Июльская обложка Nature Reviews Drug Discovery, и вновь что-то красиво-стильное!

Посвящена она обзору Fibrosis: cross-organ biology and pathways to development of innovative drugs

А здесь в Картинках Дня я рассказывала про одного из самых ядовитых животных на нашей планете! 🐙

В статье есть фото с осьминогом на руках (не повторять, опасно), где можно увидеть какой он по размеру. Кроха, а ядовитый! 👀

Орнитологические наблюдения.

Давно у нас не было дятлов! 🐥

Это большой пёстрый дятел, самец. Был обнаружен на окном на рябине и быстренько заснят (так что за качество видео не отвечаю 🙈)

Прочитала недавнюю статью-мини-обзор In Vouchers We (Hope to) Trust: Unveiling Hidden Errors in GenBank's Tetrapod Taxonomic Foundations 🐢

Вопрос так же стар, как и существование GenBank, — ошибки в данных.

Микро экскурс. Базы в общем и целом делят на архивные и курируемые. Архивные — это те, куда кто угодно может выложить данные, они в общем и целом не особо проверяются. Курируемые — те, где осуществляется проверка данных. Есть ещё разные вариации, но это две базовые. GenBank — база архивная. И я уже видела немало статей, где показывали, что что-то может быть не так с загруженными данными (можете посмотреть в этой статье ссылки, там и примеры показывают, где ошибки в таких данных приводили к неправильным выводам). И, конечно, сами данные странные тоже в работе наблюдала.

В исследованиях не всегда есть собственные данные, иногда это данные из баз (например, GenBank), либо нужны дополнительные данные для валидации-репликации, либо как аутгруппа для филогенетических исследований, либо как данные для понимания, к какому таксону относится отсеквенированный гриб или рыба или любой другой образец. И возникает очевидный вопрос качества таких данных.

В статье изучили последовательность 16S и COI для амфибий, птиц, млекопитающих и рептилий.

Our analysis reveals that 32% of re‐sequenced vouchers (with identical field or museum numbers) yield unequal sequences, ranging from a few mutations to significant divergences (0.06%–33.95%). These divergences may result from sample misidentification, labelling errors, fidelity disparities between sequencing methods, or contamination at various stages of the research process. Our findings demonstrate errors within GenBank at its most basal level and suggest that, although undetectable, a similar error rate likely exists in non‐re‐sequenced data.

If the observed genetic variability is an artefact, it could falsely add millions of years to evolutionary phylogenetic trees, distorting the divergence age estimates, phylogeographic hypotheses and phylogenetic relationships.

Там классная картинка 1, на которой видно что происходит с 16S и с COI (такое себе, конечно).

Говорят, что если для вида есть только одна последовательность, то к ней надо относиться настороженно. Потому что сравнивать не с чем, и есть риск ошибки.

Рассказывают ещё про макрогенетику —по сути, очередной термин для уже известного (тем более что есть макроэволюция и макроэкология уже давно). Но раз уж пишу об этом, то скажу, что макрогенетика изучает генетическое разнообразие на уровне таксонов (причём сотен-тысяч) и по временной или пространственной, или и той, и другой, шкале.

Предлагают варианты, что можно сделать. Но есть какое-то небезоснавательное ощущение, что ничего не будет сделано. В общем, к чтению или просмотру картинки 1 рекомендую, потому что может быть полезно в работе 🐨

Сегодня расскажу предысторию создания карточек мотивации и поддержки для учащихся и всех, чья работа связана с наукой 📚

Я считаю психическое здоровье важным условием хорошей учёбы и работы (и в науке, и вне её). Это не прочитанная где-то теория, это то, что я наблюдала и наблюдаю по жизни (и думаю, вы со мной согласитесь). И, видя, что есть незакрытая потребность в психологическом просвещении, психологической помощи, я подумала, что классно было бы сделать что-то, что могло бы поддержать других 🙂

Не все, по разным причинам, могут или хотят получать помощь от помогающих специалистов. А поэтому хотелось сделать что-то в подобном стиле, но другое. Что-то удобное и лёгкое, что можно брать с собой, пересматривать. В общем, многоразовое и многопомогающее.

Да, есть разные чатботы, каналы, где пишут поддерживающие фразы. Но они в большинстве своём имеют большой минус — они краткие, безликие, директивные или не подходят для аудитории студентов/аспирантов/учёных. Или — их посмотришь, прочитаешь и забудешь.

Собственно, видя, что того, что я хотела бы сделать, нет, пришла идея это сделать 😎

Итого получилось 29 карточек, с одной стороны на которых нарисовано что-то по биомед тематике, а с другой — текст. Это 2-3 абзаца текста, которые не директивные (без "улыбайся" или "делай мир ярче" или "соберись и действуй" 🙈), не токсично позитивные, а реалистичные и такие (как я, во всяком случае представляла), будто я поддерживаю и говорю конкретно каждому их читающему, исходя из собственного жизненного опыта и знаний. Это то, что я хотела бы, чтобы мне в своё время сказали, когда возникали разные вопросы и трудности.

В чём сильные стороны, отличающие эти карточки от других?

🔹 В том, что все тексты писала я сама, без AI и так далее. (AI так не напишет, я недавно попробовала протестировать, он не может так подобрать слова и не умеет быть конкретным, без воды. И нет, дело не в промптах)

🔹 Я ориентировалась на свой опыт в учёбе и науке, потому что я знаю, какие есть болезненные темы, которые стоит подсветить и в которых стоит поддержать.

🔹Ну и, last but not least, у меня есть высшее психологическое образование, опыт работы консультирующим психологом и, вдобавок, я умею писать тексты (и считаю, делаю это, как минимум, хорошо).

🔹А рисовала всю красоту Элина, и рисунки вышли яркие, милые, и одновременно серьёзные и с разными пасхалками.

Все наши карточки читали, помогали улучшить и довести до ёмкости и краткости мои друзья, коллеги, знакомые, и нейротипичные, и нейроотличные. Всё для того, чтобы улучшить подачу и сделать карточки поддерживающими для самых разных людей. Я очень благодарна всем, кто нам помогали, потому что это была большая работа и поддержка, и в итоге карточки получились максимально полезными! ❤️

Вот такая вот предыстория. В следующих постах расскажу что я вынесла для себя положительного, неположительного и какой мой общий итог, глядя на проект спустя год.

На фото мои коты иллюстрируют сцену "Мотивация и поддержка" 👻

Кто из них мотивация, а кто — поддержка, решайте сами 😸

Будет бесплатная онлайн конференция Animal Behaviour Live, 13-14 ноября.

Название говорит само за себя, так что немного из описания:

Our conference this year promises to be exceptionally rich and engaging, with a diverse programme of sessions. You will be able to attend plenary sessions, as well as shorter talks and video posters presentations. In addition to the scientific sessions, we are planning two or three workshops/roundtable sessions focusing on 'experimental planning', with a particular focus on the 4Rs, the impact of climate change on animal behaviour experiments, and how to communicate research results.

Приведу темы докладов спикеров, которые подтвердили участие:

🔹 Studying Cheetahs Through The Lens of Robotics (Amir Patel, Associate Professor, Department of Computer Science, University College London)

🔹 An insect’s view on flowers: from nectary guidance to pattern recognition (Anna Stöckl, Junior Professor for Neuroethology, Konstanz University, Germany)

🔹 Parasites exploit plasticity to reprogram social wasps (Floria Mora-Kepfer Uy, Assistant Professor of Biology, Department of Biology, University of Rochester, NY, USA)

🔹 Building nests among ants: are fungal rhizomorphs in bird nests ant deterrents? (Sabrina Amador-Vargas, Research Biologist, Smithsonian Tropical Research Institute, Panama)

🔹Understanding the ‘Tiger of the River’:
Behavioural insights to support conservation of the freshwater megafish mahseer (V.V. Binoy, Associate professor, National Institute of Advanced Studies (NIAS), Indian Institute of Science (IISc), Bangalore, India)

🔹 Inside Out: sexual dimorphism and neural plasticity shape the brain and behaviour in octopuses (Wen-Sung Chung, Postdoctoral research fellow, School of the Environment, Faculty of Science, University of Queensland, Australia)

Дедлайн регистрации и сабмита абстрактов 7 сентября

Вся инфа по ссылке

Обложка августовского Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology посвящена обзору The gut microbiome connects nutrition and human health 🦠