Rebrikov_PTsR_v_realnom_vremeni_-_Binom_2009.pdf
51.6 MB
ngs_vysokoproizvoditelnoe_sekvenirovanie.pdf
24.9 MB
🧪История, которая изменила мир! ✨
🌍💉Как 22 мальчика изменили историю вакцинации: невероятное путешествие вакцины в 18 веке!
💉 В конце 18 века европейские врачи сделали важное открытие:
Прививание коровьей оспой защищает от опасной натуральной оспы, уносящей более миллиона жизней в год!
🚀 Экспедиция 1803 года
Доктор Франсиско Хавьер де Бальмис организовал удивительную экспедицию:
👦 22 мальчика-сироты (8-10 лет) стали «живой цепочкой» для доставки вакцины.
📅 Каждые 10 дней лимфа из пузырьков на их руках использовалась для прививки следующему.
🌍 Результат:
Вакцина дошла до Мексики, Центральной и Южной Америки, а затем и до Филиппин и Китая!
#здоровье
☑️Подписаться
🌍💉Как 22 мальчика изменили историю вакцинации: невероятное путешествие вакцины в 18 веке!
💉 В конце 18 века европейские врачи сделали важное открытие:
Прививание коровьей оспой защищает от опасной натуральной оспы, уносящей более миллиона жизней в год!
🚀 Экспедиция 1803 года
Доктор Франсиско Хавьер де Бальмис организовал удивительную экспедицию:
👦 22 мальчика-сироты (8-10 лет) стали «живой цепочкой» для доставки вакцины.
📅 Каждые 10 дней лимфа из пузырьков на их руках использовалась для прививки следующему.
🌍 Результат:
Вакцина дошла до Мексики, Центральной и Южной Америки, а затем и до Филиппин и Китая!
#здоровье
☑️Подписаться
💡 Пушистики под угрозой? 5 фактов о прививках, которые вы не знали!😲
🐾 Прививки:
🦠Живые вакцины: Содержат ослабленные микробы.
🐶Пример: вакцина от бешенства.
🧪Инактивированные вакцины: Содержат убитые микробы.
🐕Пример: вакцина от инфекционного гепатита.
🧬Рекомбинантные вакцины: Создаются с помощью генной инженерии.
🔬Например, вакцина от бешенства.
🔠Поливалентные вакцины: 💪Защищают сразу от нескольких заболеваний.
• Содержат антитела к нескольким заболеваниям и помогают защитить животных.
⚡️Пример: сыворотка от лептоспироза.
🔵Иммуноглобулины:
👶🐮Пробиотики, антитела и перевары- иммуномодуляторы для лечения болезней, особенно у новорождённых животных.
🦌Вакцинация диких животных:
🦊Важна для предотвращения распространения болезней. Например, лис вакцинируют от бешенства.
💡 Ветеринария постоянно развивается, и новые вакцины помогают лучше защищать наших пушистиков и заботиться о здоровье людей.
Прививки — это реально важно! ❤️
#здоровье
☑️ Подписаться
🐾 Прививки:
🦠Живые вакцины: Содержат ослабленные микробы.
🐶Пример: вакцина от бешенства.
🧪Инактивированные вакцины: Содержат убитые микробы.
🐕Пример: вакцина от инфекционного гепатита.
🧬Рекомбинантные вакцины: Создаются с помощью генной инженерии.
🔬Например, вакцина от бешенства.
🔠Поливалентные вакцины: 💪Защищают сразу от нескольких заболеваний.
• Содержат антитела к нескольким заболеваниям и помогают защитить животных.
⚡️Пример: сыворотка от лептоспироза.
🔵Иммуноглобулины:
👶🐮Пробиотики, антитела и перевары- иммуномодуляторы для лечения болезней, особенно у новорождённых животных.
🦌Вакцинация диких животных:
🦊Важна для предотвращения распространения болезней. Например, лис вакцинируют от бешенства.
💡 Ветеринария постоянно развивается, и новые вакцины помогают лучше защищать наших пушистиков и заботиться о здоровье людей.
Прививки — это реально важно! ❤️
#здоровье
☑️ Подписаться
💔 Разочарование на ферме: Как обещания свободы обернулись тиранией! 😈
🤝 Объединение животных: Животные решают, что пора создать своё общество, где все равны. Они собираются вместе, чтобы работать и заботиться друг о друге. Это как идея социализма — все за одного и один за всех!
🐄🐑 Разные роли: У каждого животного своя задача.Свиньи становятся главными, потому что они умные, а коровы и овцы трудятся, чтобы обеспечить всех едой . Это показывает, как разные животные вынуждены сотрудничать и помогать друг другу.
😡 Эксплуатация: Со временем свиньи начинают использовать других животных для своих целей. Это как в жизни — когда одни начинают злоупотреблять властью и манипулировать другими.
🥶Условия жизни: В начале все становится лучше, но потом свиньи возвращаются к старым плохим привычкам, и жизнь остальных животных снова ухудшается. Это как разочарование, когда ожидания не оправдываются.
⚖️ Идея равенства: Фраза «Все животные равны, но некоторые животные равнее других » показывает, как легко можно искажать идеи о равенстве. Некоторые животные получают больше внимания и ресурсов, чем другие, и это несправедливо.
📚✨ Эти моменты поднимают важные вопросы о власти и справедливом обращении с животными, и делают книгу (Скотный двор Джорджа Оруэлла) актуальной даже сегодня!
#аудиокниги
☑️ Подписаться
🤝 Объединение животных: Животные решают, что пора создать своё общество, где все равны. Они собираются вместе, чтобы работать и заботиться друг о друге. Это как идея социализма — все за одного и один за всех!
🐄🐑 Разные роли: У каждого животного своя задача.
😡 Эксплуатация: Со временем свиньи начинают использовать других животных для своих целей. Это как в жизни — когда одни начинают злоупотреблять властью и манипулировать другими.
🥶Условия жизни: В начале все становится лучше, но потом свиньи возвращаются к старым плохим привычкам, и жизнь остальных животных снова ухудшается. Это как разочарование, когда ожидания не оправдываются.
⚖️ Идея равенства: Фраза «
📚✨ Эти моменты поднимают важные вопросы о власти и справедливом обращении с животными, и делают книгу (Скотный двор Джорджа Оруэлла) актуальной даже сегодня!
#аудиокниги
☑️ Подписаться
🔍 Сигналы тревоги: Как распознать смещение сычуга у вашего животного? 🐾
🩺 Следим за здоровьем: Регулярные проверки коров у ветеринара — это вам не шутки! Чем раньше заметишь проблему, тем лучше.
🍽️ Правильное питание: Кормим своих коровок правильно! Оптимальный рацион помогает избежать смещения.
🏡 Комфортные условия: Создаем уют для животных и минимизируем стресс. Спокойствие — залог здоровья!
💪 Обучение команды: Обучаем всех, кто ухаживает за животными и лечит, правильным методам кормления и ухода. Знания — сила!
Опасности смещения:
⬅️Левое смещение: Это более распространенное состояние, и если его не лечить,могут быть серьезные проблемы. Будьте на чеку!
➡️Правое смещение: Встречается реже, номожет быть еще опаснее. Риск перфорации или некроза — не шутка!
🏥 Своевременная операция: Если вы заметили симптомы смещения, важно немедленно обратиться к ветеринару.
🔪Операция специалистами может быть необходима для исправления ситуации и спасения жизни вашего животного!
Оба типа смещения опасны для коров, но левое чаще и легче диагностируется.
Профилактика через правильное питание и уход — ключ к здоровью наших любимцев!
#здоровье
☑️ Подписаться
🩺 Следим за здоровьем: Регулярные проверки коров у ветеринара — это вам не шутки! Чем раньше заметишь проблему, тем лучше.
🍽️ Правильное питание: Кормим своих коровок правильно! Оптимальный рацион помогает избежать смещения.
🏡 Комфортные условия: Создаем уют для животных и минимизируем стресс. Спокойствие — залог здоровья!
💪 Обучение команды: Обучаем всех, кто ухаживает за животными и лечит, правильным методам кормления и ухода. Знания — сила!
Опасности смещения:
⬅️Левое смещение: Это более распространенное состояние, и если его не лечить,
➡️Правое смещение: Встречается реже, но
🏥 Своевременная операция: Если вы заметили симптомы смещения, важно немедленно обратиться к ветеринару.
🔪Операция специалистами может быть необходима для исправления ситуации и спасения жизни вашего животного!
Оба типа смещения опасны для коров, но левое чаще и легче диагностируется.
Профилактика через правильное питание и уход — ключ к здоровью наших любимцев!
#здоровье
☑️ Подписаться
🚨 Наука под угрозой: как наукометрия разрушает исследования!
Злоупотребление наукометрическими показателями – это проблема, которая мешает нормальному развитию науки. Вот основные моменты:
📈 Давление на количество
В научной среде все чаще требуют публиковать много статей. Из-за этого ученые начинают гнаться за количеством, забывая о качестве. Вместо одной классной работы могут выйти несколько мелких.
🔍 Смена приоритетов
Исследователи начинают выбирать темы не по важности, а по возможностям публикации в крутых журналах. Это искажает настоящие цели науки.
📉 Игнорирование качества
Когда фокус на числах, другие важные аспекты, такие как вклад в образование или социальное значение, остаются в тени. Качественные исследования могут не получать должного внимания.
⚡️ Публикационная гонка
Конкуренция за гранты и признание заставляет ученых публиковать результаты быстрее, иногда не проверяя их как следует. Это может привести к ошибкам и недобросовестным практикам.
📊 Необъективные метрики
Импакт-фактор и другие показатели не всегда отражают реальную значимость работы, особенно в специфических областях. Это может ограничивать разнообразие идей.
🚫 Этика на грани
Злоупотребление наукометрией может проявляться в самоплагиате или искусственном увеличении ссылок. Это совсем не круто!
#аналитика
☑️ Подписаться
Злоупотребление наукометрическими показателями – это проблема, которая мешает нормальному развитию науки. Вот основные моменты:
📈 Давление на количество
В научной среде все чаще требуют публиковать много статей. Из-за этого ученые начинают гнаться за количеством, забывая о качестве. Вместо одной классной работы могут выйти несколько мелких.
🔍 Смена приоритетов
Исследователи начинают выбирать темы не по важности, а по возможностям публикации в крутых журналах. Это искажает настоящие цели науки.
📉 Игнорирование качества
Когда фокус на числах, другие важные аспекты, такие как вклад в образование или социальное значение, остаются в тени. Качественные исследования могут не получать должного внимания.
⚡️ Публикационная гонка
Конкуренция за гранты и признание заставляет ученых публиковать результаты быстрее, иногда не проверяя их как следует. Это может привести к ошибкам и недобросовестным практикам.
📊 Необъективные метрики
Импакт-фактор и другие показатели не всегда отражают реальную значимость работы, особенно в специфических областях. Это может ограничивать разнообразие идей.
🚫 Этика на грани
Злоупотребление наукометрией может проявляться в самоплагиате или искусственном увеличении ссылок. Это совсем не круто!
#аналитика
☑️ Подписаться
🔍 Загадочные пути генетики и клонирования 🌌
В середине 20 века нацисты были вовлечены в множество таинственных проектов: от исследований НЛО до освоения Антарктиды и прокладки подземных туннелей под всеми континентами. Однако, удивительно, что задолго до этих событий, в древние времена, когда молоко доили вручную, а масло взбивали с любовью, на территории Украины уже проводились генетические эксперименты.
Эти факты подчеркивают, что когда-то существовала Великая Цивилизация с удивительными технологиями!
🌾✨ Исследуя наше прошлое, мы открываем новые горизонты и понимаем, насколько глубоки корни человеческого знания и изобретательности.
#юмор
☑️ Подписаться
В середине 20 века нацисты были вовлечены в множество таинственных проектов: от исследований НЛО до освоения Антарктиды и прокладки подземных туннелей под всеми континентами. Однако, удивительно, что задолго до этих событий, в древние времена, когда молоко доили вручную, а масло взбивали с любовью, на территории Украины уже проводились генетические эксперименты.
Эти факты подчеркивают, что когда-то существовала Великая Цивилизация с удивительными технологиями!
🌾✨ Исследуя наше прошлое, мы открываем новые горизонты и понимаем, насколько глубоки корни человеческого знания и изобретательности.
#юмор
☑️ Подписаться
🌸 С Международным женским днём! 🌸
Дорогие женщины сельского хозяйства!
В этот прекрасный весенний день мы хотим посвятить вам наши самые нежные слова. Вы, кто превращает землю в плодородный сад, кто выращивает хлеб и ухаживает за животными, кто стоит у руля развития аграрного сектора – вы настоящие волшебницы!
🌟 Почтенные агрономы, чьими руками создаются урожаи,
Доктора сельскохозяйственных наук, чьи знания питают поля,
Ветеринары, дарящие здоровье нашим четвероногим друзьям,
И все, кто каждый день творит чудеса в полях и фермах –
Примите наши искренние поздравления!
🌺 Дорогие доярки, чьи нежные руки заботятся о коровах,
Неутомимые механизаторы, управляющие мощной техникой,
Внимательные счетоводы, ведущие строгий учёт,
Ловкие водители, обеспечивающие связь между фермами,
И все те, кто своим трудом украшает наши будни –
Мы восхищаемся вашим мастерством и преданностью делу!
📚Преподавательницы, учителя, наставники в школах, научные руководители, - все те, кто несут мудрость, свет и знания в наш молодой мир!
🌷 Пусть ваша работа всегда приносит радость и удовлетворение,
Пусть каждый день будет наполнен новыми достижениями,
Пусть ваши мечты сбываются, а планы реализуются,
И пусть весна всегда живёт в ваших сердцах!
Уважаемые сотрудницы Министерства сельского хозяйства!
Вы, кто на высоком уровне управляет процессами развития отрасли,
Кто разрабатывает стратегии и воплощает их в жизнь,
Кто заботится о будущем нашего сельского хозяйства –
Мы преклоняемся перед вашим умом, мудростью и целеустремленностью!
💐 С праздником, дорогие женщины!
Мира, счастья и весеннего настроения вам и вашим близким!
С любовью и уважением, КрокодилГенов
☑️ Подписаться
Дорогие женщины сельского хозяйства!
В этот прекрасный весенний день мы хотим посвятить вам наши самые нежные слова. Вы, кто превращает землю в плодородный сад, кто выращивает хлеб и ухаживает за животными, кто стоит у руля развития аграрного сектора – вы настоящие волшебницы!
🌟 Почтенные агрономы, чьими руками создаются урожаи,
Доктора сельскохозяйственных наук, чьи знания питают поля,
Ветеринары, дарящие здоровье нашим четвероногим друзьям,
И все, кто каждый день творит чудеса в полях и фермах –
Примите наши искренние поздравления!
🌺 Дорогие доярки, чьи нежные руки заботятся о коровах,
Неутомимые механизаторы, управляющие мощной техникой,
Внимательные счетоводы, ведущие строгий учёт,
Ловкие водители, обеспечивающие связь между фермами,
И все те, кто своим трудом украшает наши будни –
Мы восхищаемся вашим мастерством и преданностью делу!
📚Преподавательницы, учителя, наставники в школах, научные руководители, - все те, кто несут мудрость, свет и знания в наш молодой мир!
🌷 Пусть ваша работа всегда приносит радость и удовлетворение,
Пусть каждый день будет наполнен новыми достижениями,
Пусть ваши мечты сбываются, а планы реализуются,
И пусть весна всегда живёт в ваших сердцах!
Уважаемые сотрудницы Министерства сельского хозяйства!
Вы, кто на высоком уровне управляет процессами развития отрасли,
Кто разрабатывает стратегии и воплощает их в жизнь,
Кто заботится о будущем нашего сельского хозяйства –
Мы преклоняемся перед вашим умом, мудростью и целеустремленностью!
💐 С праздником, дорогие женщины!
Мира, счастья и весеннего настроения вам и вашим близким!
С любовью и уважением, КрокодилГенов
☑️ Подписаться
🔥 Создавай Будущее: Мы — Движущая Сила Новой России!🇷🇺
🙌Эй, ребята!
Мы вместе, как отмечено на канале Сила России (ВЕZ Фильтров), создаем мощную движуху! Каждый на своем месте: в школе, универе, на работе, в министерстве, в тракторе, в доильном зале или в лаборатории.
Мы строим Россию, которая будет топовой в генетике животных и растений, а не просто закупает, а сама продает свои технологии.
🎓 Обучение:
Нужно учить школьников, студентов и специалистов современным подходам, чтобы каждый уходил с реальными инструментами. И делать это все бесплатно и безопасно, через универы и курсы. Давайте вместе! 💪😊
🚀 Что нам надо сделать:
✌️Придумать свои фишки по работе с фенотипом, геномом, иммунитетом и эпигенетикой.
✌️Оценивать состояние организма с помощью крутых методов анализа.
✌️Создать систему, чтобы идентифицировать животных и генетические цели.
✌️Разрабатывать свои программы и базы данных.
✌️Работать с производством и внедрять свои наработки.
#АгроГен
☑️ Подписаться
🙌Эй, ребята!
Мы вместе, как отмечено на канале Сила России (ВЕZ Фильтров), создаем мощную движуху! Каждый на своем месте: в школе, универе, на работе, в министерстве, в тракторе, в доильном зале или в лаборатории.
Мы строим Россию, которая будет топовой в генетике животных и растений, а не просто закупает, а сама продает свои технологии.
🎓 Обучение:
Нужно учить школьников, студентов и специалистов современным подходам, чтобы каждый уходил с реальными инструментами. И делать это все бесплатно и безопасно, через универы и курсы. Давайте вместе! 💪😊
🚀 Что нам надо сделать:
✌️Придумать свои фишки по работе с фенотипом, геномом, иммунитетом и эпигенетикой.
✌️Оценивать состояние организма с помощью крутых методов анализа.
✌️Создать систему, чтобы идентифицировать животных и генетические цели.
✌️Разрабатывать свои программы и базы данных.
✌️Работать с производством и внедрять свои наработки.
#АгроГен
☑️ Подписаться
💰 Новая технология, которая делает геномные исследования доступными для всех!
🇨🇳 Low-pass секвенирование — это крутая технология, которая делает геномные исследования в сельском хозяйстве более доступными и эффективными. Она помогает быстро находить известные генетические варианты, что обеспечивает селекцию растений и животных.
🧰Почему это популярно и важно?
💰 Доступно: Эта технология стоит дешевле, чем традиционные методы, поэтому её могут использовать как фермеры, так и ученые.
⚡️ Скорость: С ней можно быстро обрабатывать много образцов, что особенно полезно для крупных полевых проектов.
📊 Больше информации: Low-pass секвенирование дает больше данных в популяции с ущербом в сторону точности (0,5-5х покрытие), чем обычные геномные техники.
⏱️ Быстрые результаты: Рабочий процесс настроен так, чтобы получать результаты быстро, что помогает принимать решения в селекции сегодня и сейчас.
🔍 Точность: Предварительный прогноз о генах и селекционных признаках.
🚜Как это используется в сельском хозяйстве?
🐄 Селекция скота: Помогает селекционерам находить нужные признаки у животных на ранних стадиях, обязательно используя феном, иммуном, референт и повышая эффективность работы.
🌾 Устойчивость: Метод выявляет известные варианты генов, связанные с устойчивостью к болезням или повышенной продуктивностью.
🔬 Научные исследования: Используется в проектах, изучающих важные селекционные признаки у животных.
🌇Будущее на горизонте
🍽 Продовольственная безопасность: С учетом роста мирового спроса на продукты питания, Low-pass секвенирование может помочь увеличить темпы роста производства.
🌍 Экологичность: Эта технология помогает создавать новые породы, которые лучше справляются с вызовом промышленности и изменениями климата.
📈 Широкое применение: Ожидается, что она станет новым стандартом в агрогеномике, полезным как для крупных, так и для мелких хозяйств.
⚖️Сравнение с другими методами
♠️Low-pass секвенирование
➕Плюсы:
Дешево и сердито.
Быстро обрабатывает много образцов.
Позволяет выявлять только основные и ранее известные генетические вариации.
➖Минусы:
Низкая точность для новых генов.
Требует сложных методов импутации (биоинформатики и статистики) для точного анализа, обязательно нужны хорошие и актуальные референты типичных пород и подробные данные фенома.
Не подходит для анализа структурных изменений генома.
♣️Секвенирование 5x
➕Плюсы:
Более доступно, чуть дороже и чуть дольше, но дает достаточно информации.
Отличное качество прочтения генома, наилучшим образом подходит для полевых исследований, особенно при работе с генофондом.
Легко и быстро определяет новые генетические варианты.
Не нужно предугадывать варианты, не нужна импутация. простая сборка геномов, нужны только свои референты геномов прочитанные на высокой плотности секвенирования 30х для каждой породы отдельно .
➖Минусы:
Все еще может быть неточным для редких вариантов.
Дольше по времени, чем Low-pass секвенирование.
♦️Секвенирование целевое
➕Плюсы:
Очень недорого доступно, уже использовалось в геномике КРС, дешевле 5х и чуть быстрее, но дает информацию по нужным областям генома.
Легко и быстро определяет заданные генетические варианты, пригоден для контроля генного редактирования CRISPR.
Очень простая биоинформатика, но нужен хороший референт для исследуемой группы животных и типичные контрольные генотипы.
➖Минусы:
Считает только определенные гены, не видит весь геном.
Быстрее по времени, точнее, но менее информативно, чем 5х секвенирование.
♥️Секвенирование 30x
➕Плюсы:
Долго, очень высокая точность, включая поиск редкие вариантов по здоровью и продуктивности.
Позволяет глубокий анализ генов.
➖Минусы:
Дорого и все таки, не быстро, но зато по биоинформатике нет сложностей, никаких сложных моделей импутации и прогноза вариантов.
Много времени для подготовки и секвенирования.
Выбор между Low-pass, 5x и 30x секвенированием зависит от целей и бюджета. Low-pas секвенирование идеально подходит для предварительных исследований, а 5x и 30x лучше для регулярного анализа геномов. 🌟
#АгроГен #геномика
☑️ Подписаться
🇨🇳 Low-pass секвенирование — это крутая технология, которая делает геномные исследования в сельском хозяйстве более доступными и эффективными. Она помогает быстро находить известные генетические варианты, что обеспечивает селекцию растений и животных.
🧰Почему это популярно и важно?
💰 Доступно: Эта технология стоит дешевле, чем традиционные методы, поэтому её могут использовать как фермеры, так и ученые.
⚡️ Скорость: С ней можно быстро обрабатывать много образцов, что особенно полезно для крупных полевых проектов.
📊 Больше информации: Low-pass секвенирование дает больше данных в популяции с ущербом в сторону точности (0,5-5х покрытие), чем обычные геномные техники.
⏱️ Быстрые результаты: Рабочий процесс настроен так, чтобы получать результаты быстро, что помогает принимать решения в селекции сегодня и сейчас.
🔍 Точность: Предварительный прогноз о генах и селекционных признаках.
🚜Как это используется в сельском хозяйстве?
🐄 Селекция скота: Помогает селекционерам находить нужные признаки у животных на ранних стадиях, обязательно используя феном, иммуном, референт и повышая эффективность работы.
🌾 Устойчивость: Метод выявляет известные варианты генов, связанные с устойчивостью к болезням или повышенной продуктивностью.
🔬 Научные исследования: Используется в проектах, изучающих важные селекционные признаки у животных.
🌇Будущее на горизонте
🍽 Продовольственная безопасность: С учетом роста мирового спроса на продукты питания, Low-pass секвенирование может помочь увеличить темпы роста производства.
🌍 Экологичность: Эта технология помогает создавать новые породы, которые лучше справляются с вызовом промышленности и изменениями климата.
📈 Широкое применение: Ожидается, что она станет новым стандартом в агрогеномике, полезным как для крупных, так и для мелких хозяйств.
⚖️Сравнение с другими методами
♠️Low-pass секвенирование
➕Плюсы:
Дешево и сердито.
Быстро обрабатывает много образцов.
Позволяет выявлять только основные и ранее известные генетические вариации.
➖Минусы:
Низкая точность для новых генов.
Требует сложных методов импутации (биоинформатики и статистики) для точного анализа, обязательно нужны хорошие и актуальные референты типичных пород и подробные данные фенома.
Не подходит для анализа структурных изменений генома.
♣️Секвенирование 5x
➕Плюсы:
Более доступно, чуть дороже и чуть дольше, но дает достаточно информации.
Отличное качество прочтения генома, наилучшим образом подходит для полевых исследований, особенно при работе с генофондом.
Легко и быстро определяет новые генетические варианты.
Не нужно предугадывать варианты, не нужна импутация. простая сборка геномов,
➖Минусы:
Все еще может быть неточным для редких вариантов.
Дольше по времени, чем Low-pass секвенирование.
♦️Секвенирование целевое
➕Плюсы:
Очень недорого доступно, уже использовалось в геномике КРС, дешевле 5х и чуть быстрее, но дает информацию по нужным областям генома.
Легко и быстро определяет заданные генетические варианты, пригоден для контроля генного редактирования CRISPR.
Очень простая биоинформатика, но нужен хороший референт для исследуемой группы животных и типичные контрольные генотипы.
➖Минусы:
Считает только определенные гены, не видит весь геном.
Быстрее по времени, точнее, но менее информативно, чем 5х секвенирование.
♥️Секвенирование 30x
➕Плюсы:
Долго, очень высокая точность, включая поиск редкие вариантов по здоровью и продуктивности.
Позволяет глубокий анализ генов.
➖Минусы:
Дорого и все таки, не быстро, но зато по биоинформатике нет сложностей, никаких сложных моделей импутации и прогноза вариантов.
Много времени для подготовки и секвенирования.
Выбор между Low-pass, 5x и 30x секвенированием зависит от целей и бюджета. Low-pas секвенирование идеально подходит для предварительных исследований, а 5x и 30x лучше для регулярного анализа геномов. 🌟
#АгроГен #геномика
☑️ Подписаться
🎧Музыка без границ🎼
или обещанные два клипа группы Смысловые галюцинации
💽Все будет волшебно
💽Без стюардесс
🎥Обязательно к просмотру и репосту!
#музыка
☑️ Подписаться
или обещанные два клипа группы Смысловые галюцинации
💽Все будет волшебно
💽Без стюардесс
🎥Обязательно к просмотру и репосту!
#музыка
☑️ Подписаться
🚀🧬 Секвенирование нового поколения: какое выбрать , как работает и зачем нам это нужно?
При секвенировании нового поколения (NGS) первичными данными являются "сырые" последовательности ДНК или РНК, которые мы получаем в процессе.
Риды — это короткие кусочки ДНК, которые мы "прочитали" из образца. Чем больше ридов, тем больше информации!
✅Качество ридов — для каждого рида есть оценка, насколько точно мы его прочитали. Это помогает понять, насколько надежные данные.
〽️Метаданные — это всякие дополнительные инфы о пробах и условиях, при которых проводилось секвенирование.
♻️Эти данные потом обрабатываются, чтобы получить полную картину генома или транскриптома. В общем, это как "черновик" для дальнейшего анализа!
💡 Результаты обработки: Всё, что мы получаем после анализа, — это уже не первичные данные. Например, в low pass NGS качество данных может сильно меняться.
🔬 Чипы и генотипы: Генотипы — это вторичные данные. Они получаются из флуоресценции, фиксируемой на чипе. То есть, она уже потом про помощи ключа расшифровки и карты чипа переводится в генотип. Здесь тоже все очень зависит от качества чипа. Флуоресценция — это не сам генотип!
📊 Секвенирование: Первичные данные здесь — это флуорохроматограммы, которые показывают, как выглядит ДНК.
Мы сейчас не говорим про импутацию данных и что это такое, но обязательно вернёмся к этому вопросу позднее 🚀✨
#геномика #АгроГен
☑️ Подписаться
При секвенировании нового поколения (NGS) первичными данными являются "сырые" последовательности ДНК или РНК, которые мы получаем в процессе.
Риды — это короткие кусочки ДНК, которые мы "прочитали" из образца. Чем больше ридов, тем больше информации!
✅Качество ридов — для каждого рида есть оценка, насколько точно мы его прочитали. Это помогает понять, насколько надежные данные.
〽️Метаданные — это всякие дополнительные инфы о пробах и условиях, при которых проводилось секвенирование.
♻️Эти данные потом обрабатываются, чтобы получить полную картину генома или транскриптома. В общем, это как "черновик" для дальнейшего анализа!
💡 Результаты обработки: Всё, что мы получаем после анализа, — это уже не первичные данные. Например, в low pass NGS качество данных может сильно меняться.
🔬 Чипы и генотипы: Генотипы — это вторичные данные. Они получаются из флуоресценции, фиксируемой на чипе. То есть, она уже потом про помощи ключа расшифровки и карты чипа переводится в генотип. Здесь тоже все очень зависит от качества чипа. Флуоресценция — это не сам генотип!
📊 Секвенирование: Первичные данные здесь — это флуорохроматограммы, которые показывают, как выглядит ДНК.
Мы сейчас не говорим про импутацию данных и что это такое, но обязательно вернёмся к этому вопросу позднее 🚀✨
#геномика #АгроГен
☑️ Подписаться