Пресс-релиз от Moderna по эффективности бустеров против омикрон-варианта
Примерно час назад представители компании Moderna опубликовали пресс-релиз с данными испытания двух бустеров против омикрон-штамма [1].
Спустя 4 недели после введения вакцины бустерная доза 50 мкг повышала уровень нейтрализующих антител против омикрона в 37 раз. Доза 100 мкг — в 83 раза.
Кроме того, компания объявила о положительных результатах по безопасности и переносимости бустерной дозы 100 мкг в рамках 2/3 фазы клинических испытаний с участием 305 человек. Частота нежелательных явлений после третей дозы была примерно сопоставима с частотой после вакцинации с использованием двух доз.
Сейчас Moderna тестирует несколько стратегий против омикрона [2]:
1. Более высокую дозу (100 мкг) вакцины.
2. Первое обновление вакцины mRNA-1273.211 для третей дозы — включает несколько важных мутаций в омикрон-варианте, которые также встречались в бета-варианте.
3. Второе обновление вакцины mRNA-1273.213 для третей дозы — включает многие мутации у омикрон-варианта, которые встречались у бета- и дельта-вариантов. Уже изучена на дозе 100 мкг и начинается изучение на дозе 50 мкг.
4. Новую версия вакцины mRNA-1273.529 специально для защиты от омикрона.
1. https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Preliminary-Booster-Data-and-Updates-Strategy-to-Address-Omicron-Variant/default.aspx (20.12.21)
2. https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Strategy-to-Address-Omicron-B.1.1.529-SARS-CoV-2-Variant/default.aspx (26.11.21)
Поиск и разбор данных: Евгений Недильский
Поблагодарить за свежие данные: 5536 9138 3126 6560
Примерно час назад представители компании Moderna опубликовали пресс-релиз с данными испытания двух бустеров против омикрон-штамма [1].
Спустя 4 недели после введения вакцины бустерная доза 50 мкг повышала уровень нейтрализующих антител против омикрона в 37 раз. Доза 100 мкг — в 83 раза.
Кроме того, компания объявила о положительных результатах по безопасности и переносимости бустерной дозы 100 мкг в рамках 2/3 фазы клинических испытаний с участием 305 человек. Частота нежелательных явлений после третей дозы была примерно сопоставима с частотой после вакцинации с использованием двух доз.
Сейчас Moderna тестирует несколько стратегий против омикрона [2]:
1. Более высокую дозу (100 мкг) вакцины.
2. Первое обновление вакцины mRNA-1273.211 для третей дозы — включает несколько важных мутаций в омикрон-варианте, которые также встречались в бета-варианте.
3. Второе обновление вакцины mRNA-1273.213 для третей дозы — включает многие мутации у омикрон-варианта, которые встречались у бета- и дельта-вариантов. Уже изучена на дозе 100 мкг и начинается изучение на дозе 50 мкг.
4. Новую версия вакцины mRNA-1273.529 специально для защиты от омикрона.
1. https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Preliminary-Booster-Data-and-Updates-Strategy-to-Address-Omicron-Variant/default.aspx (20.12.21)
2. https://investors.modernatx.com/news/news-details/2021/Moderna-Announces-Strategy-to-Address-Omicron-B.1.1.529-SARS-CoV-2-Variant/default.aspx (26.11.21)
Поиск и разбор данных: Евгений Недильский
Поблагодарить за свежие данные: 5536 9138 3126 6560
Титр нейтрализующих антител Sputnik V + Sputnik Light против омикрон-варианта
Новость от Дениса Логунова и других учёных, отвечающих за разработку Sputnik V. Разберём результаты исследования, опубликованные 21 декабря в препринте.
1. Привитые Sputnik V 6–12 месяцев назад.
Титр нейтрализующих антител против омикрона снижен в 11,76 раз по сравнением с вариантом B.1.1.1.
2. Привитые Sputnik V, а затем ревакцинированные Sputnik Light 2–3 месяца назад.
Титр нейтрализующих антител против омикрона снижен в 7,13 раз по сравнением с вариантом B.1.1.1. Однако во всех сыворотках крови ревакцинированных были обнаружены нейтрализующие антитела IgG к RBD S-белка омикрон-варианта SARS-СoV-2.
Причём, титр нейтрализующих антител к варианту B.1.1.1 у вакцинированных Sputnik V был примерно такой же, как титр нейтрализующих антител к омикрон-варианту у ревакцинированных Sputnik Light.
* Проверка проводилась на нативном изоляте от пациента, прибывшего из ЮАР, а не на псевдовирусе!
Резюме. Титр нейтрализующих антител против омикрон-варианта значительно снижен как у переболевших COVID-19, так и у вакцинированных. Однако высока вероятность, что ревакцинация с помощью Sputnik Light может подойти для частичного уменьшения рисков при заражении омикрон-вариантом.
***
Поиск и разбор исследования: Евгений Недильский.
Оформление и перевод иллюстраций: Денис Монета.
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Источник: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.17.21267976v1.full.pdf
Новость от Дениса Логунова и других учёных, отвечающих за разработку Sputnik V. Разберём результаты исследования, опубликованные 21 декабря в препринте.
1. Привитые Sputnik V 6–12 месяцев назад.
Титр нейтрализующих антител против омикрона снижен в 11,76 раз по сравнением с вариантом B.1.1.1.
2. Привитые Sputnik V, а затем ревакцинированные Sputnik Light 2–3 месяца назад.
Титр нейтрализующих антител против омикрона снижен в 7,13 раз по сравнением с вариантом B.1.1.1. Однако во всех сыворотках крови ревакцинированных были обнаружены нейтрализующие антитела IgG к RBD S-белка омикрон-варианта SARS-СoV-2.
Причём, титр нейтрализующих антител к варианту B.1.1.1 у вакцинированных Sputnik V был примерно такой же, как титр нейтрализующих антител к омикрон-варианту у ревакцинированных Sputnik Light.
* Проверка проводилась на нативном изоляте от пациента, прибывшего из ЮАР, а не на псевдовирусе!
Резюме. Титр нейтрализующих антител против омикрон-варианта значительно снижен как у переболевших COVID-19, так и у вакцинированных. Однако высока вероятность, что ревакцинация с помощью Sputnik Light может подойти для частичного уменьшения рисков при заражении омикрон-вариантом.
***
Поиск и разбор исследования: Евгений Недильский.
Оформление и перевод иллюстраций: Денис Монета.
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Источник: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.17.21267976v1.full.pdf
3 важных новости из США
На 18 декабря 2021 года омикрон обнаруживался в 73% секвенированных образцов SARS-СoV-2. По приблизительным оценкам трансмиссивность у омикрона в 2–3 раза выше, чем у дельта.
В ближайшие недели в стране может возникнуть тройная угроза респираторных вирусов: дельта, омикрон и сезонный грипп. Вспышки гриппа A (H3N2) уже зафиксированы в нескольких университетских городках.
2. Вакцинация в разы уменьшила количество смертей, госпитализаций и заражений COVID-19.
Рассчитанное положительное влияние вакцинации в США в период с 12 декабря 2020 года по 30 ноября 2021 года:
— Летальные исходы. Вакцинация предотвратила 1,1 млн смертей. Без вакцин летальных исходов из-за COVID-19 было бы в 3,2 раза больше.
— Госпитализации. Вакцинация предотвратила осложнения, требующие госпитализации у более 10 млн человек. Без вакцин госпитализаций при заражении было бы в 4,9 раза больше.
— Заражения. Вакцинация уменьшила количество заражений COVID-19 на 36 млн случаев. Без вакцин новых случаев заражения было бы в 5,2 раза больше.
В США было вакцинировано в этот период только 62% населения.
3. Даже при дельта-штамме привитые заражались COVID-19 гораздо реже, чем непривитые.
На сколько заражались COVID-19 невакцинированные чаще по сравнению с вакцинированными в период с 1 мая по 7 августа 2021 года:
— Moderna: на 412%;
— Pfizer: на 287%;
— Johnson & Johnson: на 159%.
Расчёты велись на самой большой когорте протестированных людей в торговых точках, которая составляла более 1,2 млн человек.
Поиск и разбор данных: Евгений Недильский
Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560
Источники:
1. https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2787609 (22.12.21)
2. https://jamanetwork.com/journals/jama-health-forum/fullarticle/2787531 (21.12.21); более подробное сравнение: https://www.commonwealthfund.org/publications/issue-briefs/2021/dec/us-covid-19-vaccination-program-one-year-how-many-deaths-and
3. https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2787363 (22.12.21)
[краткий конспект]:
1. Омикрон всего за 3 недели, скорее всего, стал доминирующим штаммом в США.На 18 декабря 2021 года омикрон обнаруживался в 73% секвенированных образцов SARS-СoV-2. По приблизительным оценкам трансмиссивность у омикрона в 2–3 раза выше, чем у дельта.
В ближайшие недели в стране может возникнуть тройная угроза респираторных вирусов: дельта, омикрон и сезонный грипп. Вспышки гриппа A (H3N2) уже зафиксированы в нескольких университетских городках.
2. Вакцинация в разы уменьшила количество смертей, госпитализаций и заражений COVID-19.
Рассчитанное положительное влияние вакцинации в США в период с 12 декабря 2020 года по 30 ноября 2021 года:
— Летальные исходы. Вакцинация предотвратила 1,1 млн смертей. Без вакцин летальных исходов из-за COVID-19 было бы в 3,2 раза больше.
— Госпитализации. Вакцинация предотвратила осложнения, требующие госпитализации у более 10 млн человек. Без вакцин госпитализаций при заражении было бы в 4,9 раза больше.
— Заражения. Вакцинация уменьшила количество заражений COVID-19 на 36 млн случаев. Без вакцин новых случаев заражения было бы в 5,2 раза больше.
В США было вакцинировано в этот период только 62% населения.
3. Даже при дельта-штамме привитые заражались COVID-19 гораздо реже, чем непривитые.
На сколько заражались COVID-19 невакцинированные чаще по сравнению с вакцинированными в период с 1 мая по 7 августа 2021 года:
— Moderna: на 412%;
— Pfizer: на 287%;
— Johnson & Johnson: на 159%.
Расчёты велись на самой большой когорте протестированных людей в торговых точках, которая составляла более 1,2 млн человек.
Поиск и разбор данных: Евгений Недильский
Поблагодарить: 5536 9138 3126 6560
Источники:
1. https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2787609 (22.12.21)
2. https://jamanetwork.com/journals/jama-health-forum/fullarticle/2787531 (21.12.21); более подробное сравнение: https://www.commonwealthfund.org/publications/issue-briefs/2021/dec/us-covid-19-vaccination-program-one-year-how-many-deaths-and
3. https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2787363 (22.12.21)
Напоминаю, что в журнале JAMA Network интересные иллюстрации к публикациям находятся обычно не в тексте статьи, а во вкладке «FIGURES/TABLES». Например, это относится к третьей ссылке в предыдущем разборе. Призываю вас как можно чаще заглядывать в источники.
mRNA-1273 — Moderna;
BNT162b2 — Pfizer;
JNJ-78436735 — Johnson & Johnson.
mRNA-1273 — Moderna;
BNT162b2 — Pfizer;
JNJ-78436735 — Johnson & Johnson.
На иллюстрации изображена схема действия двух препаратов: «Паксловид» от компании Pfizer и «Молнупиравира» от компании Merck.
Источник: https://www.science.org/content/article/fda-greenlights-pfizer-s-oral-covid-19-drug
Разбор далее...
Источник: https://www.science.org/content/article/fda-greenlights-pfizer-s-oral-covid-19-drug
Разбор далее...
«Паксловид» — препарат против COVID-19, снижающий риск госпитализации и смерти на 88% у людей из групп риска
Наконец-то появился препарат, направленный непосредственно против самого SARS-CoV-2 и сильно снижающий риски в случае заражения. По результатам клинических испытаний «Паксловид» снижает риск госпитализации и смерти от COVID-19 на 88% среди невакцинированных людей с хотя бы одним фактором риска развития тяжёлой формы инфекции [1, 2, 3]. Для сравнения: Молнупиравир сокращает эти риски на ~30%, при этом может чаще приводить к побочным эффектам.
1. Детали клинического испытания.
— Выборка: 2085 человек (1039 из них получали паксловид, а 1046 — входили в контрольную группу и получали плацебо).
— Результаты. В течение 28 дней со дня приёма препарата были госпитализированы или умерли в результате инфекции: 0,8% человек в группе, получающей паксловид и 6% человек в группе, получающей плацебо.
2. Состав.
Включает в себя два компонента:
— Нирматрелвир: ингибирует основную протеазу SARS-CoV-2 (блокирует белок вируса), не давая ему создавать в клетках вирусные копии.
— Ритонавир: также ингибирует основную протеазу SARS-CoV-2, кроме того, замедляет метаболизм нирматрелвира, позволяя ему дольше и в более высоких концентрациях оставаться в организме и выполнять свою функцию.
3. Форма применения.
Принимается перорально в форме трёх таблеток (две таблетки нирматрелвира и одна таблетка ритонавива) два раза в день в течение 5 дней, начиная с 5 дня после появления симптомов COVID-19. Всего 30 таблеток. Не разрешено принимать препарат: более 5 дней, не по рецепту, для профилактики COVID-19. Также стоит учитывать, что «Паксловид» не заменяет вакцинацию или ревакцинацию.
4. Одобрение препарата.
FDA (Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов) разрешило применение «Паксловида» детям в возрасте от 12 лет и взрослым с высоким риском тяжёлой инфекции, у которых есть положительный результат теста на SARS-CoV-2.
5. Дальнейшие планы.
— Клинические испытания: компания Pfizer продолжает клинические испытания «Паксловида» у людей с меньшим риском развития тяжёлой COVID-19, а также в профилактических целях для людей, контактировавших с заразившимися COVID-19.
— Производство: к первой половине 2022 года планируется произвести такой объём препарата, которого хватит на 30 млн курсов лечения (один курс: 30 таблеток), к концу 2022 года — на 80 млн курсов лечения.
— Распространение: компания Pfizer подписала соглашение, помогающее облегчить доступ к препарату по сниженным ценам в 95 странах мира с низким и средним уровнем дохода (на которые приходится 53% населения планеты) .
Ожидается, что «Паксловид» может предотвратить часть госпитализаций и смертей от COVID-19 и снизить нагрузку на систему здравоохранения при распространении омикрон-варианта.
UPD: как показал опыт с другими препаратами от COVID-19, текущая эффективность «Паксловида» может уточняться и корректироваться. Поэтому только на основании испытания от Pfizer и разрешения FDA прошу преждевременно не делать далеко идущие выводы. Ждём больше данных по препарату.
***
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Источники:
1. https://www.science.org/content/article/fda-greenlights-pfizer-s-oral-covid-19-drug (22.12.21, в том числе источник иллюстрации)
2. https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-first-oral-antiviral-treatment-covid-19 (22.12.21)
3. https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04960202
Поиск данных и их разбор: Евгений Недильский.
Оформление и перевод иллюстраций: Александр Митряшкин.
Наконец-то появился препарат, направленный непосредственно против самого SARS-CoV-2 и сильно снижающий риски в случае заражения. По результатам клинических испытаний «Паксловид» снижает риск госпитализации и смерти от COVID-19 на 88% среди невакцинированных людей с хотя бы одним фактором риска развития тяжёлой формы инфекции [1, 2, 3]. Для сравнения: Молнупиравир сокращает эти риски на ~30%, при этом может чаще приводить к побочным эффектам.
1. Детали клинического испытания.
— Выборка: 2085 человек (1039 из них получали паксловид, а 1046 — входили в контрольную группу и получали плацебо).
— Результаты. В течение 28 дней со дня приёма препарата были госпитализированы или умерли в результате инфекции: 0,8% человек в группе, получающей паксловид и 6% человек в группе, получающей плацебо.
2. Состав.
Включает в себя два компонента:
— Нирматрелвир: ингибирует основную протеазу SARS-CoV-2 (блокирует белок вируса), не давая ему создавать в клетках вирусные копии.
— Ритонавир: также ингибирует основную протеазу SARS-CoV-2, кроме того, замедляет метаболизм нирматрелвира, позволяя ему дольше и в более высоких концентрациях оставаться в организме и выполнять свою функцию.
3. Форма применения.
Принимается перорально в форме трёх таблеток (две таблетки нирматрелвира и одна таблетка ритонавива) два раза в день в течение 5 дней, начиная с 5 дня после появления симптомов COVID-19. Всего 30 таблеток. Не разрешено принимать препарат: более 5 дней, не по рецепту, для профилактики COVID-19. Также стоит учитывать, что «Паксловид» не заменяет вакцинацию или ревакцинацию.
4. Одобрение препарата.
FDA (Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов) разрешило применение «Паксловида» детям в возрасте от 12 лет и взрослым с высоким риском тяжёлой инфекции, у которых есть положительный результат теста на SARS-CoV-2.
5. Дальнейшие планы.
— Клинические испытания: компания Pfizer продолжает клинические испытания «Паксловида» у людей с меньшим риском развития тяжёлой COVID-19, а также в профилактических целях для людей, контактировавших с заразившимися COVID-19.
— Производство: к первой половине 2022 года планируется произвести такой объём препарата, которого хватит на 30 млн курсов лечения (один курс: 30 таблеток), к концу 2022 года — на 80 млн курсов лечения.
— Распространение: компания Pfizer подписала соглашение, помогающее облегчить доступ к препарату по сниженным ценам в 95 странах мира с низким и средним уровнем дохода (на которые приходится 53% населения планеты) .
Ожидается, что «Паксловид» может предотвратить часть госпитализаций и смертей от COVID-19 и снизить нагрузку на систему здравоохранения при распространении омикрон-варианта.
UPD: как показал опыт с другими препаратами от COVID-19, текущая эффективность «Паксловида» может уточняться и корректироваться. Поэтому только на основании испытания от Pfizer и разрешения FDA прошу преждевременно не делать далеко идущие выводы. Ждём больше данных по препарату.
***
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Источники:
1. https://www.science.org/content/article/fda-greenlights-pfizer-s-oral-covid-19-drug (22.12.21, в том числе источник иллюстрации)
2. https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-first-oral-antiviral-treatment-covid-19 (22.12.21)
3. https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT04960202
Поиск данных и их разбор: Евгений Недильский.
Оформление и перевод иллюстраций: Александр Митряшкин.
При повторном заражении COVID-19 вы болели легче, примерно так же или тяжелее?
Anonymous Poll
7%
Болел(а) легче
2%
Болел(а) с той же тяжестью
2%
Болел(а) тяжелее
37%
Не болел(а) повторно
45%
Не болел(а) COVID-19 вообще
2%
Болел(а) более двух раз, всегда по-разному
5%
Свой вариант ответа в комментариях
Если кто пропустил, сегодня сразу 3 интересных стрима.
1. От Алексея Водовозова по COVID-19: https://www.youtube.com/watch?v=4zBCT1g7BbE.
2. От Медача по итогам пандемии COVID-19: https://www.youtube.com/watch?v=YPYhQ28xb30.
3. От ANTROPOGENEZ.RU, будем выбирать главного превдоэксрперта-мракобеса, в том числе и среди ковид-диссидентов: https://www.youtube.com/watch?v=QmUq_TMiCIk.
1. От Алексея Водовозова по COVID-19: https://www.youtube.com/watch?v=4zBCT1g7BbE.
2. От Медача по итогам пандемии COVID-19: https://www.youtube.com/watch?v=YPYhQ28xb30.
3. От ANTROPOGENEZ.RU, будем выбирать главного превдоэксрперта-мракобеса, в том числе и среди ковид-диссидентов: https://www.youtube.com/watch?v=QmUq_TMiCIk.
YouTube
Приемно-сортировочная, выпуск 24
Подводим итоги второго года пандемии и отвечаем на вопросы подписчиков: двухчасовой стрим. Можно задать вопросы до начала трансляции, их собирает модератор @ProHolmes в своём телеграме.
-----------------------------------------
Желающим поддержать морально…
-----------------------------------------
Желающим поддержать морально…
Дальнейшая эволюция вариантов SARS-CoV-2
Наполняю большой сборник по омикрону. И по ходу работы обнаружил две интересные публикации. Спешу поделиться с вами кратким пересказом наиболее любопытных моментов из них.
Есть как минимум два основных пути развития SARS-СoV-2:
1. Эффективность передачи.
Способность новых вирусных вариантов передаваться лучше, чем предыдущие варианты, в какой-то момент достигнет своего пика. Вирус не может улучшать эту способность до бесконечности. Главный вопрос: когда эта эволюция достигнет своего пика и какой потенциал у вируса ещё остался? SARS-СoV-2 придётся балансировать между эффективной передачей и таким ущербом, который не помешает ему распространяться дальше. Ведь чем серьёзнее человек болеет, чем меньше шансов, что он сможет «переносить вирус на ногах», заражая других людей.
* Трансмиссивность (transmissibility), или контагиозность, или заразительность, — это вероятность заражения при контакте между инфицированным и неинфицированным.
* Вирулентность (virulence) — это способность патогена причинять вред хозяину: вызывать болезнь или приводить к летальному исходу у инфицированного.
❗️Однако не всегда способность лучше передаваться приводит к уменьшению тяжести заболевания! Иначе говоря, не всегда повышение трансмиссивности приводит к понижению вирулентности [1]. Эволюция вирусов сложнее! Если сильное повышение трансмиссивности коррелирует с повышением вирулентности, то в популяции может закрепиться вариант вируса, вызывающий более серьёзное заболевание. То есть сильно повышенная скорость передачи вируса компенсирует способность вызывать более тяжёлую болезнь, замедляющую передачу вируса [2]. Как раз это мы наблюдали в ситуации с дельта-штаммом, который передавался намного лучше, чем предыдущие варианты, но при этом вызывал более серьёзное заболевание.
Более того, чем меньше перекрёстный иммунитет от старых вариантов к новым вариантам, тем выше шанс, что у нового повышенная трансмиссивность компенсирует повышенную вирулентность. Чем меньше иммунитет в популяции, тем выше шанс, что мы получим не только более передаваемый, но и более «злой» вариант вируса [2]. Возможно, чем больше людей в популяции переболели и вакцинировались, тем меньше шансов, что эволюционный отбор пройдёт новый более передаваемый вариант, который ко всему прочему ещё и вызывает более серьёзную инфекцию.
2. Уклонение от иммунитета.
По мере того как способность SARS-CoV-2 к улучшенной передаче будет замедляться, вирус всё ещё сможет эволюционировать в сторону ухода от иммунной защиты. Самый простой способ для вируса вызывать новые вспышки — накапливать мутации, позволяющие уходить от иммунной защиты. Тут важно учитывать, что даже сезонные коронавирусы, такие как HCoV-229E, могут заражать человека снова и снова на протяжении всей его жизни за счёт мутаций, которые позволяют им уходить от иммунного ответа [1].
Некоторые мутации, способствующие лучшему уклонению от иммунной защиты, снижают способность вируса эффективно передаваться или реплицироваться. Поэтому вирусу придётся балансировать между эффективным распространением и уклонением от существующего иммунитета в популяции [1, 2].
В то же время возможны менее ожидаемые варианты развития. Например, гипотетически SARS-CoV-2 может улучшить свои характеристики за счёт рекомбинации с другими коронавирусами [1].
Источники, рекомендую прочитать в оригинале:
1. https://www.nature.com/articles/d41586-021-03619-8 (07.12.21)
2. https://www.nature.com/articles/s41559-021-01600-2 (23.12.21)
Поддержать и поспособствовать созданию большего количество полезных материалов: 5536 9138 3126 6560
Наполняю большой сборник по омикрону. И по ходу работы обнаружил две интересные публикации. Спешу поделиться с вами кратким пересказом наиболее любопытных моментов из них.
Есть как минимум два основных пути развития SARS-СoV-2:
1. Эффективность передачи.
Способность новых вирусных вариантов передаваться лучше, чем предыдущие варианты, в какой-то момент достигнет своего пика. Вирус не может улучшать эту способность до бесконечности. Главный вопрос: когда эта эволюция достигнет своего пика и какой потенциал у вируса ещё остался? SARS-СoV-2 придётся балансировать между эффективной передачей и таким ущербом, который не помешает ему распространяться дальше. Ведь чем серьёзнее человек болеет, чем меньше шансов, что он сможет «переносить вирус на ногах», заражая других людей.
* Трансмиссивность (transmissibility), или контагиозность, или заразительность, — это вероятность заражения при контакте между инфицированным и неинфицированным.
* Вирулентность (virulence) — это способность патогена причинять вред хозяину: вызывать болезнь или приводить к летальному исходу у инфицированного.
❗️Однако не всегда способность лучше передаваться приводит к уменьшению тяжести заболевания! Иначе говоря, не всегда повышение трансмиссивности приводит к понижению вирулентности [1]. Эволюция вирусов сложнее! Если сильное повышение трансмиссивности коррелирует с повышением вирулентности, то в популяции может закрепиться вариант вируса, вызывающий более серьёзное заболевание. То есть сильно повышенная скорость передачи вируса компенсирует способность вызывать более тяжёлую болезнь, замедляющую передачу вируса [2]. Как раз это мы наблюдали в ситуации с дельта-штаммом, который передавался намного лучше, чем предыдущие варианты, но при этом вызывал более серьёзное заболевание.
Более того, чем меньше перекрёстный иммунитет от старых вариантов к новым вариантам, тем выше шанс, что у нового повышенная трансмиссивность компенсирует повышенную вирулентность. Чем меньше иммунитет в популяции, тем выше шанс, что мы получим не только более передаваемый, но и более «злой» вариант вируса [2]. Возможно, чем больше людей в популяции переболели и вакцинировались, тем меньше шансов, что эволюционный отбор пройдёт новый более передаваемый вариант, который ко всему прочему ещё и вызывает более серьёзную инфекцию.
2. Уклонение от иммунитета.
По мере того как способность SARS-CoV-2 к улучшенной передаче будет замедляться, вирус всё ещё сможет эволюционировать в сторону ухода от иммунной защиты. Самый простой способ для вируса вызывать новые вспышки — накапливать мутации, позволяющие уходить от иммунной защиты. Тут важно учитывать, что даже сезонные коронавирусы, такие как HCoV-229E, могут заражать человека снова и снова на протяжении всей его жизни за счёт мутаций, которые позволяют им уходить от иммунного ответа [1].
Некоторые мутации, способствующие лучшему уклонению от иммунной защиты, снижают способность вируса эффективно передаваться или реплицироваться. Поэтому вирусу придётся балансировать между эффективным распространением и уклонением от существующего иммунитета в популяции [1, 2].
В то же время возможны менее ожидаемые варианты развития. Например, гипотетически SARS-CoV-2 может улучшить свои характеристики за счёт рекомбинации с другими коронавирусами [1].
Источники, рекомендую прочитать в оригинале:
1. https://www.nature.com/articles/d41586-021-03619-8 (07.12.21)
2. https://www.nature.com/articles/s41559-021-01600-2 (23.12.21)
Поддержать и поспособствовать созданию большего количество полезных материалов: 5536 9138 3126 6560
Nature
Beyond Omicron: what’s next for COVID’s viral evolution
Nature - The rapid spread of new variants offers clues to how SARS-CoV-2 is adapting and how the pandemic will play out over the next several months.
Каждую неделю я выписываю интересные публикации в журналах с высоким импакт-фактором себе в заметки. Обычно получается сборник с большим количеством материалов за неделю, многие из которых могут быть интересны для прочтения.
Четвёртая неделя декабря (20.11.21–26.12.21).
Более 100 англоязычных публикаций: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-4-nedelyu-dekabrya-2021-201121261221-12-31
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Четвёртая неделя декабря (20.11.21–26.12.21).
Более 100 англоязычных публикаций: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-4-nedelyu-dekabrya-2021-201121261221-12-31
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Научные публикации за 4 неделю декабря 2021 (20.11.21–26.12.21)
Более 100 англоязычных публикаций по COVID-19 и SARS-СoV-2 из лучших мировых научных журналов. Ревакцинация BNT162b2 Vaccine Booster and Mortality Due to Covid-19 https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2115624 (23.12.21) Protection against Covid-19 by…
Сравнение случаев попадания в отделение реанимации у вакцинированных и невакцинированных при заражении омикроном в Великобритании
Доля невакцинированных пациентов среди попавших в отделение реанимации после заражения омикроном составила 61%. Эти данные охватывают только период до 15 декабря 2021 года. В некоторых больницах сообщают о 80–90% среди невакцинированных. Это при том, что в Великобритании большинство людей вакцинированы.
У вакцинированных по сравнению с невакцинированными:
— вероятность госпитализации при заражении омикрон-вариантом: в 8 раз ниже.
— вероятность смерти из-за COVID-19 при заражении дельта-штаммом (с 1 января по 31 октября 2021 года): в 25 раз (на 96%) ниже.
Источник: https://www.bmj.com/content/376/bmj.o5 (04.01.22)
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Доля невакцинированных пациентов среди попавших в отделение реанимации после заражения омикроном составила 61%. Эти данные охватывают только период до 15 декабря 2021 года. В некоторых больницах сообщают о 80–90% среди невакцинированных. Это при том, что в Великобритании большинство людей вакцинированы.
У вакцинированных по сравнению с невакцинированными:
— вероятность госпитализации при заражении омикрон-вариантом: в 8 раз ниже.
— вероятность смерти из-за COVID-19 при заражении дельта-штаммом (с 1 января по 31 октября 2021 года): в 25 раз (на 96%) ниже.
Источник: https://www.bmj.com/content/376/bmj.o5 (04.01.22)
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
The BMJ
Covid-19: Fact check—how many patients in hospital are unvaccinated?
Intensive care units in the UK are filling up with patients with covid-19 who have not been fully vaccinated, a number of media reports have claimed over the past week.
It led to the prime minister, Boris Johnson, urging people to get vaccinated to reduce…
It led to the prime minister, Boris Johnson, urging people to get vaccinated to reduce…
Интервал между вакцинацией и прорывной инфекцией влияет на шанс последующего заражения омикроном
Выявлена корреляция между прорывными инфекциями и риском заражения омикроном. Вакцинированные, которые спустя несколько месяцев заражались альфа- или дельта-штаммом, лучше защищены от последующего заражения омикроном, чем вакцинированные, которые переболели COVID-19 спустя короткое время после вакцинации [1]. Иначе говоря, даже самый лучший тип иммуннитета — гибридный иммунитет, может различаться в зависимости от времени заражения. (Данные из Японии представлены пока ещё в виде препринта, их следует перепроверить в других исследованиях.)
Похожая ситуация происходит с интервалом между дозами вакцины: интервал 4 месяца между двумя дозами вакцины, скорее всего, создаёт лучшую защиту от вируса, чем стандартный интервал в 3–4 недели [2].
Почему интервал имеет значение?
Вакцинация или заражение SARS-CoV-2 приводит к резкому росту антител в крови, направленных против вируса. Если человек повторно заражается вскоре после вакцинации или предыдущей болезни, то именно эти антитела из крови связываются с вирусом и нейтрализуют его.
Спустя месяца 2–3 после вакцинации уровень антител в крови начинает постепенно снижаться. И обычно к 6 месяцу их уровень значительно падает. Если человек повторно заражается спустя несколько месяцев после вакцинации, то основные антитела, которые борются с вирусом — это новая улучшенная партия антител, обновлённая B-клетками памяти. При таком заражении больше возможностей для создания новых долгоживущих плазматических клеток, производящих обновленные и улучшенные антитела против вируса.
1. https://www.nature.com/articles/d41586-022-00004-x (07.01.22)
2. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.21.473679v1 (23.12.21)
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Выявлена корреляция между прорывными инфекциями и риском заражения омикроном. Вакцинированные, которые спустя несколько месяцев заражались альфа- или дельта-штаммом, лучше защищены от последующего заражения омикроном, чем вакцинированные, которые переболели COVID-19 спустя короткое время после вакцинации [1]. Иначе говоря, даже самый лучший тип иммуннитета — гибридный иммунитет, может различаться в зависимости от времени заражения. (Данные из Японии представлены пока ещё в виде препринта, их следует перепроверить в других исследованиях.)
Похожая ситуация происходит с интервалом между дозами вакцины: интервал 4 месяца между двумя дозами вакцины, скорее всего, создаёт лучшую защиту от вируса, чем стандартный интервал в 3–4 недели [2].
Почему интервал имеет значение?
Вакцинация или заражение SARS-CoV-2 приводит к резкому росту антител в крови, направленных против вируса. Если человек повторно заражается вскоре после вакцинации или предыдущей болезни, то именно эти антитела из крови связываются с вирусом и нейтрализуют его.
Спустя месяца 2–3 после вакцинации уровень антител в крови начинает постепенно снижаться. И обычно к 6 месяцу их уровень значительно падает. Если человек повторно заражается спустя несколько месяцев после вакцинации, то основные антитела, которые борются с вирусом — это новая улучшенная партия антител, обновлённая B-клетками памяти. При таком заражении больше возможностей для создания новых долгоживущих плазматических клеток, производящих обновленные и улучшенные антитела против вируса.
1. https://www.nature.com/articles/d41586-022-00004-x (07.01.22)
2. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.21.473679v1 (23.12.21)
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Nature
Immunity against Omicron from breakthrough infection could be a matter of timing
Nature - Laboratory studies hint that a longer interval between infection and vaccination is better than a shorter one.
Влияние COVID-19 на младенцев: обзор данных, известных на данный момент
Основная информация будет касаться младенцев. В то же время будут затронуты важные составляющие влияния COVID-19 на плод у беременных матерей. В том числе разберём, как заражение COVID-19 или вакцинация беременных и кормящих грудью может повлиять на плод и на младенца.
Читать: https://telegra.ph/Vliyanie-COVID-19-na-mladencev-obzor-dannyh-izvestnyh-na-dannyj-moment-01-10-2
Поблагодарить за популяризацию науки и доказательной медицины: 5536 9138 3126 6560
Основная информация будет касаться младенцев. В то же время будут затронуты важные составляющие влияния COVID-19 на плод у беременных матерей. В том числе разберём, как заражение COVID-19 или вакцинация беременных и кормящих грудью может повлиять на плод и на младенца.
Читать: https://telegra.ph/Vliyanie-COVID-19-na-mladencev-obzor-dannyh-izvestnyh-na-dannyj-moment-01-10-2
Поблагодарить за популяризацию науки и доказательной медицины: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Влияние COVID-19 на младенцев: обзор данных, известных на данный момент
Основная информация будет касаться младенцев. В то же время будут затронуты важные составляющие влияния COVID-19 на плод у беременных матерей. В том числе разберём, как заражение COVID-19 или вакцинация беременных и кормящих грудью может повлиять на плод…
Влияние вакцинации от COVID-19 на беременность. Крупное исследование с участием 46 тысяч беременных женщин
4 января 2022 года опубликованы результаты исследования с большой выборкой женщин, изучавшего влияние вакцин от COVID-19 на беременность.
Содержание:
1. Результаты крупных исследований
2. Риски вакцинации от COVID-19 у беременных женщин
3. Риски от заражения COVID-19 для беременных женщин
4. Снижение рисков COVID-19 при вакцинации беременных и кормящих грудью
Читать: https://telegra.ph/Vliyanie-vakcinacii-ot-COVID-19-na-beremennost-Krupnoe-issledovanie-s-uchastiem-46-tysyach-beremennyh-zhenshchin-01-11-2
Поблагодарить за популяризацию науки и доказательной медицины: 5536 9138 3126 6560
4 января 2022 года опубликованы результаты исследования с большой выборкой женщин, изучавшего влияние вакцин от COVID-19 на беременность.
Содержание:
1. Результаты крупных исследований
2. Риски вакцинации от COVID-19 у беременных женщин
3. Риски от заражения COVID-19 для беременных женщин
4. Снижение рисков COVID-19 при вакцинации беременных и кормящих грудью
Читать: https://telegra.ph/Vliyanie-vakcinacii-ot-COVID-19-na-beremennost-Krupnoe-issledovanie-s-uchastiem-46-tysyach-beremennyh-zhenshchin-01-11-2
Поблагодарить за популяризацию науки и доказательной медицины: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Влияние вакцинации от COVID-19 на беременность. Крупное исследование с участием 46 тысяч беременных женщин
4 января 2022 года опубликованы результаты исследования с большой выборкой женщин, изучавшего влияние вакцин от COVID-19 на беременность [1, 2, 3]. 1. Результаты крупных исследований Сперва разберём результаты свежего исследования из США. — Выборка: 46 079…
Научные публикации за пятую неделю декабря (27.12.21–02.01.22). Здесь представлено полсотни рассортированных наиболее интересных англоязычных публикаций по COVID-19 и SARS-СoV-2 из лучших мировых научных журналов, вышедших за неделю. Публикации про омикрон в этот раз вынес в отдельный раздел и поставил на первое место.
Под конец года понял, что перегорел из-за большой нагрузки, даже не осталось сил написать в канал новогоднее поздравление. Поэтому дал себе время отдохнуть и восстановиться. Теперь навёрстываю упущенное. В следующие несколько часов появятся такие же материалы за первую и вторую неделю января.
Читать: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-5-nedelyu-dekabrya-2021-271121020122-01-17
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Под конец года понял, что перегорел из-за большой нагрузки, даже не осталось сил написать в канал новогоднее поздравление. Поэтому дал себе время отдохнуть и восстановиться. Теперь навёрстываю упущенное. В следующие несколько часов появятся такие же материалы за первую и вторую неделю января.
Читать: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-5-nedelyu-dekabrya-2021-271121020122-01-17
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Научные публикации за 5 неделю декабря 2021 (27.11.21–02.01.22)
Здесь представлено полсотни рассортированных наиболее интересных англоязычных публикаций по COVID-19 и SARS-СoV-2 из лучших мировых научных журналов, вышедших за неделю. Омикрон в этот раз вынес в отдельный раздел и поставил на первое место. Сказать спасибо:…
Научные публикации за первую неделю января (03.01.22–09.01.22). Публикации про омикрон, которых в этот раз вышло особенно много, снова вынес в отдельный раздел и поставил на первое место.
Читать: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-1-nedelyu-yanvarya-2022-030122090122-01-17
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Читать: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-1-nedelyu-yanvarya-2022-030122090122-01-17
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Telegraph
Научные публикации за 1 неделю января 2022 (03.01.22–09.01.22)
Здесь представлено около сотни рассортированных наиболее интересных англоязычных публикаций по COVID-19 и SARS-СoV-2 из лучших мировых научных журналов, вышедших за неделю. Публикации про омикрон, которых в этот раз вышло особенно много, снова вынес в отдельный…
Научные публикации за вторую неделю января (10.01.22–16.01.22). Около 80 рассортированных наиболее интересных англоязычных публикаций по COVID-19 и SARS-СoV-2 из лучших мировых научных журналов, вышедших за неделю.
В этот раз составил краткое описание к публикациям про омикрон для тех, кто не знает английского или хочет быстрее узнать краткое содержание публикации. Если вам понравился такой подход, то я могу кратко или чуть подробнее, с бóльшим количеством важных деталей, разбирать все научные публикации за неделю из этого списка. Но такой подход потребует много времени, часов 10–20 в неделю. Если вам интересна эта идея, то поддержите меня донатом: 5536 9138 3126 6560
Читать: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-2-nedelyu-yanvarya-2022-100122160122-01-17
В этот раз составил краткое описание к публикациям про омикрон для тех, кто не знает английского или хочет быстрее узнать краткое содержание публикации. Если вам понравился такой подход, то я могу кратко или чуть подробнее, с бóльшим количеством важных деталей, разбирать все научные публикации за неделю из этого списка. Но такой подход потребует много времени, часов 10–20 в неделю. Если вам интересна эта идея, то поддержите меня донатом: 5536 9138 3126 6560
Читать: https://telegra.ph/Nauchnye-publikacii-za-2-nedelyu-yanvarya-2022-100122160122-01-17
Telegraph
Научные публикации за 2 неделю января 2022 (10.01.22–16.01.22)
Здесь представлено около 80 рассортированных наиболее интересных англоязычных публикаций по COVID-19 и SARS-СoV-2 из лучших мировых научных журналов, вышедших за неделю. В этот раз составил краткое описание к публикациям про омикрон для тех, кто не знает…
Дельтакрон: вариант SARS-СoV-2, которого никогда не существовало
7 января 2022 года вирусолог Леондиос Кострикис из Кипра рассказал по местному телеканалу, что нашёл образцы SARS-СoV-2, в которых присутствовали части от дельта-варианта и омикрон-варианта. Этот вариант назвали дельтакроном. Новость почти сразу же подхватило финансовое издание Bloomberg, и вскоре дельтакрон стал международной сенсацией.
Научное сообщество почти сразу же отреагировало и заявило, что 52 секвенированных образца SARS-СoV-2 из Кипра никак не указывают на появление нового варианта и не являются результатом рекомбинации дельта и омикрона! Например, уже 9 января, сотрудница ВОЗ, Крутика Куппалли (Krutika Kuppalli), писала в своём твиттере, что дельта и омикрон НЕ образовывали новый вариант.
Позже сам исследователь из Кипра рассказал, что его гипотеза и название дельтакрон были неправильно истолкованы. Он даже речи не вёл о гибриде дельта и омикрона. Речь шла о дельта-варианте, в S-белке которого были определены независимо возникшие мутации, похожие на некоторые мутации в омикроне.
Обнаруженные Леондиосом Кострикисом мутации не являются исключительными для омикрона и встречаются в других вариантах вируса. База данных GISAID изобилует последовательностями геномов SARS-CoV-2, в которых некоторые элементы похожи на мутации в различных вариантах вируса, названных буквами греческого алфавита: альфа, бета, гамма и т.д. Однако из всех этих сиквенсов не делают сенсацию.
Эта история показала как минимум два важных момента. С одной стороны — хорошо, что даже очень свежие данные часто становятся достоянием общественности в короткие сроки. Система оповещения о новых вирусных угрозах обычно работает довольно быстро. С другой стороны — учёным нужно быть крайне осторожным в трактовках результатов, ведь эти трактовки могут быть неправильно поняты, из-за чего появится очередной миф.
Источник: https://www.nature.com/articles/d41586-022-00149-9 (21.01.22)
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
7 января 2022 года вирусолог Леондиос Кострикис из Кипра рассказал по местному телеканалу, что нашёл образцы SARS-СoV-2, в которых присутствовали части от дельта-варианта и омикрон-варианта. Этот вариант назвали дельтакроном. Новость почти сразу же подхватило финансовое издание Bloomberg, и вскоре дельтакрон стал международной сенсацией.
Научное сообщество почти сразу же отреагировало и заявило, что 52 секвенированных образца SARS-СoV-2 из Кипра никак не указывают на появление нового варианта и не являются результатом рекомбинации дельта и омикрона! Например, уже 9 января, сотрудница ВОЗ, Крутика Куппалли (Krutika Kuppalli), писала в своём твиттере, что дельта и омикрон НЕ образовывали новый вариант.
Позже сам исследователь из Кипра рассказал, что его гипотеза и название дельтакрон были неправильно истолкованы. Он даже речи не вёл о гибриде дельта и омикрона. Речь шла о дельта-варианте, в S-белке которого были определены независимо возникшие мутации, похожие на некоторые мутации в омикроне.
Обнаруженные Леондиосом Кострикисом мутации не являются исключительными для омикрона и встречаются в других вариантах вируса. База данных GISAID изобилует последовательностями геномов SARS-CoV-2, в которых некоторые элементы похожи на мутации в различных вариантах вируса, названных буквами греческого алфавита: альфа, бета, гамма и т.д. Однако из всех этих сиквенсов не делают сенсацию.
Эта история показала как минимум два важных момента. С одной стороны — хорошо, что даже очень свежие данные часто становятся достоянием общественности в короткие сроки. Система оповещения о новых вирусных угрозах обычно работает довольно быстро. С другой стороны — учёным нужно быть крайне осторожным в трактовках результатов, ведь эти трактовки могут быть неправильно поняты, из-за чего появится очередной миф.
Источник: https://www.nature.com/articles/d41586-022-00149-9 (21.01.22)
Сказать спасибо: 5536 9138 3126 6560
Nature
Deltacron: the story of the variant that wasn’t
Nature - News of a ‘super variant’ combining Delta and Omicron spread rapidly last week, but researchers say it never existed and the sequences might have resulted from contamination.