​​Действительно важная новость почти про вирусы

Есть такая генетическая болезнь - спинально-мышечная атрофия (СМА).

Болезнь передается по наследству. Родители могут быть носителями дефектного гена, но при этом не болеть СМА, если вторая копия гена здорова (примерно 2% населения). При этом если оба здоровых родителя обладают дефектным геном, с вероятностью 25% родится больной ребенок. Итого примерно каждый 10 000ный ребенок рождается СМА.

Дети с тяжелыми формами СМА живут буквально несколько лет (половина не доживает до 2х лет).

Переходим к самой новости:

Болезнь была неизлечимой до недавнего времени. Летом 2019 компания AveXis зарегистрировала первое лекарство от СМА. Торговое название - Zolgensma.

Само по себе лекарство дико интересное - оно представляет из себя оболочку аденоассоциированного вируса AAV9, в которую затолкали здоровую копию гена, поломанного при СМА. То есть грубо говоря пациентам вводят вирус, который “инфицирует” больные клетки пациентов здоровым геном.

Первым же шоком стала цена - одна инъекция стоит $2,1 млн + $400 тысяч за реабилитацию. Благо одной инъекции достаточно, чтобы вылечиться.

Ценник кажется оправданным: учитывая сложность разработки лекарства, поиска добровольцев для тестирования и тп. В конце концов сейчас лекарство выпускает Новартис, который купил AveXis за $8,7 млрд - им надо как минимум отбить эту сумму.

Оправились от ценника? Не спешите расслабляться - FDA одобрил лекарство только для детей до 2х лет. То есть после родов у родителей есть всего 2 года чтобы диагностировать болезнь - от осознания, что ребенок слабый, до специфических генетических тестов. А за оставшееся время надо собрать вышеупомянутые $2,5 млн. И все это надо сделать, пока ребенку не исполнилось 2 года. Иногда день рожденья - действительно грустный праздник.

Идем дальше: в Новартисе осознали, что большинству это не по карману, и организовали лотерею: 100 человек, выбранные случайным образом, независимо от гражданства получат лекарство за счет Новартиса. Новость о лотерее вызвала большой резонанс. Неравнодушные разделились на два лагеря: с одной стороны вылечится больше больных, с другой стороны вероятность выиграть в лотерее ничтожная - у многих появляется ложная надежда.

Вся история развивалась по перечисленным пунктам в течение второй половины 2019 года. Помимо перечисленных тезисов были заголовки поменьше - например на определенной стадии разработки у лекарства нашли возможный токсичный эффект, который скрывали от FDA - в итоге в компании производителе полетели головы…

Например мне как человеку далекому от генетики интересно, будет ли Zolngensma передаваться по наследству? Ведь если нет, то с каждым поколением препарат придется вводить все большему количеству детей.

В новости есть все: социальная важность, интересная наука, предпринимательство, шокирующие цифры, моральные вопросы - ее можно было по-разному рассматривать с людьми из разных областей деятельности.

Как после такого детектива можно целый месяц обсуждать какие-то коронавирусы…

Кстати в России тоже болеют СМА. Из-за огромной цены над этим работают некоторые фонды. Честно не знаю, каким фондам можно доверять, кроме совсем известных типа Алешковского. Поэтому если можете и хотите как-то помочь, можете посмотреть вот этот материал новой газеты и дальше решайте сами: https://novayagazeta.ru/articles/2020/02/14/83907-ukol-sovesti

Всем добра,
Тг

#научпоп

​​When the shit hits the fan…

Прошлая неделя началась с разрыва моей рабочей почты: около 20 сообщений содержали в заголовке закапслоченное CANCELED. Еще столько же сообщали о переносе событий. Возглавляли список два письма - обращения ректора и декана. Это могло означать только одно - в Нью-Йорке нашли коронавирус.

И тут я понял, что рано написал пост про новую болячку - надо было действительно дождаться зарегистрированных случаев в Нью-Йорке, чтобы описать местную реакцию.

Активные меры у нас принимались в течение марта. Давайте по пунктам.

Среда, 4 марта:

⁃ Запрещены деловые поездки для студентов и сотрудников, работающих с пациентами.

Понедельник, 9 марта:

⁃ Отменены все лекции и семинары с приглашенными спикерами.
⁃ Переведены в онлайн все регулярные занятия. Благо у универа отлично налажена система онлайн-семинаров.
⁃ В госпитале работают только врачи, студентов-медиков к пациентам не допускают.

Вторник, 10 марта:

⁃ Запрещены деловые поездки для всех студентов и сотрудников универа.
⁃ Запрещены мероприятия более 25 человек, официально организованные через университет.

Среда, 11 марта:

⁃ Научная деятельность продолжается, но лаборатории по максимуму должны работать удаленно: в лабу приходить только для экспериментов, все остальное через университетский VPN.

В процессе наш декан вспомнил, что он пульмунолог, и начал записывать мотивирующие видео-обращения.

Воскресенье, 15 марта:

⁃ Объявлено о полном закрытии исследовательских лабораторий с 20 марта (оценочно на 6-8 недель). Потом могут приходить только сотрудники, которым нельзя в карантин: например для ухода за лабораторными животными.
⁃ В госпитале перенесены на неопределенный срок все несрочные плановые операции и другие процедуры.

О последнем поподробнее. Коронавирус коронавирусом, но пациенты с другими болячками никуда не делись. Из-за ̶м̶у̶д̶а̶к̶о̶в̶,̶ ̶к̶о̶т̶о̶р̶ы̶е̶ ̶р̶е̶ш̶и̶л̶и̶ ̶п̶о̶и̶г̶р̶а̶т̶ь̶ ̶в̶ ̶э̶п̶и̶д̶е̶м̶и̶ю̶,̶нехватки стерильных масок и перчаток, отменены все несрочные операции. Вчера госпиталь уже запросил маски и перчатки из запасов исследовательских лабораторий. Причем с дикарями, скупающими маски, еще можно смириться - в конце концов имеют право - но с недавнего времени маски стали воровать прямо из госпиталя!

Но в целом приятно наблюдать, что общество может довольно грамотно активизироваться при угрозе эпидемии респираторной инфекции - пусть для этого и нужен медийный пинок. Люди с симптомами осмысленно сидят дома/идут к врачу, бары/рестораны закрываются для посетителей и принимают только заказы с доставкой, банки и налоговики идут на встречу клиентам, чтобы те лишний раз не выходили на работу и тп.

На мой взгляд многие меры избыточны - для стабилизации должно хватить стандартных мер гигиены и карантина как при эпидемии гриппа (только чтоб им реально следовали). Но хорошо, что мы протестировали такую глобальную мобилизацию на ерундовом вирусе, и, если в следующий раз появится что-то серьезное а-ля вирус оспы 2.0, у нас есть шанс быстро выровнять ситуацию.

Всем здоровья,
Тг

#научпоп

​​Универсальный Беломорканал

- в конце поста объявление для тех, кто в Нью-Йорке;

Начал пролистывать свои заметки для будущих постов с мыслью, что сейчас разом все напишу и опубликую за время, освободившееся в самоизоляции.

И тут понял, что все темы потеряли актуальность - любой пост пройдет мимо, если в нем не будет новых цифр по ковид19, очередного “глубинно-экспертного анализа” карантина, или 10 упражнений с собственным весом для дома.

По-этому давайте пофантазируем.

Есть байка, что папиросы Беломорканал в Союзе выпускали диаметром 7,62 мм, чтобы можно было быстро переоборудовать сигаретный завод на производство патронов соответствующего калибра. Не разбираюсь ни в сигаретах, ни в патронах, но, если интересно, в интернетах полно с̶р̶а̶ч̶е̶й̶ экспертной аналитики за и против теории макарон-гильз, бутылок-винтовок, урн-пусковых шахт для ракет. Тем не менее даже если это байка, мысль все равно дельная.

Наверно можно разработать экстренный план переоборудования почти для любой области. Например Илон -вкаждойбочкезатычка- Маск (это я любя) твитнул на этой неделе, что Tesla Gigafactory 2 (на востоке штата НЙ) начинает выпускать аппараты искусственной вентиляции легких.

Так как я все про науку, мне стало интересно, как можно адаптировать эту индустрию в случае той же эпидемии. И понял, что это не так то просто. Научное оборудование дико дорогое, но очень часто довольно специфичное. Иногда приборы собирают лишь для одного единственного эксперимента. Тот же большой адронный коллайдер сейчас - просто дорогой памятник архитектуры, на который даже посмотреть нельзя.

Не знаю, чего именно не хватает больницам помимо аппаратов ИВЛ и предметов личной защиты. Из того, что пришло в голову, в данной ситуации из лабораторной утвари могут пригодиться лишь:

- центрифуги (чтобы разделять кровь)
- аппараты для ПЦР в реальном времени (чтобы проводить тесты на вирус)
- средства защиты (халаты, маски, перчатки)

Остальные 99% высокотехнологического оборудования, которое в общей сложности стоит много миллионов долларов, никак не переквалифицируется.

Благо можно переквалифицировать мозги. Сам видел, как физик-лазерщик через две недели практики спокойно ставил эксперименты по нейробиологии. Конечно есть очень специфические умения, на освоение которых уходит больше времени.

Наш универ пока делает запросы, которые не требуют переучивания:

- Люди с опытом работы с ПЦР в реальном времени
Чтобы проводить тесты на вирус.
- Биоинформатики
Наверно шерстить библиотеки с векторами и рецепторами вирусов (не знаю, что может делать целая армия биоионформатиков с одним вирусом).
- Работа с литературой
Составить общую картину из множества опытов и публикаций, если возникает вопрос по вирусу или по болезни.
- Консультации общественности
Слишком много слухов и недопониманий, которые порождают панику. Врачи сейчас заняты, так пусть хоть ученые занимаются разъяснительной работой.
- Образование
Все школы на удаленке. И тут освободилась целая толпа людей, которые шарят в своем предмете. Значит их можно запрячь учить школьников и студентов онлайн.

Все на волонтерской основе: не хочешь – не делай.

Наверно этот подход и есть наиболее продуктивный: наука может брать на себя большую часть образовательных функций, как Тесла собирает аппараты ИВЛ, а Беломорканал – патроны.
Кстати раз все выкладывают свои виртуальные летучки, я тоже поддамся тренду)

Всем добра,
Тг

#научпоп

————————
Если вы или ваши знакомые живут в Нью-Йорке, переболели COVID19 и уже вылечились, у вас в крови до сих пор может быть много антител на него. Тогда вы можете стать донором плазмы, чтобы перелить антитела тяжелым пациентам. Если вы подходите, у вас возьмут тест на антитела и в случае положительного результата предложат стать донором. Подать заявку можно тут: https://bit.ly/2vTHALk
————————

​​Палочная система

Кто больше всего страдает от научных исследований? Правильно - мыши. Только в США убивают примерно 100 миллионов лабораторных мышей в год (данные PETA). Да и сама жизнь у них не сахар: одним отключают иммунитет, вторым втыкают кучу проводов прямо в мозг, третьим регулярно бьют по голове.

Смотришь на все это, и мышек становится жалко. Когда жалеющих набирается определенная критическая масса, начинаются попытки урегулировать мышиный геноцид.

Далее с рассказов старших коллег…

Сначала правительство (речь о Франции) просто поставило жесткую квоту на потребление мышей на лабораторию. Каждая лаба могла использовать, скажем, 10 мышей в год. То есть если для вашего исследования нужно 100 мышей, исследование автоматически становилось невыполнимым. При этом вы все равно брали 10 положенных мышей в надежде, что хоть что-то из этого выйдет, и с опаской, что в следующий раз и 10 не дадут. Ожидаемо такие исследования проваливались из-за недостатка мышей. Выходит те 10 квотированых мышей умерли зря?

Поняв, что квота не работает, научные управленцы поменяли подход. Сейчас вы пишете в гранте, сколько вам надо животных с обоснованием, почему столько. Дальше комиссия по грантам должна одобрить эту цифру. С таким подходом животных умирает больше, но от этого есть результат. В случае с квотами мыши чаще всего умирали безрезультатно.

Вообще подобная палочная система свойственна многим некоммерческим структурам. Чаще ее ассоциируют с полицией или медициной. В первом случае в качестве KPI берут раскрываемость - когда надо оштрафовать 10 человек в день. В случае с медициной иногда надо, чтобы на участке было 1000 подозрений на перелом: ровно на столько рентгенов выделили денег из бюджета.

В случае с полицией и медициной это еще можно попытаться оправдать фразами: “…у нас есть статистика…”, “…так бюджет проще планировать…”. Но палочная система в науке - действительно сомнительная затея.

Эта палочность пролезла в кучу показателей, которыми пытаются померить эффективность ученого: от цитируемости и рейтингов журналов до индексов Хирша. Часто научные чиновники забывают про важность самих исследований и пытаются набрать как можно больше очков, баллов, коэффициентов и тп.

Желание измерить науку линейкой понятно. Только в США на исследования выделяют 0,5 трлн долларов в год из федерального бюджета (2016 год, википедия) - хочется понять, насколько эффективно потратили деньги.

Если вернуться к мышкам, система с комиссией работает неплохо. Я считаю, что также должно быть во всей науке - ее должны оценивать люди, а не баллы. Да, живые люди добавляют предвзятость. Да, это может усилить научные лобби. Но и первое, и второе лечится качественным контролем самой проверяющей комиссии.

Слышал, что палочностью сейчас грешат китайские НИИ. В США (и в меньшей степени в Европе) от этого уже отходят в пользу научных комиссий.

Всем легкого карантина,
Тг

#научпоп

​​Пора валить

Особенно актуальная тема, когда все границы закрыты (сарказм).

Давно пытался написать этот пост, но наконец-то мне помог его сформулировать фильм Дудя про Кремниевую долину (https://youtu.be/9lO06Zxhu88, особенно на 2ч 39мин и 2ч 48мин).

С момента запуска блога треть сообщений в личку прилетает именно про мой опыт переездов. В большинстве случаев из диалога становится понятно, что спрашивают с целью “свалить из Рашки”.

Давайте разбираться.
Я ни разу в жизни не переезжал в новый город/страну ради переезда. У меня всегда были цели “научиться чему-то” или “сделать что-то” без привязки к локации. Дальше я искал место в мире, где можно сделать это/научиться этому лучше всего.

Не считая коротких стажировок в моей жизни было три глобальных переезда:
Екатерибург -> Москва -> Марсель -> Нью-Йорк

-> Москва
Переезд в Москву еще как-то совмещал в себе и цель — ХимФак МГУ, и просто желание пожить в Москве.

-> Марсель
Там была самая передовая лаборатория в интересующей меня области. Сначала я заинтересовался публикациями лаборатории, а потом узнал, что это во Франции.

-> Нью-Йорк
В определенный момент стало понятно, что многие интересующие меня проекты делаются на восточном побережьи США, и поэтому именно там должна быть моя следующая остановка после Марселя. Совпадение — через несколько недель пришло предложение переехать в Нью-Йорк как раз по интересующей теме. Пост про мою аспирантуру в Нью-Йорке: https://yangx.top/grigorytagiltsev/17.

Конечно есть люди, которых карьера интересует в меньшей степени — это нормально. Может их привлекает стиль жизни и культура той же Франции. Такие люди понимают, что они едут жить не в туристические декорации, а в обычный французский район со своими плюсами и минусами. Они понимают, что их ждут другие социальные нормы, законы, бюрократия, медицина… Их привлекают все мелочи новой жизни вплоть до того, что они даже ворчать начинают как французы. Такие люди действительно становятся счастливее в среде, которая им больше подходит.

При переезде должен быть либо четкий карьерный ориентир, либо осознание, что новое место вам подходит. В противном случае есть риск превратиться в тех анекдотичных русских эмигрантов, которые сами себя заперли на Брайтоне — маленьком клочке Бруклина размером в две улицы — и варятся там в собственном соку десятилетиями.

Но не стоит путать “билет в один конец” с опытом жизни за границей — каждому полезно пожить пару лет в других странах — это невероятно расширяет кругозор и прокачивает жизненный опыт.

Подытожу фразой Андрея Дороничева из фильма про Долину: “Ехать надо не от чего-то, а к чему-то”.

Всем добра,
Тг

#карьера
#образование

​​Онлайн-костыль

На днях слушал невероятно унылый полуобязательный семинар — слушать не хотелось, а отключаться неприлично. По понятным причинам вещали по зуму. На 9й минуте мне это надоело и, сделав звук семинара потише, я сел играть в фифу.

Конкретно этот семинар не спасло бы даже живое выступление. Но многие преподаватели действительно отмечают, что поддерживать диалог с аудиторией и удерживать ее внимание гораздо проще вживую. В онлайн-лекциях теряется некая тактильность — нельзя посмотреть студенту в глаза, пропадает эффект от жестикуляций.

Математики и физики вдруг заметили, что им не хватает зеленой доски. Доказательство теоремы выглядит куда эффектнее, если отстукивать его мелом. Видимо из-за этого многие не любят писать формулы маркером.

Студенты тоже отмечают, что онлайн-лекции усваиваются сложнее. Я их понимаю: у меня триггером концентрации был утренний забег от мгушных общаг через сквер на Воробьевых до ХимФака, когда опаздывал на пары.

Создать полноценное онлайн обучение пытались и до карантина: edx, udemy, универсариум — всегда получался клон курсеры. Во всех случаях преподаватель просто берет свой офлайн-курс и записывает его на видео или наговаривает через вебку в случае зума.

Домашние задания тоже концептуально не поменялись — вы делаете то же самое, что и на бумаге, только на компьютере.

Все это работает как костыль (иногда вынужденный):
Мы переносим в интернет классическое образование со всеми его недостатками. Еще и теряем по пути часть достоинств (см. пост про устаревшую систему образования: https://yangx.top/grigorytagiltsev/135).

Можно пофантазировать над альтернативами будущего:
Например нейросеть, которая заменит учебник по математике. Изучив студента, она выдаст ему максимально понятное объяснение логарифмов. А потом будет подсовывать оптимизированные задачки. И каждую следующую задачу она будет генерить на основе предыдущих решений студента.

Завершу мыслью Андрея Себранта (@techsparks), менеджера по маркетингу Яндекса, о том, что возможно следующая компания-гигант размером с гугл или фейсбук вырастет именно в области образования, если такая компания сможет решить существующие проблемы.

ЗЫ. опять не придумал фотки в тему, поэтому зацените, как круто выглядят карантинно-пустые футбольные поля на Randall’s Island (остров в Нью-Йорке).

Всем добра,
Тг

#образование

​​HSS — госпиталь для поломанных и изувеченных

Недавно ощутил на себе, что значит перегруженность системы здравоохранения.

Пока все нормальные люди болеют ковидом, я сломал ногу. Дело было в воскресенье — открыты только emergency rooms, забитые ковидниками. В ренген-кабинетах тоже ковидники — чтобы сфоткать легкие. Пришлось ждать понедельника.

Благо один из госпиталей в нашем кампусе — Hospital for Special Surgery (HSS) — специализируется только на ортопедической хирургии, никаких инфекций. Это один из самых крутых госпиталей в мире по лечению травм — повезло мне со страховкой.

Госпиталь очень старый — основан еще в 1863 году. Тогда он назывался Hospital for Ruptured and Crippled — в голове перевелось как “Госпиталь для поломанных и изувеченных”.

Многие врачи — бывшие спортсмены и терапевты профессиональных спортивных команд. Например мой лечащий врач — бывший триатлонист, был врачом команды New York Jets (футбольный клуб такой).

Кто занимается спортом, знают такую проблему:
Приходите к травматологу с жалобой из серии “боль в колене во время приседа”. Часто врач просто советует: “не приседай” или “приседай без веса”. Крутость госпиталя со спортивным уклоном в том, что врачи учитывают вашу спортивную деятельность и пытаются вернуть к полноценным нагрузкам.

Перед первым приемом вы заполняете анкету с вашими видами спорта и примерным графиком тренировок. При восстановлении после травмы врачи дают советы по возвращению к тренировкам по каждому виду спорта. Цель — вернуть тело к производительности как до травмы — без всяких “не приседай”. Раньше я уже лечил здесь спортивные травмы — и лечение, и реабилитация проходили на ура.

Во время пандемии госпиталь принимает только по записи и только людей без простуды. На входе меня опросили по симптомам ковида и проверили температуру. Наклеили значок, сообщающий, что я чист. Дальше какой-то сложной логистикой возили по отделению, чтобы не пересекать с другими пацентами. Дополнительно проверяли температуру перед тем, как завести в рентген-кабинет и увидеть врача.

Логистика выглядела так, как-будто защищали в первую очередь врача, чтобы я его не заразил. Это правильно: сейчас врачи — самый дорогой ресурс.

Вместо гипса надели какой-то модный пневматический ботинок (на фото, извиняюсь за торчащие пальцы) и выдали костыли — через пару месяцев опять буду бегать.

Посты по теме
Про emergency rooms:
https://yangx.top/grigorytagiltsev/85
Про наш раковый центр (еще один известный госпиталь в нашем кампусе):
https://yangx.top/grigorytagiltsev/99

Всем добра,
Тг

#кампус

​​Выходим из анабиоза

Наш универ возвращается к жизни. Кампус был закрыт для нековидных исследований с 20 марта. И вот ректор выступил с отчетом по карантину и планом возвращения к нормальной жизни.

Результаты карантина:

15% — смертность реанимированных с ковидом в нашем госпитале (в интернете разные цифры по Нью-Йорку, в основном выше 20%).

Из-за нехватки медперсонала многие врачи приехали в Нью-Йорк из других городов волонтерами. Их расселили в отелях. Каждый день служебные автобусы толпились вокруг госпиталя, чтобы развозить медиков (на фото). Несколько раз видел, как им расчищают дорогу полицейские мигалки.

На 90% сократилось количество оказываемых медуслуг. Несрочные плановые медуслуги отменены до конца карантина.

$200 млн — невозвратные убытки универа за первые 90 дней карантина.

При этом универ выплачивал зарплаты всем врачам и ученым вовремя и в полном объеме.

Из-за убытков пришлось достать часть сбережений из инвестиций университета (в США универы вкладываются в недвижимость, ценные бумаги и тп — чтобы не жить от гранта к гранту). Также универ сократит найм новых сотрудников в последующие годы.

Ожидается вторая волна убытков — универ явно получит меньше пожертвований во время предстоящего кризиса. Ректор гарантировал продление контрактов постдокам и дополнительное время для защиты студентам — чтобы все смогли довести до ума свои научные проекты.

К счастью, государство в лице NIH полностью выплачивало все текущие гранты, несмотря на то, что многие исследования встали на время карантина.

План перезапуска:

Сейчас лаборатории ведут подготовку к началу работы. Я уже был в лабе два раза — проверить доставки и перезапустить оборудование. На входе в универ выдали чистую маску. Санитайзеры висели по всему кампусу и до эпидемии.

С 1 июня лабы возвращаются к исследования в кампусе. Одновременно в лабе может находиться до 25% персонала (пока только в масках). Остальные продолжат на удаленке.

В течение лета этот лимит будут повышать с сохранением социального дистанцирования — все летучки и семинары только по зуму еще несколько месяцев.

Все обучение остается на удаленке. Возможно удаленку продлят и на осенний семестр.

Всем добра,
Тг

#кампус

Непопулярная наука

О чем обычно рассказывают научпоп-ресурсы? О медицине, социальных и психологических закономерностях, о всяких интересностях из мира животных и, конечно же, о космосе.

При этом многие горячие темы, регулярно попадающие в Nature и Science, остаются менее заметны для широких масс.

Не хочу показаться обделенным, но таковой мне кажется моя область исследований. Благо у меня есть блог, где я могу о ней рассказать=)

Я изучаю, как устроены мембранные белки в живых клетках. Пока звучит максимально скучно, но скоро будет интересно.

Немного скучного бэкграунда:

Наши с вами клетки окружены мембраной. Она не проницаема для большинства веществ. В мембране есть специальные девайсы — мембранные белки — которые регулируют обмен этих самых веществ с окружающей средой.

В популярной науке часто рассказывают, за что отвечают эти белки: запускают сердцебиение, пропускают нервный импульс, активируют все наши чувства от зрения и вкуса до жажды и сонливости. На картинках их упрощенно отмечают всякими палочками и ромбиками. Но сама структура и механизм работы этих белков тоже невероятно интересны.

Интересное начинается здесь:

Эти белки используют разные крутые механизмы, чтобы протащить вещества сквозь мембрану.

Например в наших нейронах есть мембранные белки, которые представляют из себя миниатюрную кабину лифта (синяя штука на фото, тык). У этого лифта есть две открывающиеся двери. В кабине есть несколько стульев, на которых как пассажиры рассаживаются молекулы. Каждая молекула может сесть только на стул соответствующей формы. Когда все пассажиры сели, двери закрываются, и кабина лифта спускается по лифтовой шахте сквозь мембрану. Спустившись “на этаж ниже” двери открываются, “пассажиры” выходят.

На этом магия не заканчивается. В кабине автоматически выставляется другой набор стульев, и другие молекулы садятся в кабину. Двери опять закрываются, кабина едет вверх. Цикл полностью автоматизирован — нет никакого лифтера, который это контролирует.

Чтобы вы представляли размеры, эти молекулярные лифты меньше обычных лифтов во столько же раз, во сколько обычные лифты меньше Солнца. Как и обычный лифт, их молекулярные аналоги могут ломаться. Только вот такие поломки наблюдаются в серьезных патологиях: шизофрения, нейродегенеративные заболевания (Альцгеймер, Хантингтон), наркотические зависимости и тп.

На этом чудеса мембранных белков не заканчиваются.

Возьмем чувство холода. Его запускают белки, которые напоминают дверь со специальным “электромагнитым сенсором”, реагирующим на холод (клац)). Как и многие двери, их можно взломать отмычкой подходящей формы. Хорошо подходит молекула ментола. Поэтому от жвачки с ментолом во рту холодно, хотя сама жвачка не холодная.

Это лишь два примера из кучи вычурных механизмов разных мембранных белков.

Все эти приблуды интересны для двух целей:

1. Многие болезни связаны с неправильной работой мембранных белков. Поняв, как они работают, можно придумывать лечение.
2. Биомиметика: мембранные белки — это наикрутейшие нанодевайсы. Зачем изобретать велосипед, если он уже есть в природе?

Вот такие интересные штуки я изучаю на работе.

ЗЫ.
Давно обещал рассказать про фотку черной дыры, но так и не смог написать об этом лаконично. Вот лучшее объяснение, которое я видел: оригинал - англ, перевод - рус.

Вопрос:
Раньше я пробовал писать посты про популярную науку (тык1,тык2), но потом увлекся рефлексированием.
Хотите вернуть посты с краткими обзорами интересных научных тем?

Всем добра,
Тг

#научпоп

​​Аффтар, выпей йаду

В школе я больше всего ненавидел сочинения. В чем заключалось задание:

⁃ Высказать “свое” мнение. Кто ты такой, чтобы не соглашаться с Достоевским?
⁃ Написать текст на 4 страницы. Если уложился в две, надо было долить воды.
⁃ Написать согласованный текст. Оценивалось по логичной разбивке на абзацы.

Хоть задание и сомнительное, но цель благая — научиться писать, то есть письменно формулировать мысли. Меня заставляли писать сочинения вплоть до 11 класса. Вплоть до 11 класса я тиражировал четырехстраничные блоки нечитаемого кала (еще и с ошибками).

То есть писать не научился.

И вот с таким бэкграундом через 8 лет после окончания школы я решил не просто писать, но и обременять своей письменностью других. Так появился этот блог.

Сейчас блогу уже два года. Виртуозным текстоплетом я так и не стал, но по моим ощущениям, читабельность текстов за это время ощутимо выросла.

Почему личный блог оказался эффективнее сочинений по литературе?

Видавшие виды редакторы как правило дают один и тот же совет: чтобы научиться писать, надо писать. Много писать. Ну и читать хорошие тексты.

Чтобы много писать, вам должно быть интересно. В школе меня мало волновали страдания Наташи Ростовой. Да и сейчас есть темы позанятнее. Написание текстов на интересующие темы, наоборот, превратилось в хобби. Как результат я стал читать больше качественно написанных блогов, статей, и книг.

Именно в это время я подсел на Довлатова. Он точно знал, как написать сочный текст, после прочтения которого хочется откинуться на подушку и закурить. После моих школьных сочинений же хотелось просто откинуться.

Так почему бы ученикам просто не дать писать на интересующие их темы?

Зашел новый сингл? Расскажи об этом. Посмотрел новый фильм Дудя? На пару сочинений хватит. Стримил с акции протеста? Этого прорвет страниц на 10.

В таком случае учителю нужно лишь успевать модерировать текст: давать советы по структуре и стилю, указывать на корявые формулировки — чтобы качество текстов действительно улучшалось.

Носитель тоже не так важен: бумага, текст в ворде, заметка, накарябанная стилусом — пусть работают, как удобно. Пусть хоть в соцсетях постят.

Если вы уже закончили школу, все равно пишите. Интернет вам на что? Умение писать — нужный скилл, от статей и заявок на проекты, до конструктивных споров в твиттере.

В догонку мой старый пост про Довлатова и Нью-Йорк:
https://yangx.top/grigorytagiltsev/114

И по традиции фоточка не в тему поста: наши студенты-медики давали клятву Гиппократа на прошлой неделе по зуму. Хотя этим уже никого не удивить.

Всем добра,
Тг

#образование
#советдня

Навигация по каналу

Всего лишь два года ушло на то, чтобы я дочесал все, что чесалось, и наконец-то составил навигацию по каналу.

За это время здесь было опубликовано 150 постов. Я отсортировал их по темам и составил список хештегов. Навигация будет допиливаться по мере равзития канала. Если знаете, как можно улучшить — велкоме с критикой: @TagiltsevSupportBot.

🔸Навигация по темам тут:
https://telegra.ph/tgblog-navigate-06-06

🔸Хештеги:

#научпоп — о проблемах науки и научная публицистика вперемешку
#образование — посты про образование
#карьера — посты про карьеру
#советдня — советы для повышения конкурентоспособности
#кампус — о кампусе, в котором я работаю
#чёпочём — цены в Нью-Йорке
#бумажкивсша — о бюрократии, с которой я сталкиваюсь за рубежом
#франция — про учебу во Франции

Кому лень копаться в навигации, отобрал для вас три старых поста:

🔹О восприятии культурно чуждых праздников при жизни за границей
тык

🔹История о том, как геном одной скончавшейся пациентки попал в общий доступ
тык

🔹Рак — болезнь, которую боятся называть
тыгыдык

Всем приятного чтения,
Тг

​​Науказбс

Этот канал читает много людей, как просто интересующихся наукой, так и занимающихся ею профессионально. Давайте совместим интересы одних и знания других.

Работаешь над самым крутым проектом (а иначе зачем вообще заниматься наукой?) и хочешь рассказать о нем миру? Напиши мне через бота @TagiltsevSupportBot.

Интересные проекты опубликую на этом канале (анонимно или с указанием имени — по желанию автора). Отличный шанс прорекламировать свое исследование для одних и узнать, на какие это разработки мы отдаем налоги, для других.

Можно отправлять не только фундаментальную науку. Создаешь мудреные нейросетки? Запускаешь ракеты в космос? — все это подходит.

Что писать в сообщении:

1. Тему проекта
2. Краткое описание
3. Добавь фразу “науказбс” в тексте первого сообщения, чтобы я мог искать по тексту

Выберу интересное, дальше вместе напишем текст и оформим в виде поста. Отбор будет жестче, чем на обложку Nature. Чтобы не забивать канал, подобные посты будут выходить 1-3 раза в месяц.

Посты по этой теме будут отмечаться хештегом #науказбс.

Ну и в кои-то веки картинка в тему. Эта размытая серая клякса привела к одному из основных научных открытий 20го века. Кто знает, что это такое? Расскажу в следующем посте.

Всем добра,
Тг

​​Фотография 51 — SCOOPED

Довольно емкое английское слово scooped трудно перевести на русский язык. Scoop — это эксклюзивная информация, которую журналист успевает опубликовать раньше своих конкурентов.

В научной среде оно имеет свой оттенок: to get scooped — когда тебя кинули коллеги, подсмотрели идею, украли данные и быстро опубликовали под своим именем.

Воровство идей и данных в науке встречается все чаще. Причина понятна — по оценкеCongressional Research Service мировые затраты на R&D в 2018 году составили 2 трлн долларов. Этот показатель вырос более чем в три раза с 2000 года. Количество ученых тоже неуклонно растет.

Денег много, людей много, идей мало — вот и имеем…

В истории науки есть фееричные сюжеты воровства (не всегда намеренного):

История первая

1986 год. Сотрудник Института Биофизики в Красноярске Виктор Охонин патентует STED-микроскопию — прорывной метод, который позволяет преодолеть дифракционный предел (из-за этого нельзя было различить два объекта на расстоянии 200 нм). Ура! Дифирамбы! Еще один природный барьер пал! — нет. Не знаю, что произошло тогда в Красноярске, но открытие почему-то осталось незамеченным.

1994 год. немец Штефан Хелль с коллегами в Финляндии публикует свою новую разработку — STED-микроскопию. И вот теперь: Ура! Дифирамбы! Еще один природный барьер пал!

В 2014 году Хелль получил Нобелевскую по химии совместно с Бетцигом и Мернером (они тоже работали над подобными методами). Бетциг создал Janelia, наикрутейший институт с самыми модными микроскопами. Хелль основал Abberior Instruments — компанию по разработке микроскопов. Охонин перебрался в Университет Оттавы. Не могу судить, не зная подробностей, но выглядит, как очень странная и неприятная история.

История вторая

Еще эпичнее первой. Картинка из предыдущего поста — известна как фотография 51 — это рентгенограмма кристаллов ДНК. Получена аспирантом из научной группы Розалинд Франклин (Розалинд на фото). Вскоре этот аспирант перешел к новому руководителю — Морису Уилкинсу — и тайком принес ему эту фотку. Уилкинс тайком показал ее Уотсону и Крику — ребятам, пытавшимся узнать структуру ДНК. Во многом на основе этой фотки, Уотсон и Крик опубликовали в 1953 году структуру двойной спирали ДНК. За это открытие Уотсон, Крик и Уилкинс получили Нобелевскую в 1962 году. Это одна из самых знаковых Нобелевских в истории.

Розалинд умрет от рака еще в 1958. Среди ее бумаг найдут неопубликованный черновик статьи, в которой она сама по своим данным (которые украл Уилкинс) додумалась до структуры ДНК, но, видимо, не успела опубликовать.

История с фотографией довольно поучительна. Не случайно на всех более-менее солидных научных конференциях запрещено фотографировать. Тем не менее все время встречаются индивиды, которые втихаря, раком, через подмышку просовывают камеру смартфона, чтобы незаметно сфотографировать ваши результаты. Наверно у каждого ученого есть пара знакомых, у которых или пытались стащить методику конкуренты, или рецензент без спроса пересылал рукопись статьи знакомым или искусственно тормозил продвижение статьи, чтобы самому опубликовать похожий результат первым.

Есть и хорошие новости. Если у вас пытаются что-то украсть — значит есть что воровать, и ваша работа чего-то стоит.

От воровства не спасут ни законодательство, ни влиятельные университеты/компании. Один мой препод в МГУ как-то сказал, что единственный верный способ защиты от воровства — бежать быстрее других.

Так что хватит залипать в телегу, бегом доделывать свои проекты)

Всем продуктивности,
Тг

#научпоп

​​Гендерный вопрос

Несколько раз угораздило меня присутствовать во время споров о трансгендерности. Если грубо, стороны две: за и против бинарной классификации полов.

Меня звали на эти разборки для “научного мнения”. Точнее мнение у сторон уже было. Они лишь хотели разузнать какие-нибудь заумный факт в их пользу. Из серии: “у нас уже есть позиция, придумай-ка нам ее обоснование”.

Какие аргументы я слышал чаще всего:

“У всех есть и мужские, и женские гормоны, значит нет четких границ пола”
— Эти гормоны действительно есть у всех, но “мужскими” и “женскими” мы назначили их сами.

“Среди животных нет трансгендеров, у них все по старинке”
— Опять нет. Например у голубоголовых губанов (рыбка такая) при отсутствии самца одна из самок меняет пол. Она превращается в полноценного самца за 10 дней, но например мозг полностью “самцовым” не становится. Люди так не умеют, но у разных животных не все так однозначно. На фото самец слева, самки справа (фото Kevin Bryant).

“У каждого пола есть свой набор хромосом: у мужчин XY, у женщин XX.”
— Так-то оно так. Но например есть ген SRY, который определяет пол на определенных стадиях созревания эмбриона. Изначально он сидит на Y-хромосоме, но в процессе образования плода может перескочить на X-хромосому. Тогда у мужчины недоразовьются половые органы. А мутации в ассоциированном белке SOX9 могут вызвать формирование яичников. Есть и другие сюжеты всего этого дела.

Если убрать шелуху, в вопросе есть два важных аспекта: научный и медицинский.

— Научный

Из-за табуированости темы ее толком не исследовали до недавнего времени. Никто бы и не дал на это деньги лет 50 назад.

На фоне скудности наших знаний люди из лагерей “за” и “против” бинарности выдирают научные исследования из контекста, чтобы доказать свою правоту. К науке это не имеет никакого отношения.

— Медицинский

Если наука не сильно зависит от социальных классификаций, то медицина — вполне себе социальный продукт, причем с ограниченными ресурсами. Существует медицинская бюрократия, которая составляет список патологий. Цель — увеличить качество и продолжительность жизни людей, а не составить список “юродивых”, на которых нужно показывать пальцем.

Например у людей с перескочившим на X-хромосому геном SRY наблюдается предрасположенность к раку половых органов. Вместо того, чтобы толерантно называть это нормой или озлобленно отправлять таких людей в психушку, надо выбирать стратегию, исходя из увеличения продолжительности и качества жизни.

В общем сложный вопрос. И если его накачивать предрассудками, легче не становится. Ну а вне науки и медицины все просто: каждый дрочит, как он хочет.

Тему сегодняшний поста предложил читатель. Спасибо за идею)

Всем добра,
Тг

#научпоп

​​Рейтинги-хуейтинги. Часть 2

Недавно вышел рейтинг ВУЗов от QS на 2021 год. Кстати почему они нумеруются на год вперед? Это же не FIFA, в конце концов…

МГУ на 74 месте (поднялся с 84), Корнеллский университет на 18 как и в прошлом году. Мы уже обсуждали, почему эти рейтинги не являются объективными, а российские вузы там занижены.

В одном из новостных выпусков Артемий Лебедев назвал одну из причин. Если краток: в России научные статьи в основном производится в НИИ, а универы сфокусированы на образовании. На Западе же и науку, и образование производят университеты, что дает им больше баллов в рейтингах.

Это не совсем так. И в США, и во Франции, и в Германии есть огромные сети научных институтов, которые производят львиную долю топовой науки и ни как не связаны с университетами. Эти западные НИИ не являются учебными заведениями и отсутствуют в рейтингах ВУЗов, точно так же, как и российские институты.

Возникает вопрос: как сравнить научную состоятельность и НИИ и универов?

На то есть свои рейтинги. Например журнал Nature регулярно публикует Nature Index, который оценивает научный вклад всех НИИ и университетов мира.

Смотрим топ-500 научных заведений: 139 из США, 109 из Китая, 42 из Германии, 4 из России.

МГУ на 347 месте, Корнелл на 24-м. Российская Академия Наук (то есть все НИИ РАН суммарно) на 58 строчке — это единственная российская организация в топ-100. Впереди планеты всей Китайская Академия Наук, за ней Гарвард и немецкий Макс Планк.

Из-за разной цитируемости и частоты публикаций честнее сравнивать по предметам. Сразу бросается в глаза, что РАН вперед тянут физики (22 место в Physical Sciences), а та же биология (Life Science) сильно проседает — даже не входит в топ 100.

Помимо всем известных университетов в рейтинге действительно очень много НИИ, не входящих в рейтинг ВУЗов:

В том же Life Science на втором месте Национальный Институт Здоровья США (NIH) — огромный исследовательский центр в городе Бетесда, штат Мэриленд. Или например французский институт INSERM — 44-й (скорее сеть институтов, я там работал 4 года назад).

Интересно выглядит топ-100 институтов по скорости развития: 92 из 100 находятся в Китае.

Но на этих рейтингах тоже не стоит зацикливаться. По корявости они не уступают рейтингам ВУЗов:

Во-первых целые академии наук (типа РАН или китайской АН) сравниваются в перемешку с локальными топовыми НИИ типа Scripps Research. Хотелось бы какой-то нормализации, например производительность на лабораторию или на ученого.

Во-вторых не очень понятно, как учитываются публикации вне издательства Nature. Те же физики скажут, что у них котируется Physical Review Letters, в котором опубликована большая часть нобелевских работ по физике.

Тем не менее рейтинги типа Nature Index позволяют примерно оценит производительность научных заведений (1-е место явно лучше 500-го).

Напоследок зацените, как выглядит главная площадь в Salk Institute (еще один топовый американский НИИ, тоже отсутствует в рейтинге ВУЗов). Сфоткал, когда был проездом на конференции в Сан-Диего.

Всем добра,
Тг

#научпоп
#образование

Самодостаточность

Сегодня редкий пост не про науку.

Два года назад я ездил в Питер на матчи ЧМ2018. В перерывах между футбиком была плотная культурная программа. Вот три примера типовых экскурсий:

Экскурсия 1, Кронштадт: Маленький клочок земли в Финском заливе напичкан крутейшими техническими решениями 18 века. При этом экскурсовод всю дорогу виновато оправдывалась: “Наши технологии при Петре I не уступали голландским, наш форт “Александр I” не хуже французского…”

Экскурсия 2, Кунсткамера: Местный экскурсовод подхватил ту же песню: “…наша коллекция не уступает другим коллекциям … даже глобус есть”

Экскурсия 3, кораблик по Неве: Не мог оторвать глаз от изумительной красоты города. Но тут включился аудиогид, и началось: “Санкт-Петербург — Вторая столица, Третья Венеция, Десятый Амстердам…”

Мне как бы намекали, что перед СПб надо съездить в Венецию, Амстердам и еще десяток европейских городов.

После переездов во Францию и в США посыл “у нас не хуже” на контрасте все сильнее бросается в глаза во многих аспектах. Питер лишь попал под горячую руку как пример.

Тот же Нью-Йорк не является ни столицей США, ни даже столицей штата. Ньюйоркцев это вообще не парит. Для них это самый главный город в мире. Остальных они на шпиле Эмпайр-Стейт вертели.

Если сообщить эту информацию парижанам, они от изумления подавятся круассаном и прочими стереотипами. Ведь для них Париж — вообще единственный город в мире, остальное — бескультурная провинция. Они их на Эйфелевой башне вертели.

Недостаток самодостаточности всегда порождает вторичность. Питер — не вторая Венеция, а один из самых красивых городов в Европе и самый красивый в России. Надо позиционировать его так, чтобы туда ехали не после Венеции, а вместо Венеции.

Вот такая незамысловатая получилась аллегория. Распространяется не только на города;)

Напоследок зацените, как корейцы забивали немцам в Казани два года назад.

Всем добра,
Тг

#советдня

​​Curiosity

Настанет день, когда физики покорят атом и освоят самые отдаленные части Галактики, химики создадут материалы с невероятными свойствами, а биологи придумают таблетку от всех болезней. Ведь так?

Может быть, когда-нибудь… Давайте будем честными: у большей части науки нет и не будет никакого применения (имею ввиду фундаментальную науку).

Идеальный пример — астрономия. Открытие новых звезд не приводит к созданию новых продуктов. И вряд ли мы до этих звезд когда-нибудь долетим.

Пока вы читаете этот пост, где-то далеко на Марсе трудится легендарный марсоход, чем-то напоминающий Валл-И. Curiosity обошелся американцам в 2.5 млрд долларов (примерно как весь космодром Восточный).

Зачем в кусок железа размером с Ладу Калину влили столько денег? Наличие дорогой штуковины на Марсе не отражается на качестве жизни рядовых американских налогоплательщиков.

Ответ кроется в названии самого марсохода. Любопытство — основная причина, по который мы вытворяем все эти научные выкрутасы. Когда ученый ставит новый опыт, им движет желание ткнуть пальцем в неизвестное. В это время он не думает ни спасении человечества, ни о коммерческом применении.

Тыкание в неизвестное стоит денег. Их выдают в виде грантов. Отвечая на вопрос “зачем нам это финансировать?”, многие ученые начинают лукавить про грандиозные достижения из первого абзаца. Почему не быть честными: “Мы можем узнать, как это работает. Если вам тоже интересно, вот ценник”.

Безусловно у всего этого есть побочный эффект. Иногда фундаментальные открытия приводят к созданию новых инженерных решений. Научные центры обрастают стартапами, туда приходят фармкомпании и IT-гиганты. Далее все это размывается в Research and Development (R&D), который уже реально приводит к строительству самолетов и лечению болезней.

Но все же единственный гарантированный продукт фундаментальной науки — это новые знания.

Ну и в таком посте нельзя не вспомнить, как Nasa нарисовали огромный писюн на Марсе…))

Всем добра,
Тг

#научпоп

​​Новая этика

Через пару дней после переезда в Нью-Йорк я впервые оказался в Центральном парке. 5-я авеню была забита людьми со странными розовыми штуками на голове (на фото, источник - NYT). “Какие интересные шапочки” — подумал я и полез гуглить. Выяснилось, что это был марш женщин, выступающих против Трампа и его сексистских наклонностей. Розовые шапки олицетворяли вязаные вагины.

В последние годы появляется все больше вопросов, бросающих вызов устоявшимся этическим нормам: от уже банального “Можно ли подмигивать женщинам? А мужчинам?”, до неожиданного “Можно ли обижать роботов?”. Все эти вопросы объединяют в так называемую новую этику.

Ранее новая этика была локальной историей и существовала лишь в кулуарах интеллигенции и шуме активистов. Сейчас она меняет политику, определяет корпоративную этику и приводит к созданию новых смыслов в IT.

У изначально чисто социального явления появилась вполне себе утилитарная подоплека. Из соображений репутации все солидные университеты и крупные компании стали активно декларировать свою позицию, когда случается очередной metoo или BLM. Поэтому, если вы делаете карьеру, быть в курсе основных тем и публичной позиции вашей компании как минимум полезно.

Лично мне особенно интересна IT-составляющая новой этики. Мое любимое — эффект “зловещей долины” и стоит ли делать роботов, похожих на людей.

В этом блоге я мало касаюсь новой этики по двум причинам:

1. Во многих вопросах не шарю и еще не сформировал собственного мнения.
2. По моему опыту лучшие материалы по новой этике — всегда диалог двух людей. Все монологи и личные статьи, кем бы ни был автор, уступают в емкости.

[абзац удален]

Ну и про ту же “зловещую долину” есть у Себранта (тык).

Понятия не имею, как удобно давать ссылки на подкасты, поэтому даю ссылки на сайты. Или ищите ручками в вашем приложении для подкастов.

Всем добра,
Тг

#карьера

Обо всем понемногу

Накопилось новостей, ковидных и нековидных. Выложу их в один пост.

Про ковид:

Наш универ не будет повышать аренду в предстоящем учебном году. При этом стипендия выросла чуть больше, чем обычно. В норме и аренду, и стипу увеличивают на 3-4% каждый год.
-
Так как в госпиталь жертвовали много еды, нас бесплатно кормили 3 раза в день до конца июля. Несмотря на то, что я занимаюсь исследованиями, кормили и врачей и ученых.
-
Вообще часто стали перепадать какие-то плюшки. Я постоянно забываю снять бейдж госпиталя при выходе с работы. При виде бейджика многие бары делают скидку, в каких-то магазинах перепадает бесплатная выпечка. Каждый раз я объясняю, что вообще не врач, и в госпитале занимаюсь наукой. Но плюшки все равно навязывают, потому что это “для всех работников госпиталя”.
-
Меры предосторожности все те же: маски обязательны на работе, все встречи по зуму. Маски выдают на входе в госпиталь. Санитайзера вокруг столько, что можно полы мыть. Помимо этого нам надо заполнять ковидную анкету каждый день перед входом в госпиталь. В специальном приложении надо просто подтвердить, что симптомов нет, больных не облизывал. Так как я все еще долечиваю свой перелом, мне надо чекиниться и как сотруднику, и как пациенту.

Не про ковид:

На этой неделе к нам в госпиталь поступил брат Трампа Роберт. В пятницу Дональд Трамп решил навестить его. Из-за этого перед госпиталем перекрыли минимум километр дороги. Многие сотрудники забили соцсети призывами к импичменту президента, потому что тот мешает им перейти дорогу. Я как раз шел домой по тротуару и снял проезжающий кортеж Трампа (видео под этим постом, Трамп вроде бы в последнем черном джипе). Вчера Роберт скончался.
-
Вчера был на митинге против жестокости силовиков в Беларуси. Люди (в основном белорусы) приносили цветы к посольству РБ и в сквер напротив Генассамблеи ООН. Кто-то принес большие колонки — постоянно включали Ляписа. Иногда сигналили проезжающие мимо машины. За процессом со скучным видом наблюдали пятеро полицейских.

В конце с разрешения полиции несколько человек под крики “Уходи!” прямо перед зданием ООН запустили карикатуру на Лукашенко на красно-белых воздушных шариках (видео под этим постом).

🤍❤️🤍