К вопросу о том что есть и чего нет в Dateno в контексте того доступно через наше API и того что исследователи уже искали по наукометрии. Есть специфика данных в Dateno в том что пока ещё исследовательских данных в нём маловато и по очень объективным причинам.
В реестре каталогов данных Dateno сейчас 874 репозитория научных данных из которых проиндексировано пока только 99 репозиториев, а это чуть более 11% источников метаданных такого типа. И даже эти 874 репозитория - это не все репозитории научных данных в мире, а наиболее очевидные. Точное число, скорее всего, никто не знает потому что реестры вроде Re3Data и Fairsharing более широко трактуют научные дата-ресурсы и включают туда не только каталоги данных, но и базы данных.
Возвращаясь к источникам, в чём с ними сложность:
1. Коммерческие каталоги научных данных вроде облачных продуктов Elsevier и Figshare значительно ограничивают возможности их индексирования. Проиндексировать их можно, но высока вероятность блокировок с их стороны. это примерно 34% каталогов научных данных в реестре Dateno.
2. Каталоги результатов научной деятельности на DSpace легко индексируются, но устроены так что невозможно отдельно индексировать только датасеты. Чтобы проиндексировать их надо скачать все метаданные всех объектов и далее уже фильтровать датасеты. Причем последних будет не более 5% от всего общего числа материалов
3. Некоторые каталоги научных данных вроде тех что основаны Thredds или Galaxy имеют очень скудный набор метаданных, по сути они выглядят как большие научные файлохранилища. Правда и области применения у них узкие: метеорология и биоинформатика, поэтому они пока отложены
4. Для научных репозиториев данных главное API до сих пор это OAI-PMH 2.0. Очень унаследованное, очень неудобное по многим критериям, очень стандартизированное и обладающее критическим недостатком: оно не отдаёт ссылки на файлы в метаданных. Иначе говоря карточку датасета получить можно с базовыми полями метаданных, но метаданных связанных с ним файлов нельзя. Это решается, но тем не менее.
5. Есть очень крупные источники научных наборов данных в OpenAIRE, ScienceDB, ScienceBase, DataCite, BASE и ещё ряде других. Проиндексировав даже парочку из них можно добавить сразу +10-20 миллионов записей, но..., качество датасетов будет посредственное. Честно говоря я тяну с их подключением так долго как могу не потому что это сложно, а потому что качество содержания поискового индекса снизится, у этих источников нет ссылок на ресурсы. Потому что все они агрегируют через OAI-PMH 2.0 Если бы единственным критерием качества в Dateno было бы только число записей, то вопросов бы не было.
Итого это развёрнутый ответ на невысказанный вопрос "Почему в Dateno так мало научных данных, всего 488 тысяч датасетов?" Краткий ответ: из-за качества данных, а более полный ответ выше.
В любом случае крайне важно что ключевой продукт Dateno, резко отличающий его от Google Dataset Search, - это открытый индекс. Помимо открытого API к поиску это ещё и открытый реестр каталогов данных и открытая статистика.
При этом открытый индекс - это большая ответственность потому что все косяки вылезают наружу достаточно быстро, ошибки находятся, также очень быстро.
Открытый индекс - это, также, дата-продукт и у него куча метрик качества о которых я когда-нибудь расскажу в подробностях, но скорее это будет в форме выступления на конференции чем короткая заметка.
А пока покажу некоторые существенные отличия и сравнение GDS (Google Dataset Search) и Dateno.
#opendata #dateno #thoughts #datacatalogs #datasets
В реестре каталогов данных Dateno сейчас 874 репозитория научных данных из которых проиндексировано пока только 99 репозиториев, а это чуть более 11% источников метаданных такого типа. И даже эти 874 репозитория - это не все репозитории научных данных в мире, а наиболее очевидные. Точное число, скорее всего, никто не знает потому что реестры вроде Re3Data и Fairsharing более широко трактуют научные дата-ресурсы и включают туда не только каталоги данных, но и базы данных.
Возвращаясь к источникам, в чём с ними сложность:
1. Коммерческие каталоги научных данных вроде облачных продуктов Elsevier и Figshare значительно ограничивают возможности их индексирования. Проиндексировать их можно, но высока вероятность блокировок с их стороны. это примерно 34% каталогов научных данных в реестре Dateno.
2. Каталоги результатов научной деятельности на DSpace легко индексируются, но устроены так что невозможно отдельно индексировать только датасеты. Чтобы проиндексировать их надо скачать все метаданные всех объектов и далее уже фильтровать датасеты. Причем последних будет не более 5% от всего общего числа материалов
3. Некоторые каталоги научных данных вроде тех что основаны Thredds или Galaxy имеют очень скудный набор метаданных, по сути они выглядят как большие научные файлохранилища. Правда и области применения у них узкие: метеорология и биоинформатика, поэтому они пока отложены
4. Для научных репозиториев данных главное API до сих пор это OAI-PMH 2.0. Очень унаследованное, очень неудобное по многим критериям, очень стандартизированное и обладающее критическим недостатком: оно не отдаёт ссылки на файлы в метаданных. Иначе говоря карточку датасета получить можно с базовыми полями метаданных, но метаданных связанных с ним файлов нельзя. Это решается, но тем не менее.
5. Есть очень крупные источники научных наборов данных в OpenAIRE, ScienceDB, ScienceBase, DataCite, BASE и ещё ряде других. Проиндексировав даже парочку из них можно добавить сразу +10-20 миллионов записей, но..., качество датасетов будет посредственное. Честно говоря я тяну с их подключением так долго как могу не потому что это сложно, а потому что качество содержания поискового индекса снизится, у этих источников нет ссылок на ресурсы. Потому что все они агрегируют через OAI-PMH 2.0 Если бы единственным критерием качества в Dateno было бы только число записей, то вопросов бы не было.
Итого это развёрнутый ответ на невысказанный вопрос "Почему в Dateno так мало научных данных, всего 488 тысяч датасетов?" Краткий ответ: из-за качества данных, а более полный ответ выше.
В любом случае крайне важно что ключевой продукт Dateno, резко отличающий его от Google Dataset Search, - это открытый индекс. Помимо открытого API к поиску это ещё и открытый реестр каталогов данных и открытая статистика.
При этом открытый индекс - это большая ответственность потому что все косяки вылезают наружу достаточно быстро, ошибки находятся, также очень быстро.
Открытый индекс - это, также, дата-продукт и у него куча метрик качества о которых я когда-нибудь расскажу в подробностях, но скорее это будет в форме выступления на конференции чем короткая заметка.
А пока покажу некоторые существенные отличия и сравнение GDS (Google Dataset Search) и Dateno.
#opendata #dateno #thoughts #datacatalogs #datasets
Telegram
Ivan Begtin
Dateno: первые опыты
Современная наука во многом построена на больших массивах данных, доступ к которым можно получить через репозитории, однако инструментов, позволяющих осуществлять поиск сразу по нескольким из них не так много. Так, Google Dataset Search…
Современная наука во многом построена на больших массивах данных, доступ к которым можно получить через репозитории, однако инструментов, позволяющих осуществлять поиск сразу по нескольким из них не так много. Так, Google Dataset Search…
November 16, 2024
Ещё пример того как это работает у них Репозиторий открытых данных Национального банка РК [1], явно совсем недавно открытый.
Из плюсов:
- это не два-три показателя, а несколько десятков. Есть надежда что и дальше их прибавится
- данные машиночитаемы, отдаются в CSV и JSON форматах
- есть API [2] с возможностью получить данные, также в JSON
- много региональных данных, по областям Республики Казахстан
А в качестве дружелюбного фидбека добавлю:
1. Было бы хорошо указать условия распространения данных, например лицензию CC-BY или аналог, главное чтобы условия были.
2. Сейчас сайт интерактивен, у конкретного раздела или показателя нет постоянных ссылок. Это может выглядеть смазливо при показе начальству, но для пользователей скорее неудобно.
3. В продолжение про постоянные ссылки, при их наличии можно добавлять экспорт и описание метаданных в Schema.org Dataset. Тогда их сможет проиндексировать Google Dataset Search, а если сделать экспорт в DCAT, то и Dateno, впрочем Dateno скоро сможет и по Schema.org индексировать тоже.
4. Стоит сразу добавить экспорт данных в формате Parquet, это несложно, и современно и вообще хорошо.
5. Сейчас по каждому показателю данные экспортируются динамично. Это неэффективно и лишняя нагрузка на сервер. Есть смысл не только автоматически генерировать статичные датасеты, но и давать возможность получать их пермалинками, тогда данные можно легко грузить в базу данных по прямой ссылке на CSV или JSON файл
В остальном это большой прогресс для РК.
Ссылки:
[1] https://data.nationalbank.kz
[2] https://data.nationalbank.kz/api-docs
#opendata #kazakhstan #datasets #datacatalogs
Из плюсов:
- это не два-три показателя, а несколько десятков. Есть надежда что и дальше их прибавится
- данные машиночитаемы, отдаются в CSV и JSON форматах
- есть API [2] с возможностью получить данные, также в JSON
- много региональных данных, по областям Республики Казахстан
А в качестве дружелюбного фидбека добавлю:
1. Было бы хорошо указать условия распространения данных, например лицензию CC-BY или аналог, главное чтобы условия были.
2. Сейчас сайт интерактивен, у конкретного раздела или показателя нет постоянных ссылок. Это может выглядеть смазливо при показе начальству, но для пользователей скорее неудобно.
3. В продолжение про постоянные ссылки, при их наличии можно добавлять экспорт и описание метаданных в Schema.org Dataset. Тогда их сможет проиндексировать Google Dataset Search, а если сделать экспорт в DCAT, то и Dateno, впрочем Dateno скоро сможет и по Schema.org индексировать тоже.
4. Стоит сразу добавить экспорт данных в формате Parquet, это несложно, и современно и вообще хорошо.
5. Сейчас по каждому показателю данные экспортируются динамично. Это неэффективно и лишняя нагрузка на сервер. Есть смысл не только автоматически генерировать статичные датасеты, но и давать возможность получать их пермалинками, тогда данные можно легко грузить в базу данных по прямой ссылке на CSV или JSON файл
В остальном это большой прогресс для РК.
Ссылки:
[1] https://data.nationalbank.kz
[2] https://data.nationalbank.kz/api-docs
#opendata #kazakhstan #datasets #datacatalogs
November 19, 2024
В рубрике как это работает у них портал данных на базе Arab Region Data and Policy Support Hub (RCP) [1] создан при агентстве ООН The UN Regional Collaboration Platform (RCP) for Arab States.
Его можно отнести к одному из порталов данных ООН которых всего несколько десятков, часть из них базы индикаторов, часть каталоги данных, часть системы раскрытия информации в рамках инициатив прозрачности.
Этот портал - гибридный портал индикаторов и открытых данных. В его каталоге [2] 132 тысячи наборов данных большая часть из которых - это индикаторы из других проектов и сайтов ООН, таких как портал данных Всемирного банка и Портал статслужбы ООН.
Почти все данные - это статистика и в этом смысл проект напоминает другой похожий о котором я ранее писал, это DBNomics. Правда DBNomics несколько побольше, там 92 источника данных, 30 тысяч наборов данных и 1.4 миллиарда временных рядов.
В портале данных RCP такого числа временных рядов нет из-за отсутствия дробления/разрезания датасетов по территориям.
А также у портала есть документированное и недокументированное API, раздел с геоданными и статистические дашборды.
Ссылки:
[1] https://data.as-rcp.org/
#opendata #arabstates #data #datacatalogs #statistics
Его можно отнести к одному из порталов данных ООН которых всего несколько десятков, часть из них базы индикаторов, часть каталоги данных, часть системы раскрытия информации в рамках инициатив прозрачности.
Этот портал - гибридный портал индикаторов и открытых данных. В его каталоге [2] 132 тысячи наборов данных большая часть из которых - это индикаторы из других проектов и сайтов ООН, таких как портал данных Всемирного банка и Портал статслужбы ООН.
Почти все данные - это статистика и в этом смысл проект напоминает другой похожий о котором я ранее писал, это DBNomics. Правда DBNomics несколько побольше, там 92 источника данных, 30 тысяч наборов данных и 1.4 миллиарда временных рядов.
В портале данных RCP такого числа временных рядов нет из-за отсутствия дробления/разрезания датасетов по территориям.
А также у портала есть документированное и недокументированное API, раздел с геоданными и статистические дашборды.
Ссылки:
[1] https://data.as-rcp.org/
#opendata #arabstates #data #datacatalogs #statistics
November 25, 2024
November 28, 2024
В продолжение текста о том как искать данные в принципе, поговорим о том где искать геоданные. С геоданными, всё, и лучше, и хуже, но важнее то что всё по другому. Иногда очень по другому.
Первое что важно знать это то что геоданные не индексируются Google Dataset Search и большей частью поисковиков которые я ранее не упоминал. Очень часто геоданные находятся, в принципе, за пределами обычного поиска и искать их необходимо в специальных каталогах и специальных сервисах.
Конечно, в первую очередь я порекомендую Dateno ;) где проиндексировано более чем 5.5 миллионов геоданных-ресурсов из геопорталов, практически по всем странам.
Но есть и другие источники:
- Geoseer - единственный известный мне поисковик по геоданным. Чем-то похож на Dateno, а Dateno на него. Охватывает 3.5 миллиона точек с гео API, в основном WMS, WFS, WCS и WMTS.
- ArcGIS Hub - портал открытых данных на базе платформы ArcGIS, охватывает все экземпляры порталов с открытыми данными на базе облачного сервиса ArcGIS
- ArcGIS Search - поисковик от ArcGIS по всем общедоступным ресурсам на их геосерверах. Шире чем поиск ArcGIS Hub, охватывает не только цифровые слои, но и другие геоартефакты
- Spatial Data Catalog - каталог данных от Carto, более 11 тысяч наборов данных удобных для интеграции с их платформой. Примерно 2/3 данных доступны только за деньги, считаются premium data
- Spatineo Directory - не каталог данных, но каталог источников геоданных, геосерверов. Можно найти нужны сервер и искать уже в нём.
А также стоит обратить внимание на порталы США: geoplatform.gov, sciencebase.gov и Европы data.europe.eu, где тоже много геоданных
Источников геоданных куда больше, это только основные ресурсы. А есть ещё базы спутниковых снимков, интерфейсы доступа к ним через стандарт STAC и многое другое. Об этом я регулярно пишу и ещё напишу здесь.
#opendata #geodata #datacatalogs
Первое что важно знать это то что геоданные не индексируются Google Dataset Search и большей частью поисковиков которые я ранее не упоминал. Очень часто геоданные находятся, в принципе, за пределами обычного поиска и искать их необходимо в специальных каталогах и специальных сервисах.
Конечно, в первую очередь я порекомендую Dateno ;) где проиндексировано более чем 5.5 миллионов геоданных-ресурсов из геопорталов, практически по всем странам.
Но есть и другие источники:
- Geoseer - единственный известный мне поисковик по геоданным. Чем-то похож на Dateno, а Dateno на него. Охватывает 3.5 миллиона точек с гео API, в основном WMS, WFS, WCS и WMTS.
- ArcGIS Hub - портал открытых данных на базе платформы ArcGIS, охватывает все экземпляры порталов с открытыми данными на базе облачного сервиса ArcGIS
- ArcGIS Search - поисковик от ArcGIS по всем общедоступным ресурсам на их геосерверах. Шире чем поиск ArcGIS Hub, охватывает не только цифровые слои, но и другие геоартефакты
- Spatial Data Catalog - каталог данных от Carto, более 11 тысяч наборов данных удобных для интеграции с их платформой. Примерно 2/3 данных доступны только за деньги, считаются premium data
- Spatineo Directory - не каталог данных, но каталог источников геоданных, геосерверов. Можно найти нужны сервер и искать уже в нём.
А также стоит обратить внимание на порталы США: geoplatform.gov, sciencebase.gov и Европы data.europe.eu, где тоже много геоданных
Источников геоданных куда больше, это только основные ресурсы. А есть ещё базы спутниковых снимков, интерфейсы доступа к ним через стандарт STAC и многое другое. Об этом я регулярно пишу и ещё напишу здесь.
#opendata #geodata #datacatalogs
Telegram
Ivan Begtin
К вопросу о том как и где искать данные, в качестве регулярного напоминания:
Поисковые системы по данным
- Dateno - поисковая система по всем видам наборов данных, геоданных и научных данных, агрегирует их из более чем 5 тысяч каталогов данных, включает…
Поисковые системы по данным
- Dateno - поисковая система по всем видам наборов данных, геоданных и научных данных, агрегирует их из более чем 5 тысяч каталогов данных, включает…
November 28, 2024
December 3, 2024
Продолжая тему данных о климате и наблюдении за океанами и морями, проект SeaDataNet [1] пан-Европейская инициатива по упрощению доступа к данным морских исследований. Включает поиск по более чем 3 миллионам наборам данных [2] которые являются пробами, наблюдениями и так далее.
Большая часть данных происходит из Франции, более 1.1 миллиона записей, но много данных и из России, порядка 182 тысяч записей.
Данные есть из практически всех европейских и многих околоевропейских стран с выходом к морю. Поэтому данные, к примеру, из Грузии есть, а из Армении нет.
Почти все данные под лицензией Creative Commons, но для доступа нужна регистрация.
Это другой пример очень специфических отраслевых данных, можно обратить внимание что поиск по ним по собственным уникальным фильтрам таким как: морской регион, координаты, научная дисциплина, способ получения данных и так далее.
Привязка данных связана скорее с географическим положением, чем с административными границами.
Ссылки:
[1] https://www.seadatanet.org/
[2] https://cdi.seadatanet.org/search
#opendata #climate #oceans #europe #datacatalogs #datasearch
Большая часть данных происходит из Франции, более 1.1 миллиона записей, но много данных и из России, порядка 182 тысяч записей.
Данные есть из практически всех европейских и многих околоевропейских стран с выходом к морю. Поэтому данные, к примеру, из Грузии есть, а из Армении нет.
Почти все данные под лицензией Creative Commons, но для доступа нужна регистрация.
Это другой пример очень специфических отраслевых данных, можно обратить внимание что поиск по ним по собственным уникальным фильтрам таким как: морской регион, координаты, научная дисциплина, способ получения данных и так далее.
Привязка данных связана скорее с географическим положением, чем с административными границами.
Ссылки:
[1] https://www.seadatanet.org/
[2] https://cdi.seadatanet.org/search
#opendata #climate #oceans #europe #datacatalogs #datasearch
December 9, 2024
В продолжение про зрелость открытых данных в Европе, коротко о том как в Европейском союзе устроена работа с открытыми данными.
1. У ЕС сформировалось зрелое законодательство по открытости охватывающее все страны, в которых приняты соответствующие законы, созданы порталы с открытыми данными, мониторинг их публикации и множество инициатив так или иначе с этим связанных.
2. Еврокомиссия ведёт портал data.europa.eu в котором аггрегируется уже более 1.8 миллиона наборов данных из порталов открытых данных ЕС
3. Около 2/3 всех опубликованных данных на национальных порталах открытых данных в ЕС - это геоданные.
4. В ЕС особенно много порталов данных и геопорталов регионального и муниципального уровня. В реестре каталогов данных Dateno их 467, с оговоркой что в реальности их значительно больше
5. Значительная часть региональных и городских порталов открытых данных работают на базе SaaS продукта от французского разработчика OpenDataSoft
6. В отличие от США в ЕС публикации на национальных порталах открытых данных и в научных репозиториях разделены и научные данные европейских исследователей представлены в системе OpeanAIRE
7. Важная особенность Евросоюза - это раскрытие данных особой ценности (HVD, High Value Datasets). Наборы данных про которые точно известно что они востребованы пользователями.
8. В Dateno чуть менее 7 миллионов наборов данных собраны из стран ЕС или охватывают страны ЕС. Большая часть этих данных - это геоданные, около 55%
9. При этом Dateno индексирует лишь половину национальных порталов стран ЕС поскольку другая половина использует нетиповое ПО. Откуда тогда такой охват? Из большого числа малых региональных и городских порталов данных и геопорталов, которые не попадают в общеевропейский data.europa.eu. Постепенно в Dateno будут все европейские национальные порталы данных тоже
10. Ещё одна тема не раскрываемая в отчетах Open Data Maturity - это доступность статистики. В ЕС наднациональная статистика Евростата и ЕЦБ хорошо представлена для любых пользователей, включая тех кто работает с ними как с базами данных. На национальном уровне большой разброс разных систем публикации индикаторов. но более всего используется шведская система PxWeb
11. В ЕС до сих пор популярно предоставление национальных данных через интерфейсы SPARQL и как связанные данные. Такое мало где практикуется в мире, слабо связано с современными инструментами работы с данными и дата инженерии, но имеет прямую взаимосвязь с работой с научными данными и онтологиями.
#opendata #europe #datacatalogs
1. У ЕС сформировалось зрелое законодательство по открытости охватывающее все страны, в которых приняты соответствующие законы, созданы порталы с открытыми данными, мониторинг их публикации и множество инициатив так или иначе с этим связанных.
2. Еврокомиссия ведёт портал data.europa.eu в котором аггрегируется уже более 1.8 миллиона наборов данных из порталов открытых данных ЕС
3. Около 2/3 всех опубликованных данных на национальных порталах открытых данных в ЕС - это геоданные.
4. В ЕС особенно много порталов данных и геопорталов регионального и муниципального уровня. В реестре каталогов данных Dateno их 467, с оговоркой что в реальности их значительно больше
5. Значительная часть региональных и городских порталов открытых данных работают на базе SaaS продукта от французского разработчика OpenDataSoft
6. В отличие от США в ЕС публикации на национальных порталах открытых данных и в научных репозиториях разделены и научные данные европейских исследователей представлены в системе OpeanAIRE
7. Важная особенность Евросоюза - это раскрытие данных особой ценности (HVD, High Value Datasets). Наборы данных про которые точно известно что они востребованы пользователями.
8. В Dateno чуть менее 7 миллионов наборов данных собраны из стран ЕС или охватывают страны ЕС. Большая часть этих данных - это геоданные, около 55%
9. При этом Dateno индексирует лишь половину национальных порталов стран ЕС поскольку другая половина использует нетиповое ПО. Откуда тогда такой охват? Из большого числа малых региональных и городских порталов данных и геопорталов, которые не попадают в общеевропейский data.europa.eu. Постепенно в Dateno будут все европейские национальные порталы данных тоже
10. Ещё одна тема не раскрываемая в отчетах Open Data Maturity - это доступность статистики. В ЕС наднациональная статистика Евростата и ЕЦБ хорошо представлена для любых пользователей, включая тех кто работает с ними как с базами данных. На национальном уровне большой разброс разных систем публикации индикаторов. но более всего используется шведская система PxWeb
11. В ЕС до сих пор популярно предоставление национальных данных через интерфейсы SPARQL и как связанные данные. Такое мало где практикуется в мире, слабо связано с современными инструментами работы с данными и дата инженерии, но имеет прямую взаимосвязь с работой с научными данными и онтологиями.
#opendata #europe #datacatalogs
data.europa.eu
The official portal for European data | data.europa.eu
Discover the single point of access to open data from European countries, EU institutions, agencies and bodies and other European countries.
December 18, 2024
В рубрике как это устроено у них порталы данных эпидемиологических исследований, для них существует специальное ПО с открытым кодом Obiba Mica [1], я в прошлом году упоминал [2] портал с данными по COVID-19, но это далеко не единственный такой проект с данными.
На базе Obiba Mica работает несколько десятков порталов данных в рамках проектов RECAP Preterm [3], европейский проект мониторинга детей с недостаточным весом и рождённых до срока и EUCAN Connect [4] совместные проекты Евросоюза и Канады в области персонализированной и превентивной медицины. Инсталляции на базе Obiba Mica разбросаны по разным странам: Испания [5], Португалия [6] и многие другие.
В чём особенность этих порталов? Во первых они не содержат открытые данные. Практически всегда содержащиеся там данные - это медицинские сведения, даже если они деперсонализированы, они более всего похожи на микроданные переписей и также организованы.
У датасетов есть переменные и метаданные которые детально описаны, доступны, стандартизированы, но сами данные доступны только после регистрации, направления запроса и получения подтверждения.
И, конечно, это продукт с открытым исходным кодом [7].
Во многих научных дисциплинах есть специализированные продукты/каталоги данных используемых для доступа к данным исследований в форме специфичной для этой дисциплины и Obiba Mica - это один из таких примеров.
В реестре Dateno есть около 20 дата порталов на базе Obiba Mica, в дикой среде их ещё где-то столько же, но в индексе Dateno их нет, поскольку данные из таких каталогов недоступны, а есть только метаданные. А это снижает приоритет индексирования, не говоря уже о том что наборов данных в таких порталах немного, от единиц до пары сотен датасетов.
Ссылки:
[1] https://www.obiba.org/pages/products/mica/
[2] https://yangx.top/begtin/5053
[3] https://recap-preterm.eu/
[4] https://eucanconnect.com/
[5] https://coral.igtp.cat/pub/
[6] https://recap-ispup.inesctec.pt/pub/
[7] https://github.com/obiba
#opendata #datacatalogs #datasets #dateno #microdata #epidemiology
На базе Obiba Mica работает несколько десятков порталов данных в рамках проектов RECAP Preterm [3], европейский проект мониторинга детей с недостаточным весом и рождённых до срока и EUCAN Connect [4] совместные проекты Евросоюза и Канады в области персонализированной и превентивной медицины. Инсталляции на базе Obiba Mica разбросаны по разным странам: Испания [5], Португалия [6] и многие другие.
В чём особенность этих порталов? Во первых они не содержат открытые данные. Практически всегда содержащиеся там данные - это медицинские сведения, даже если они деперсонализированы, они более всего похожи на микроданные переписей и также организованы.
У датасетов есть переменные и метаданные которые детально описаны, доступны, стандартизированы, но сами данные доступны только после регистрации, направления запроса и получения подтверждения.
И, конечно, это продукт с открытым исходным кодом [7].
Во многих научных дисциплинах есть специализированные продукты/каталоги данных используемых для доступа к данным исследований в форме специфичной для этой дисциплины и Obiba Mica - это один из таких примеров.
В реестре Dateno есть около 20 дата порталов на базе Obiba Mica, в дикой среде их ещё где-то столько же, но в индексе Dateno их нет, поскольку данные из таких каталогов недоступны, а есть только метаданные. А это снижает приоритет индексирования, не говоря уже о том что наборов данных в таких порталах немного, от единиц до пары сотен датасетов.
Ссылки:
[1] https://www.obiba.org/pages/products/mica/
[2] https://yangx.top/begtin/5053
[3] https://recap-preterm.eu/
[4] https://eucanconnect.com/
[5] https://coral.igtp.cat/pub/
[6] https://recap-ispup.inesctec.pt/pub/
[7] https://github.com/obiba
#opendata #datacatalogs #datasets #dateno #microdata #epidemiology
December 19, 2024
В рубрике интересных каталогов данных я ранее писал про WIS 2.0 движок от Всемирной метеорологической организации (WMO) по сбору стандартизированных данных о погоде [1]. Но это относительно новый продукт, ведь большое число стран интегрировано с системами WMO и без него. И делают они это, не все но многие, с помощью другого продукта который называется OpenWIS [2].
Это продукт с открытым кодом созданный в The OpenWIS Association AISBL через кооперацию более чем десятка стран.
На базе OpenWIS работают порталы с данными о погоде в России [3], Таиланде [4], Индонезии [5], Южной Корее [6] и многих других странах.
Внутри OpenWIS форк продукта Geonetwork, специализированного каталога метаданных используемого для публикации и поиска по пространственным данным. Поскольку у Geonetwork много открытых API и интерфейсов то к этим порталам можно подключится даже когда их веб интерфейсы закрыты паролями. Например, у российской инсталляции OpenWIS открытое API по стандарту OAI-PMH [7] и, скорее всего и другие тоже есть.
Код OpenWIS не развивается уже несколько лет, явно постепенно метеорологические агентства будут переходить на WIS 2.0 и на другие решения, тем не менее эти порталы это тоже каталоги данных. В реестре каталогов Dateno их пока нет, кроме портала OpenWIS в Таиланде, который был идентифицирован как экземпляр Geonetwork хотя, правильнее всё же будет определять OpenWIS как отдельный тип каталогов данных.
С одной стороны данных в этих каталогах данных немного, сотни слоёв карт, максимум, а с другой стороны их сбор не требует сверхусилий и рано или поздно они появятся в поиске Dateno.
Ссылки:
[1] https://yangx.top/begtin/5972
[2] https://github.com/OpenWIS/openwis
[3] http://meta.gisc-msk.wis.mecom.ru/openwis-portal/srv/en/main.home
[4] http://wis.tmd.go.th/openwis-user-portal/srv/en/main.home
[5] http://wis.bmkg.go.id/openwis-user-portal/srv/en/about.home
[6] http://dcpc.nmsc.kma.go.kr/openwis-user-portal/srv/en/main.home
[7] http://meta.gisc-msk.wis.mecom.ru/openwis-portal/srv/en/oaipmh?verb=Identify
#opendata #datacatalogs #data #meteorology #opensource
Это продукт с открытым кодом созданный в The OpenWIS Association AISBL через кооперацию более чем десятка стран.
На базе OpenWIS работают порталы с данными о погоде в России [3], Таиланде [4], Индонезии [5], Южной Корее [6] и многих других странах.
Внутри OpenWIS форк продукта Geonetwork, специализированного каталога метаданных используемого для публикации и поиска по пространственным данным. Поскольку у Geonetwork много открытых API и интерфейсов то к этим порталам можно подключится даже когда их веб интерфейсы закрыты паролями. Например, у российской инсталляции OpenWIS открытое API по стандарту OAI-PMH [7] и, скорее всего и другие тоже есть.
Код OpenWIS не развивается уже несколько лет, явно постепенно метеорологические агентства будут переходить на WIS 2.0 и на другие решения, тем не менее эти порталы это тоже каталоги данных. В реестре каталогов Dateno их пока нет, кроме портала OpenWIS в Таиланде, который был идентифицирован как экземпляр Geonetwork хотя, правильнее всё же будет определять OpenWIS как отдельный тип каталогов данных.
С одной стороны данных в этих каталогах данных немного, сотни слоёв карт, максимум, а с другой стороны их сбор не требует сверхусилий и рано или поздно они появятся в поиске Dateno.
Ссылки:
[1] https://yangx.top/begtin/5972
[2] https://github.com/OpenWIS/openwis
[3] http://meta.gisc-msk.wis.mecom.ru/openwis-portal/srv/en/main.home
[4] http://wis.tmd.go.th/openwis-user-portal/srv/en/main.home
[5] http://wis.bmkg.go.id/openwis-user-portal/srv/en/about.home
[6] http://dcpc.nmsc.kma.go.kr/openwis-user-portal/srv/en/main.home
[7] http://meta.gisc-msk.wis.mecom.ru/openwis-portal/srv/en/oaipmh?verb=Identify
#opendata #datacatalogs #data #meteorology #opensource
December 23, 2024