потенциальной структурой-мишенью для лекарств. Учитывая большое количество мутаций в SARS-CoV-2, консервативные сегменты РНК, подобные идентифицированным франкфуртскими учеными, представляют особый интерес для создателей потенциальных ингибиторов вируса.
«Поскольку вирусная РНК составляет около двух третей всей РНК в пораженной клетке, используя подходящие молекулы мы сможем прервать репликацию вируса в значительной степени», говорит Швальбе. В сообщении Университета Гете он также отмечает, что его группа уже начала испытания с доступными соединениями, которые химически близки к тем из библиотеки соединений, что связываются с консервативными сегментами РНК.
Ученые нацелились на ахиллесову пяту РНК вируса SARS-CoV-2.
Когда SARS-CoV-2 инфицирует клетку, он внедряет свою РНК и репрограммирует клетку таким образом, что она начинает производить вирусные белки, а после и целые вирусные частицы. В поисках активных соединений против этого коронавируса ученые в основном фокусировались на вирусных белках и способах их блокирования, видя в этом путь к предупреждению или хотя бы замедлению репликации вирусных частиц. Но оказалось, что привести к остановке или замедлению репликации может также атака на вирусный геном, длинную молекулу РНК.
Исследователи из германского консорциума COVID-19-NMR, работу которого координирует профессор Харальд Швальбе из Института органической химии и химической биологии при Франкфуртском университете имени Иоганна Вольфганга Гёте завершили важный первый этап в создании нового класса таких лекарств против SARS-CoV-2. Они выявили в геноме SARS-CoV-2 15 коротких сегментов, очень сходных у разных коронавирусов и, насколько известно, выполняющих важные регуляторные функции. В течение всего 2020 года эти сегменты почти не затрагивались мутациями.
Имея библиотеку из 768 малых, химически простых молекул, они решили запустить их во взаимодействие с 15 сегментами РНК и проанализировать результаты возможных реакций с помощью ЯМР-спектроскопии. При таком анализе молекулы сначала метят стабильными изотопами и затем помещают в сильное магнитное поле. Атомное ядро возбуждается импульсами коротких радиочастот и излучает частотный спектр, благодаря которому можно определить структуру РНК и белка, а также способ и место прикрепления к ним малых молекул.
Таким образом, профессор Швальбе с коллегами идентифицировали 69 малых молекул, которые связываются с 13 из 15 сегментов РНК, и продемонстрировали, что РНК вируса SARS-CoV-2 очень подходит для того, чтобы быть потенциальной структурой-мишенью для лекарств. Учитывая большое количество мутаций в SARS-CoV-2, консервативные сегменты РНК, подобные идентифицированным франкфуртскими учеными, представляют особый интерес для создателей потенциальных ингибиторов вируса.
«Поскольку вирусная РНК составляет около двух третей всей РНК в пораженной клетке, используя подходящие молекулы мы сможем прервать репликацию вируса в значительной степени», говорит Швальбе. В сообщении Университета Гете он также отмечает, что его группа уже начала испытания с доступными соединениями, которые химически близки к тем из библиотеки соединений, что связываются с консервативными сегментами РНК.
Aktuelles aus der Goethe-Universität Frankfurt
SARS-CoV-2: Achillesfersen im Viren-Erbgut
Potenzielle Wirkstoffe gegen SARS-CoV-2 könnten nicht nur Virenproteine wie das Spike-Protein (rot) angreifen, sondern auch direkt das RNA-Erbgut des Virus (gelb, im Virusinnern). Bild Orpheus FX/Shutterstock
Bestimmte Regionen im SARS-CoV-2-Erbgut…
Bestimmte Regionen im SARS-CoV-2-Erbgut…
#SARS #SARSCoV2 #происхождениекоронавируса #news
SARS-подобные вирусы могут переходить от животных к людям сотни тысяч раз в году, исследование проводилось в Азии, которая представляется потенциальным очагом следующей коронавирусной пандемии.
За последние 20 лет по земному шару распространились лишь два новых коронавируса, SARS-CoV, вызвавший вспышку атипичной пневмонии в 2003 году, и SARS-CoV-2, вызывающий COVID-19. Но это может быть лишь верхушкой айсберга скрытых вирусных инфекций, возникших у летучих мышей, пишут авторы новой статьи, размещенной на сервере препринтов medRxiv.
По их подсчетам родственными SARS коронавирусами ежегодно должны заражаться в среднем 400 000 человек, но это никогда не перерастает в регистрируемые вспышки. Хотя число представлено с большими оговорками, «оно должно открыть глаза всему научному сообществу на то, что о частоте распространения зооонозов, то есть инфекционных заболеваний, передающихся от животных, мы знаем не очень много», говорит эксперт Sciencemag.org вирусолог из Саскачеванского университета (University of Saskatchewan) Анджела Расмуссен (Angela Rasmussen). Это нужно осознать, «потому что иначе мы сильно недооценим это явление», добавляет она.
Авторы исследования, среди которых зоолог Питер Дашак (Peter Daszak) из EcoHealth Alliance и Льнь-Фа Ван (Linfa Wang) с факультета медицины Университета Дьюка в Сингапуре (Duke-NUS Medical School in Singapore), создали детальную карту областей обитания 23 видов летучих мышей, несущих родственные SARS коронавирусы, и наложили эти данные на места, где живут люди, чтобы получить карту потенциальных инфекционных «горячих точек». Ученые установили, что в областях, которые могут стать центром распространения зоонозов, живет около 500 миллионов человек. Эти области – север Индии, Непал, Мьянма и большая часть юго-восточной Азии. Риск наиболее высок в Китае, Вьетнаме, Камбодже и на Яве, а также других индонезийских островах.
Авторы считают, что созданная ими карта может уменьшить вероятность распространения зооноза путем изменения поведения населения в областях высокого риска и направленного контроля для раннего выявления вспышек. По словам Дашека, известного сторонника гипотезы природного, а не лабораторного происхождения нового коронавируса, эта карта также может служить руководством для обнаружения природного очага SARS-CoV-2. Хотя 400 000 ежегодно инфицируемых представляются большим числом, для региона с сотнями миллионов особей летучих мышей и полумиллиардным населением это не так много, считает Анджела Расмуссен.
SARS-подобные вирусы могут переходить от животных к людям сотни тысяч раз в году, исследование проводилось в Азии, которая представляется потенциальным очагом следующей коронавирусной пандемии.
За последние 20 лет по земному шару распространились лишь два новых коронавируса, SARS-CoV, вызвавший вспышку атипичной пневмонии в 2003 году, и SARS-CoV-2, вызывающий COVID-19. Но это может быть лишь верхушкой айсберга скрытых вирусных инфекций, возникших у летучих мышей, пишут авторы новой статьи, размещенной на сервере препринтов medRxiv.
По их подсчетам родственными SARS коронавирусами ежегодно должны заражаться в среднем 400 000 человек, но это никогда не перерастает в регистрируемые вспышки. Хотя число представлено с большими оговорками, «оно должно открыть глаза всему научному сообществу на то, что о частоте распространения зооонозов, то есть инфекционных заболеваний, передающихся от животных, мы знаем не очень много», говорит эксперт Sciencemag.org вирусолог из Саскачеванского университета (University of Saskatchewan) Анджела Расмуссен (Angela Rasmussen). Это нужно осознать, «потому что иначе мы сильно недооценим это явление», добавляет она.
Авторы исследования, среди которых зоолог Питер Дашак (Peter Daszak) из EcoHealth Alliance и Льнь-Фа Ван (Linfa Wang) с факультета медицины Университета Дьюка в Сингапуре (Duke-NUS Medical School in Singapore), создали детальную карту областей обитания 23 видов летучих мышей, несущих родственные SARS коронавирусы, и наложили эти данные на места, где живут люди, чтобы получить карту потенциальных инфекционных «горячих точек». Ученые установили, что в областях, которые могут стать центром распространения зоонозов, живет около 500 миллионов человек. Эти области – север Индии, Непал, Мьянма и большая часть юго-восточной Азии. Риск наиболее высок в Китае, Вьетнаме, Камбодже и на Яве, а также других индонезийских островах.
Авторы считают, что созданная ими карта может уменьшить вероятность распространения зооноза путем изменения поведения населения в областях высокого риска и направленного контроля для раннего выявления вспышек. По словам Дашека, известного сторонника гипотезы природного, а не лабораторного происхождения нового коронавируса, эта карта также может служить руководством для обнаружения природного очага SARS-CoV-2. Хотя 400 000 ежегодно инфицируемых представляются большим числом, для региона с сотнями миллионов особей летучих мышей и полумиллиардным населением это не так много, считает Анджела Расмуссен.
medRxiv
A strategy to assess spillover risk of bat SARS-related coronaviruses in Southeast Asia
Emerging diseases caused by coronaviruses of likely bat origin (e.g. SARS, MERS, SADS and COVID-19) have disrupted global health and economies for two decades.
Evidence suggests that some bat SARS-related coronaviruses (SARSr-CoVs) could infect people directly…
Evidence suggests that some bat SARS-related coronaviruses (SARSr-CoVs) could infect people directly…
#SARSCoV2 #дельта #вакцинированныеносители #news
Вакцины против COVID эффективны, но распространение варианта дельта в пределах домохозяйств представляет собой риск для каждого четвертого.
Полностью вакцинированные люди могут заразиться и передать COVID-19 своим домочадцам, но с более низкой частотой, чем непривитые люди, сообщает Imperial College London. Это результаты масштабного исследования передачи COVID-19 внутри домохозяйств, проведенного Имперским колледжем Лондона и Агентством санитарно-эпидемиологической безопасности Великобритании (HSA) и опубликованного в The Lancet Infectious Diseases.
Было обнаружено, что люди, получившие две дозы вакцины, имеют более низкий, но все же заметный риск заражения дельта-вариантом в домашних условиях по сравнению с людьми, которые не были вакцинированы. Авторы подчеркивают, что вакцинация также снижает риск тяжелого заболевания, госпитализации и смерти от COVID-19. Анализ показал, что около 25% вакцинированных домашних контактов дали положительный результат на COVID-19 по сравнению с примерно 38% невакцинированных домашних контактов.
Полностью вакцинированные люди избавлялись от инфекции быстрее, чем непривитые, но их пиковая вирусная нагрузка – наибольшее количество вируса SARS-CoV-2, обнаруживаемое в носу и горле – была аналогична той, которая наблюдалась у невакцинированных людей, что может объяснить, почему они все еще могут легко передать вирус в домашних условиях. По словам авторов, это исследование – одно из немногих, проведенных на сегодняшний день с использованием подробных данных, полученных из домашних хозяйств, и предлагает важную информацию о том, как вакцинированные люди все еще могут быть инфицированы дельта-вариантом и передать его другим.
В исследовании участвовал 621 инфицированный, выявленный британской системой отслеживания контактов, в период с сентября 2020 года по сентябрь 2021 года – до того, как бустерные вакцины стали широко доступны в Великобритании. Все участники болели COVID-19 в легкой или бессимптомной форме, мазки из носа и горла у них брали ежедневно в течение двух-трех недель. Из 621 участника 163 дали положительный результат на COVID-19. Полногеномное секвенирование подтвердило, что 71 человек был инфицирован дельта-вариантом вируса SARS-CoV-2, 42 - альфа и 50 – исходным штаммом SARS-CoV-2. Из 71 участника, инфицированного дельта-вариантом, 23 (32%) не были вакцинированы, 10 (14%) получили одну дозу вакцины и 38 (54%) получили две дозы вакцины. В общей сложности было выявлено 205 семейных контактов с пациентами- источниками дельта-варианта, 53 из которых дали положительный результат на COVID-19. Из 205 контактов 126 (62%) получили две дозы вакцины, 39 (19%) получили одну дозу вакцины и 40 (19%) не были вакцинированы.
Среди семейных контактов, получивших две дозы вакцины, 25% (31 из 126 контактов) заразились дельта-вариантом по сравнению с 38% (15 из 40) невакцинированных домашних контактов.
Вакцины против COVID эффективны, но распространение варианта дельта в пределах домохозяйств представляет собой риск для каждого четвертого.
Полностью вакцинированные люди могут заразиться и передать COVID-19 своим домочадцам, но с более низкой частотой, чем непривитые люди, сообщает Imperial College London. Это результаты масштабного исследования передачи COVID-19 внутри домохозяйств, проведенного Имперским колледжем Лондона и Агентством санитарно-эпидемиологической безопасности Великобритании (HSA) и опубликованного в The Lancet Infectious Diseases.
Было обнаружено, что люди, получившие две дозы вакцины, имеют более низкий, но все же заметный риск заражения дельта-вариантом в домашних условиях по сравнению с людьми, которые не были вакцинированы. Авторы подчеркивают, что вакцинация также снижает риск тяжелого заболевания, госпитализации и смерти от COVID-19. Анализ показал, что около 25% вакцинированных домашних контактов дали положительный результат на COVID-19 по сравнению с примерно 38% невакцинированных домашних контактов.
Полностью вакцинированные люди избавлялись от инфекции быстрее, чем непривитые, но их пиковая вирусная нагрузка – наибольшее количество вируса SARS-CoV-2, обнаруживаемое в носу и горле – была аналогична той, которая наблюдалась у невакцинированных людей, что может объяснить, почему они все еще могут легко передать вирус в домашних условиях. По словам авторов, это исследование – одно из немногих, проведенных на сегодняшний день с использованием подробных данных, полученных из домашних хозяйств, и предлагает важную информацию о том, как вакцинированные люди все еще могут быть инфицированы дельта-вариантом и передать его другим.
В исследовании участвовал 621 инфицированный, выявленный британской системой отслеживания контактов, в период с сентября 2020 года по сентябрь 2021 года – до того, как бустерные вакцины стали широко доступны в Великобритании. Все участники болели COVID-19 в легкой или бессимптомной форме, мазки из носа и горла у них брали ежедневно в течение двух-трех недель. Из 621 участника 163 дали положительный результат на COVID-19. Полногеномное секвенирование подтвердило, что 71 человек был инфицирован дельта-вариантом вируса SARS-CoV-2, 42 - альфа и 50 – исходным штаммом SARS-CoV-2. Из 71 участника, инфицированного дельта-вариантом, 23 (32%) не были вакцинированы, 10 (14%) получили одну дозу вакцины и 38 (54%) получили две дозы вакцины. В общей сложности было выявлено 205 семейных контактов с пациентами- источниками дельта-варианта, 53 из которых дали положительный результат на COVID-19. Из 205 контактов 126 (62%) получили две дозы вакцины, 39 (19%) получили одну дозу вакцины и 40 (19%) не были вакцинированы.
Среди семейных контактов, получивших две дозы вакцины, 25% (31 из 126 контактов) заразились дельта-вариантом по сравнению с 38% (15 из 40) невакцинированных домашних контактов.
Imperial College London
COVID vaccines effective but household transmission of delta a risk for 1 in 4
HOUSEHOLD TRANSMISSION - Fully vaccinated people can contract and pass on COVID-19 in the home, but at lower rates than unvaccinated people.
#SARSCoV2 #дельта #invitro #вирусоподобныечастицы #news
Причину быстрого распространения варианта дельта установили в экспериментах со светящимися вирусоподобными частицами.
Известно, что вариант вызвавшего пандемию коронавируса, обозначенный как дельта, более заразный, чем предшествующие штаммы, однако причина, по которой дельта распространяется особенно быстро, неясна. Новый экспериментальный подход сделал возможным изучение эффекта мутаций, возникающих в вирусе SARS-CoV-2, и позволил получить ответ на вопрос об особенностях опасного варианта.
Авторы исследования, опубликованного в Science, лауреат Нобелевской премии Дженнифер Дудна (Jennifer Doudna) с коллегами из Калифорнийского университета Беркли (University of California, Berkeley), установили, что мутация, возникшая у дельты, способствует проникновению в клетку большего количества вирусного геномного материала, а это резко повышает вероятность передачи инфекции от зараженной клетки другим клеткам.
Изучая эффект возникающих в геноме вируса мутаций, ученые, как правило, сосредотачиваются на спайк-белке, который находится на поверхности вирусной частицы и способствует ее проникновению в человеческие клетки. Для этого они конструируют так называемые псевдовирусы с различными мутациями по спайк-белку и смотрят, как та или иная из них влияет на способность экспериментальных частиц заражать клетки в лаборатории. Но Дудна с соавторами придумали другой способ: они создали вирусоподобные частицы, содержащие все вирусные белки, но не имеющие его генома.
Внешне вирусоподобная частица SARS-CoV-2 выглядит как полноценный вирус, и она способна связываться с клеткой и проникать в нее в лабораторных условиях. Но поскольку такая частица лишена генома, она не может использовать аппарат клетки для размножения в ней. Дудна с коллегами вносили в вирусоподобные частицы фрагменты информационной РНК, благодаря которым клетки с такими частицами начинали светиться. Чем ярче светится клетка, тем больше РНК в нее попало вместе с вирусоподобной частицей. Наполняя такие частицы РНК с информацией о разных мутациях SARS-CoV-2, ученые по свечению клеток с проникшими в них частицами обнаружили, что выявленная у дельты мутация по нуклеокапсидному, или N -белку (R203M), приводит к тому, что в клетки попадает в 10 раз больше генетического материала, то есть информационной РНК, чем при инфицировании первоначальным вариантом коронавируса. Когда эту же мутацию дельты внесли в настоящий вирус и заразили им клетки легких, в них образовалось в 51 раз больше инфекционных частиц, чем при заражении оригинальным штаммом.
Причину быстрого распространения варианта дельта установили в экспериментах со светящимися вирусоподобными частицами.
Известно, что вариант вызвавшего пандемию коронавируса, обозначенный как дельта, более заразный, чем предшествующие штаммы, однако причина, по которой дельта распространяется особенно быстро, неясна. Новый экспериментальный подход сделал возможным изучение эффекта мутаций, возникающих в вирусе SARS-CoV-2, и позволил получить ответ на вопрос об особенностях опасного варианта.
Авторы исследования, опубликованного в Science, лауреат Нобелевской премии Дженнифер Дудна (Jennifer Doudna) с коллегами из Калифорнийского университета Беркли (University of California, Berkeley), установили, что мутация, возникшая у дельты, способствует проникновению в клетку большего количества вирусного геномного материала, а это резко повышает вероятность передачи инфекции от зараженной клетки другим клеткам.
Изучая эффект возникающих в геноме вируса мутаций, ученые, как правило, сосредотачиваются на спайк-белке, который находится на поверхности вирусной частицы и способствует ее проникновению в человеческие клетки. Для этого они конструируют так называемые псевдовирусы с различными мутациями по спайк-белку и смотрят, как та или иная из них влияет на способность экспериментальных частиц заражать клетки в лаборатории. Но Дудна с соавторами придумали другой способ: они создали вирусоподобные частицы, содержащие все вирусные белки, но не имеющие его генома.
Внешне вирусоподобная частица SARS-CoV-2 выглядит как полноценный вирус, и она способна связываться с клеткой и проникать в нее в лабораторных условиях. Но поскольку такая частица лишена генома, она не может использовать аппарат клетки для размножения в ней. Дудна с коллегами вносили в вирусоподобные частицы фрагменты информационной РНК, благодаря которым клетки с такими частицами начинали светиться. Чем ярче светится клетка, тем больше РНК в нее попало вместе с вирусоподобной частицей. Наполняя такие частицы РНК с информацией о разных мутациях SARS-CoV-2, ученые по свечению клеток с проникшими в них частицами обнаружили, что выявленная у дельты мутация по нуклеокапсидному, или N -белку (R203M), приводит к тому, что в клетки попадает в 10 раз больше генетического материала, то есть информационной РНК, чем при инфицировании первоначальным вариантом коронавируса. Когда эту же мутацию дельты внесли в настоящий вирус и заразили им клетки легких, в них образовалось в 51 раз больше инфекционных частиц, чем при заражении оригинальным штаммом.
www.science.org
Why is Delta so infectious? New lab tool spotlights little noticed mutation that speeds viral spread
“Viruslike particles” open the way to safely study nucleocapsid and other viral proteins
#SARSCoV2 #зоонозы #news
Биоинформатики определили виды животных – наиболее вероятных резервуаров коронавируса SARS-CoV-2.
Опасения по поводу того, что новый коронавирус может найти других хозяев, став таким образом постоянно угрозой человечеству, с ходом пандемии только возрастают, пишет издание The Scientist.
Биоинформатики из Института экосистемных исследований Кэри (Cary Institute of Ecosystem Studies) в Нью-Йорке создали модель машинного обучения, которая использует признаки животного для предсказания структуры его рецепторов ангиостатин-превращающего фермента 2, рецепторов ACE2, главных «ворот» проникновения SARS-CoV-2 в клетки.
На основании этих белковых структур авторы исследования идентифицировали виды, наиболее восприимчивые к вирусу и способные его распространять. Результаты моделирования опубликованы в Proceedings of the Royal Society B. Из 5 400 видов животных ученые в результате анализа выделили как потенциально уязвимых коронавирусом некоторых домашних питомцев, сельскохозяйственных и диких животных. Кошки и обезьяны были ожидаемы, особенно в свете уже задокументированных случаев. Другие животные, например, сахарский орикс, или саблерогая антилопа, оказались более неожиданными, хотя, несмотря на контакты людей с ними в зоопарках и в рамках природоохранных программ, случаи инфицирования этих животных SARS-CoV-2 пока неизвестны.
По словам авторов, полученные ими результаты способствуют расстановке приоритетов в тестировании и наблюдении разных видов. «Недавнее открытие широкого распространения инфекции SARS-CoV-2 среди белохвостых оленей показало, насколько срочно нужно приступать к активному наблюдению за животными – потенциальными резервуарами вируса. Использованный авторами подход поможет выявить виды животных, которым угрожает заражение, чтобы приступить к реализации более целенаправленных программ наблюдения», сказал Суреш Кучипуди (Suresh Kuchipudi), специалист по природно-очаговым вирусам из Университета штата Пенсильвания (Pennsylvania State University).
Авторы публикации Барбара Хан (Barbara Han) и ее группа в Институте Кэри начали свое исследование больше года назад, задолго до того, как стало известно о том, что прошлой зимой коронавирусом заразились более 80% белохвостых оленей штата Айова. Хан с соавторами отмечают, что наиболее подверженные заражению виды с большей вероятностью контактируют с людьми, потому что редко контактирующие животные, даже если у них подходящие для вируса рецепторы ACE2, вряд ли заразятся от людей. Среди тех, кто требует пристального внимания инфекционистов и эпидемиологов, собаки и кошки, гималайский медведь, серые волки, горные гориллы и 35 видов летучих мышей.
Биоинформатики определили виды животных – наиболее вероятных резервуаров коронавируса SARS-CoV-2.
Опасения по поводу того, что новый коронавирус может найти других хозяев, став таким образом постоянно угрозой человечеству, с ходом пандемии только возрастают, пишет издание The Scientist.
Биоинформатики из Института экосистемных исследований Кэри (Cary Institute of Ecosystem Studies) в Нью-Йорке создали модель машинного обучения, которая использует признаки животного для предсказания структуры его рецепторов ангиостатин-превращающего фермента 2, рецепторов ACE2, главных «ворот» проникновения SARS-CoV-2 в клетки.
На основании этих белковых структур авторы исследования идентифицировали виды, наиболее восприимчивые к вирусу и способные его распространять. Результаты моделирования опубликованы в Proceedings of the Royal Society B. Из 5 400 видов животных ученые в результате анализа выделили как потенциально уязвимых коронавирусом некоторых домашних питомцев, сельскохозяйственных и диких животных. Кошки и обезьяны были ожидаемы, особенно в свете уже задокументированных случаев. Другие животные, например, сахарский орикс, или саблерогая антилопа, оказались более неожиданными, хотя, несмотря на контакты людей с ними в зоопарках и в рамках природоохранных программ, случаи инфицирования этих животных SARS-CoV-2 пока неизвестны.
По словам авторов, полученные ими результаты способствуют расстановке приоритетов в тестировании и наблюдении разных видов. «Недавнее открытие широкого распространения инфекции SARS-CoV-2 среди белохвостых оленей показало, насколько срочно нужно приступать к активному наблюдению за животными – потенциальными резервуарами вируса. Использованный авторами подход поможет выявить виды животных, которым угрожает заражение, чтобы приступить к реализации более целенаправленных программ наблюдения», сказал Суреш Кучипуди (Suresh Kuchipudi), специалист по природно-очаговым вирусам из Университета штата Пенсильвания (Pennsylvania State University).
Авторы публикации Барбара Хан (Barbara Han) и ее группа в Институте Кэри начали свое исследование больше года назад, задолго до того, как стало известно о том, что прошлой зимой коронавирусом заразились более 80% белохвостых оленей штата Айова. Хан с соавторами отмечают, что наиболее подверженные заражению виды с большей вероятностью контактируют с людьми, потому что редко контактирующие животные, даже если у них подходящие для вируса рецепторы ACE2, вряд ли заразятся от людей. Среди тех, кто требует пристального внимания инфекционистов и эпидемиологов, собаки и кошки, гималайский медведь, серые волки, горные гориллы и 35 видов летучих мышей.
The Scientist Magazine®
Tool Identifies Likely Reservoir Species for SARS-CoV-2
Researchers used sequencing data and phenotypic traits to predict which of 5,400 species were most likely to be susceptible to contracting and spreading the virus back to humans.