В пятницу тринадцатого в 19:00 Булат Загидуллин из группы Network Pharmacology for Precision Medicine в University of Helsinki расскажет, как с помощью ML ищут новые лекарства и механизмы работы уже существующих. На примере проекта LINCS и работ с датасетом Connectivity Map (CMap) Булат расскажет про возможные подходы и методы построения моделей. Это будет совместный семинар с сообществом Sberloga.

CMap — это самый большой датасет экспрессионных данных (1.5 миллиона профилей) до и после добавления потенциальных лекарств в разных клеточных линиях. Последняя версия датасета была опубликована в 2017 году и широко используется в области (более 300 цитирований), — а прямо сейчас на части данных этого датасета идет соревнование Kaggle. Участникам предлагают предсказать механизм действия новых потенциальных лекарств. Подробнее про это соревнование на прошлой неделе на семинаре Sberloga рассказывал Андрей Лукьяненко. Слайды вот, скоро обещают и видео выложить.

Ссылка на zoom для пятничного семинара с Булатом.

#ссылка
Очень неплохие материалы выложены на сайте Олега Нагорного. И вообще, очень симпатичный личный сайт.
https://nagornyy.me/

#соревнование
На кэгле сейчас идёт очень симпатичное соревнование, я уже порекламировал его своим студентам, а в одном из курсов мы взяли его как обязательно задание. В чём плюсы:
* идеально для практики в нейронках, они здесь рулят, плюс куча кёрнелов с кодом
* задача табличная - нет специфики CV или NLP, идеально для новичков, можно сконцентрироваться на обучении сетей
* данных немного (7-слойная сеть проходит 7-fold CV на ноуте за 6 минут)
* много классов, большой дисбаланс - шанс понять, что это такое и как с этим бороться
(выше как раз была ссылка на обсуждение соревнования)
https://www.kaggle.com/c/lish-moa/

#статьи
В этом году вышла куча т.н. "эффективных трансформеров", которые пригодны для обработки длинных последовательностей. У стандартного механизма self-attention сложность O(N^2), поэтому её пытаются уменьшить разными приёмами, начиная от ограничения внимания (смотреть не на все токены), заканчивая классическими приёмами (LSH, kernel tricks и т.п.) Если Вы запутались в новинках, смотрите статью с их сравнением:
https://arxiv.org/pdf/2011.04006.pdf

#интересно
Оказывается, iPavlova больше нет...
https://www.facebook.com/olga.kairova/posts/10157719960593034

#реклама
12 декабря Альфа-Групп запускает online-чемпионат по Data Science: Alfa-Battle 2.0
Задачи придумали team leaders Data Science в Альфа-Банке. Призовой фонд — 1 000 000 рублей!

Ключевые даты:
12 декабря — старт чемпионата.
12 декабря - 20 января — время на решение задач.
29 января - презентация решений, награждение финалистов.

https://link.alfabattle.ru/DN75B

#видео
На постнауке вышла интересная беседа с Воронцовым. Но сколько же негатива в комментариях ("Просто туфта какая-то...", "Лектор обеспокоен будущим грозным соперником человеческому интеллекту,но сам участвует в его создании...", "Чувак первел фичу ка признак? Да он туп, как обух топора.", "Каароче говоря, лектор понятия не имеет, как функционирует нейрон"). Специально посмотрел всю беседу... по-моему там всё отлично.
https://youtu.be/Rn3GJcCQVzQ

#соревнование
Нашёл новую (для себя, по крайней мере) платформу с соревнованиями:
https://roboton.io/

#видео
Про т.н. диаризацию спикеров:
https://youtu.be/DiA3ruGaCTc

2016 год, человек играет произведение, написанное нейросетью Magenta. Сначала не знал, что это нейросеть — принял за композитора Дебюсси.

В принципе, Magenta и под Рахманинова успешно косит, если попросить. Тест Тьюринга пройден.

#видео
Классный ролик про клеточные автоматы:
https://youtu.be/FiO6jkNkrb4

#конференции
Если среди подписчиков есть прям математики-математики, то вот хорошая ссылка для них - обзор современных направлений:
http://www.mathnet.ru/conf1877

#новости
О скорых преобразованиях в МГУ.
https://www.kommersant.ru/doc/4574647

#реклама
Приглашаем всех желающих принять участие в Финале Марафона ИТ-соревнований.
Финал пройдет в формате онлайн конференции по анализу данных.

———————————

Основные пункты программы:

1. Призеры RPCC в рамках дискуссии поделятся решениями и подходами, которые помогли им занять топ места, модератором выступит Станислав Семенов.

2. ООО “РН—БашНИПИнефть” представит альфа версию приложения для экспресс анализа пропанта, созданного в рамках RPCC

3. С докладами по компьютерному зрению выступят Артур Кузин (Head of CV, X5) и Игорь Рекун (Optia.ai)

4. Тимофей Загуренко (директор по информационным технологиям ООО “РН— БашНИПИнефть”), Леонид Черный (CDO, Мегафон), Вадим Аюев (Head of Data Science & Analytics, Retail Risks, Альфа Банк) обсудят методы и подходы в управление данными и data science проектами.

———————————

Вы сможете принять активное участие в конференции: задавать вопросы спикерам, участвовать в опросах и голосованиях. Все это будет происходить в телеграм чате нашей конфереции (https://yangx.top/joinchat/BVLltB2_zeBKTqtTM0MmMw). Самые активные участники получат мерч чемпионата и купоны на доставку еды.

Полное расписание и регистрация на Финал Марафона ИТ-соревнований по адресу
https://rn.digital/it2020/final

Начало в 13:00 (МСК) ждем всех