КрокодилГенов
200 subscribers
106 photos
8 videos
3 files
95 links
🔬 Секреты генов: Селекция на Пределе! 🌟

Открой для себя мир генетики сельскохозяйственных и диких животных. Узнай, как технологии меняют селекцию и создают новые возможности!

🚀 Будь частью генетической революции!

👉 Присоединяйся к нам!
加入频道
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
💰 Новая технология, которая делает геномные исследования доступными для всех!
🇨🇳 Low-pass секвенирование — это крутая технология, которая делает геномные исследования в сельском хозяйстве более доступными и эффективными. Она помогает быстро находить известные генетические варианты, что обеспечивает селекцию растений и животных.

🧰Почему это популярно и важно?
💰 Доступно: Эта технология стоит дешевле, чем традиционные методы, поэтому её могут использовать как фермеры, так и ученые.
⚡️ Скорость: С ней можно быстро обрабатывать много образцов, что особенно полезно для крупных полевых проектов.

📊 Больше информации: Low-pass секвенирование дает больше данных в популяции с ущербом в сторону точности (0,5-5х покрытие), чем обычные геномные техники.
⏱️ Быстрые результаты: Рабочий процесс настроен так, чтобы получать результаты быстро, что помогает принимать решения в селекции сегодня и сейчас.
🔍 Точность: Предварительный прогноз о генах и селекционных признаках.

🚜Как это используется в сельском хозяйстве?
🐄 Селекция скота: Помогает селекционерам находить нужные признаки у животных на ранних стадиях, обязательно используя феном, иммуном, референт и повышая эффективность работы.
🌾 Устойчивость: Метод выявляет известные варианты генов, связанные с устойчивостью к болезням или повышенной продуктивностью.
🔬 Научные исследования: Используется в проектах, изучающих важные селекционные признаки у животных.

🌇Будущее на горизонте
🍽 Продовольственная безопасность: С учетом роста мирового спроса на продукты питания, Low-pass секвенирование может помочь увеличить темпы роста производства.

🌍 Экологичность: Эта технология помогает создавать новые породы, которые лучше справляются с вызовом промышленности и изменениями климата.

📈 Широкое применение: Ожидается, что она станет новым стандартом в агрогеномике, полезным как для крупных, так и для мелких хозяйств.

⚖️Сравнение с другими методами
♠️Low-pass секвенирование
Плюсы:
Дешево и сердито.
Быстро обрабатывает много образцов.
Позволяет выявлять только основные и ранее известные генетические вариации.
Минусы:
Низкая точность для новых генов.
Требует сложных методов импутации (биоинформатики и статистики) для точного анализа, обязательно нужны хорошие и актуальные референты типичных пород и подробные данные фенома.
Не подходит для анализа структурных изменений генома.

♣️Секвенирование 5x
Плюсы:
Более доступно, чуть дороже и чуть дольше, но дает достаточно информации.
Отличное качество прочтения генома, наилучшим образом подходит для полевых исследований, особенно при работе с генофондом.
Легко и быстро определяет новые генетические варианты.
Не нужно предугадывать варианты, не нужна импутация. простая сборка геномов, нужны только свои референты геномов прочитанные на высокой плотности секвенирования 30х для каждой породы отдельно.
Минусы:
Все еще может быть неточным для редких вариантов.
Дольше по времени, чем Low-pass секвенирование.

♦️Секвенирование целевое
Плюсы:
Очень недорого доступно, уже использовалось в геномике КРС, дешевле 5х и чуть быстрее, но дает информацию по нужным областям генома.
Легко и быстро определяет заданные генетические варианты, пригоден для контроля генного редактирования CRISPR.
Очень простая биоинформатика, но нужен хороший референт для исследуемой группы животных и типичные контрольные генотипы.
Минусы:
Считает только определенные гены, не видит весь геном.
Быстрее по времени, точнее, но менее информативно, чем 5х секвенирование.

♥️Секвенирование 30x
Плюсы:
Долго, очень высокая точность, включая поиск редкие вариантов по здоровью и продуктивности.
Позволяет глубокий анализ генов.
Минусы:
Дорого и все таки, не быстро, но зато по биоинформатике нет сложностей, никаких сложных моделей импутации и прогноза вариантов.
Много времени для подготовки и секвенирования.

Выбор между Low-pass, 5x и 30x секвенированием зависит от целей и бюджета. Low-pas секвенирование идеально подходит для предварительных исследований, а 5x и 30x лучше для регулярного анализа геномов. 🌟

#АгроГен #геномика
☑️ Подписаться
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🎧Музыка без границ🎼
или обещанные два клипа группы Смысловые галюцинации

💽Все будет волшебно
💽Без стюардесс

🎥Обязательно к просмотру и репосту!

#музыка
☑️ Подписаться
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🚀🧬 Секвенирование нового поколения: какое выбрать , как работает и зачем нам это нужно?

При секвенировании нового поколения (NGS) первичными данными являются "сырые" последовательности ДНК или РНК, которые мы получаем в процессе.

Риды — это
короткие кусочки ДНК, которые мы "прочитали" из образца. Чем больше ридов, тем больше информации!
Качество ридов — для каждого рида есть оценка, насколько точно мы его прочитали. Это помогает понять, насколько надежные данные.
〽️Метаданные — это всякие дополнительные инфы о пробах и условиях, при которых проводилось секвенирование.
♻️Эти данные потом обрабатываются, чтобы получить полную картину генома или транскриптома. В общем, это как "черновик" для дальнейшего анализа!
💡 Результаты обработки: Всё, что мы получаем после анализа, — это уже не первичные данные. Например, в low pass NGS качество данных может сильно меняться.
🔬 Чипы и генотипы: Генотипы — это вторичные данные. Они получаются из флуоресценции, фиксируемой на чипе. То есть, она уже потом про помощи ключа расшифровки и карты чипа переводится в генотип. Здесь тоже все очень зависит от качества чипа. Флуоресценция — это не сам генотип!
📊 Секвенирование: Первичные данные здесь — это флуорохроматограммы, которые показывают, как выглядит ДНК.

Мы сейчас не говорим про импутацию данных и что это такое, но обязательно вернёмся к этому вопросу позднее 🚀

#геномика #АгроГен
☑️ Подписаться
💸 Фальсификация сливочного масла: кто, как и зачем?

Фальсифицировать сливочное масло могут:
🏭 Крупные производители: Некоторые добавляют растительные жиры, такие как пальмовое масло, чтобы снизить себестоимость.
🧑‍🌾 Мелкие производители: Они могут использовать низкокачественные ингредиенты или обманывать с маркировкой.
🛒 Продавцы: В магазинах иногда попадаются подделки, где сливочное масло заменяют на более дешёвые варианты.
Как фальсифицируют? 
Вот основные способы:
🌿 Добавление растительных жиров: В сливочное масло подмешивают пальмовое или соевое масло, чтобы снизить себестоимость.
🥛 Использование плохого молока: Некоторые производители могут использовать некачественные ингредиенты и добавлять различные добавки для улучшения вкуса.
🏷 Ложная маркировка: Продукты могут называться "100% сливочное масло", хотя на самом деле это не так.

#аналитика #АгроБиотех
☑️ Подписаться
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🧈Как сделать вологодское масло: пошаговая инструкция

Что понадобится:
🥛Цельное коровье молоко — свежее, от здоровой коровы. Чем жирнее, тем лучше (не менее 3,5%).
🔀Сепаратор — наш главный помощник в этом процессе.
🪣Чистая емкость для сливок.
🫙Чистая емкость для масла (баночка или миска).
🥣Маслобойка — для взбивания масла.
🧂Соль — по желанию, чтобы добавить вкус!

🧾Инструкция:
➡️Шаг 1: Подготовка молока
1. Соберите молоко: Убедитесь, что оно свежее и охлажденное. Чем свежее — тем вкуснее!
2. Процедите молоко: Пропустите его через марлю или сито, чтобы убрать всякие примеси. Чистота — залог качества!

🔀Шаг 2: Разделение молока
1. Настройте сепаратор: Убедитесь, что он чистый и готов к работе. Следуйте инструкциям производителя в выборе тарелок сепарации и режимов.
2. Отделите сливки: Налейте молоко в сепаратор и включите. Вы получите сливки и обезжиренное молоко. Сливки — это то, что нам нужно!

🔁Шаг 3: Взбивание сливок
1. Соберите сливки: Перелейте их в чистую емкость. Нам нужно около 1 литра для хорошего масла.
2. Промывание сливок: Перед взбиванием промойте сливки холодной водой. Это придаст маслу тот самый вологодский вкус!
3. Взбейте сливки: Используйте пробор. Взбивание может занять некоторое время, но не переживайте — скоро вы увидите, как сливки превращаются в масло!

⬆️Шаг 4: Отделение масла
1. Отделите масло от сыворотки: Когда сливки превратятся в масло, слейте сыворотку в отдельную емкость.
2. Промойте масло: Промойте его холодной водой, чтобы удалить остатки сыворотки. Это сохранит свежесть и улучшит вкус.

#АгроБиотех
☑️Подписаться
🌱 Эрукамид: Удивительные факты о растениях и их скрытых свойствах!

Эрукамид сам по себе не связан с растениями, но его производное — эруковая кислота — есть в некоторых растительных маслах, например, в рапсе и горчице.

💧 Что такое эруковая кислота? 
Эруковая кислота содержится в маслах, получаемых из определенных сортов рапса. Некоторые из них имеют много этой кислоты.

🔍 Почему это важно? 
Ученые изучают, как эруковая кислота влияет на здоровье. В больших количествах она может быть вредной, поэтому многие сорта рапса селекционируются так, чтобы в них было меньше этой кислоты.

🌍 Что еще
Есть исследования, которые смотрят на использование растений с эруковой кислотой для создания новых материалов, таких как биопластики.

И все же исследователям генетикам нужно быть точнее, публикуя новости своей организации.
Так что связь между эрукамидом и растениями заключается в эруковой кислоте, которая имеет значение в сельском хозяйстве и пищевой промышленности. 😊

#АгроБиотех
☑️ Подписаться
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🚀 Геномная селекция — это ваш шанс сделать наше животноводство круче! 🐄💪

Что это такое? Это когда мы используем ДНК для выбора самых лучших животных, чтобы они давали больше молока и были здоровыми! 🔬
Зачем это нужно?
Ускоряем селекцию: Быстрее получаем результат!
💰Снижаем затраты: Меньше тратим на корм и уход!
🦠Устойчивость к болезням: Берём только самых крепких!
🏆Русская голштинская порода — это наш флагман! Она уже доказала, что может быть суперпродуктивной! И если мы будем работать с чистопородными животными, мы сможем добиться ещё больших успехов! Именно она, и единственно эта порода в России пригодна для геномной селекции 🎉
🌍Почему это важно? Это не только про деньги, но и про нашу безопасность! Чем больше мы будем зависеть от наших пород скота, тем меньше будем зависеть от импорта!
На изображении бык лидер отрасли, КОЛОРИТ 5635 (NL929756356), АО Чувашское по племенной работе.

#селекция #АгроГен
☑️ Подписаться
🌍 Зависимость от импорта — это не просто слова! Это настоящая угроза для нашего животноводства! 🐄💔

Почему это важно?
🇺🇸Мы полагаемся на импорт племенного скота, чтобы улучшать наше производство. Но это может привести к высоким затратам и политическим рискам. Если что-то пойдёт не так, мы можем остаться без необходимых ресурсов!

Проблемы, с которыми мы сталкиваемся:
💸Экономика: Цены на заготовку кормов растут, и фермеры страдают, не могут подучить прибыль
🚫Политика: Международные конфликты могут закрыть нам доступ к генетическим ресурсам.
📉Качество: Импортируемые породы могут не подходить для наших условий, и это снижает их продуктивность и долголетие.

Угрозы продовольственной безопасности:
🍖🥛Мы должны заботиться о том, чтобы у всех был доступ к качественным продуктам. Если импортируемые животные не подходят, это может привести к нехватке мяса и молока!

Что делать?
Важно развивать собственные генетические ресурсы и технологии, чтобы обеспечить устойчивость и независимость в этой сфере. Давайте поддерживать наше местное животноводство и защищать нашу продовольственную безопасность! 💪🌱

Может ли Россия вывести собственную породу голштинского скота? Может и смогла!

Фото ГТРК Калуга
#селекция #АгроГен
☑️ Подписаться
🌍 На грани перемен: собственные индексы пород как основа для будущего животноводства!💡

Почему это важно?
😱Мы часто используем стандарты и индексы, разработанные за границей, чтобы выбрать лучших животных. Но это может сыграть с нами злую шутку!

Индексы, разработанные за рубежом для голштинской породы пригодны для использования в России на голштинской породе.
С обязательным условием создания собственной оценки племенной ценности по моделям BLUP уровня не ниже SM и AM, а геномного прогноза (не оценки) уровня моделей не ниже sBLUP (модели должны быть открыты и полностью опубликованы, метод расчета может быть запатентован). Потом их можно регистрировать, компоновать в индексы и ежегодно отчитываться и сверять свои индексы с зарбежными, но брать их как есть з аграницей, это грубейшая методическая ошибка.

Плотность генетического чипа, дополнительного к
геномному прогнозу, должна составлять не менее 53,218 маркеров, равномерно распределенных по геному. Точность прогноза относительно фенотипической оценки должна быть не менее 80% с подтверждением по потомству быков-производителей. Воспроизводимость должна составлять не менее 98-99%.

Кроме того, оценка должна производиться по признакам и влияющим на них факторам среды не менее тех, которые опубликованы в странах с развитым животноводством.

Только для голштинской породы в России существует референтная популяция, достаточная для таких оценок, и только для этой породы имеются аналогичные популяции за границей.


Конечно можно оговориться, что существуют же айширская порода, джерсейская? да, конечно, но масштабы не те совершенно.

В свиноводстве все намного лучше, но об этом в другой раз.

Для крупного рогатого скота отечественных пород, мелкого рогатого скота, оленей, пчел, в собаководстве геномная оценка в коммерческом понимании нужна как собаке пятая нога, но маркерная селекция и генетическая идентификация при этом крайне необходима.

Проблемы, с которыми мы сталкиваемся:
💔Снижение продуктивности и здоровья коров: Если индексы не учитывают наши условия, животные могут не показывать ожидаемых результатов

🚨 Деградация местной отрасли в племенном животноводстве — это реальная угроза!
Почему это происходит?
🐄Когда мы слишком полагаемся на импорт и зарубежные стандарты, теряется интерес к разработке и улучшению наших местных пород. Это значит, что мы можем потерять уникальных животных, которые идеально подходят для наших условий! 🌱

Проблемы, с которыми мы сталкиваемся:

Утрата навыков: Специалисты перестают заниматься развитием местных генетических ресурсов. Мы теряем ценные знания и навыки, которые нужны для успешного животноводства! 📉
Уход кадров: Если импорт становится проще, молодёжь не хочет учиться и работать в этой области. Максимум идут в менеджеры по продаже спермы в зарубежные компании или дилеры. Это приводит к сокращению образовательных программ по селекции и недостатку новых специалистов. 🎓😟
Потеря уникальных пород: Без должного внимания к местным породам мы можем потерять их навсегда! Это не только плохо для животноводов, но и для всей экономики страны! 🌍

Что делать?
Важно поддерживать и развивать собственные генетические ресурсы! Инвестируйте в образование и подготовку специалистов, чтобы сохранить потенциал местного животноводства и обеспечить продовольственную безопасность для всех! 💪🌾

#селекция #АгроГен
☑️ Подписаться
💸 Экономические последствия в племенном животноводстве — это серьёзная проблема, о которой стоит поговорить! 🐄

💰Увеличение затрат:
⚠️Россия и Китай снижаем зависимость от импорта племенного скота, т.к. это может сильно ударить по карману! Цены на животных растут, а значит, и на продукцию (мясо, молоко и т.д.). Это не радует потребителей!
😟Если цены продолжают расти, это может вызвать недовольство среди людей, особенно тех, кто и так уже на грани финансовых трудностей. Это значит, что мы можем столкнуться с социальными волнениями!

📉Уменьшение доходов:
Местные производители, которые зависят от импорта, оказываются в невыгодном положении по сравнению с зарубежными конкурентами. Это значит, что их доходы падают!
😟Снижение доходов ограничивает возможности фермеров инвестировать в новые технологии и улучшение своего бизнеса. Это может привести к сокращению рабочих мест и потере квалифицированных кадров в отрасли. 😔

🌱Что делать?

Важно поддерживать местное производство и развивать собственные генетические ресурсы и геномные технологии! Это поможет снизить затраты и повысить доходы фермеров, а значит, улучшить ситуацию в животноводстве! 💪

#АгроГен #геномика
☑️ Подписаться
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM