@coronamed
3.28K subscribers
740 photos
45 videos
3 files
1.27K links
Изучаем и распространяем важную информацию о коронавирусе SARS-CoV2 и COVID-19

"Можете послать ваш источник к ебаной матери. Это дезинформатор, а не источник" (Сталин на донесении разведчика Старшины о том, что война начнется 22 июня)
加入频道
В ситуации, когда статистика Оперштаба приукрашивает реальность раз в 5, многие пытаются зацепиться за какие-то другие данные, чтобы оценить динамику эпидемии и ситуацию в стране - например, за статистику коек.

О том, почему региональные данные нельзя свести воедино и систематизировать, и о разных "статистических задачах" у разных регионов короткий диалог между губернатором Ленинградской области Дрозденко и главой Комздрава ЛО Вылегжаниным:

Дрозденко: Многие субъекты добавляют пустые койки для лечения больных коронавирусом, это койки, не обеспеченные ни кислородом, ни врачами.

Вылегжанин: "Под словом «койки», мы понимаем деньги, оборудование и кадры - не кровати. Мы не ставили перед собой статистических задач, поэтому у нас все койки обеспечены и кислородом, и всем другим необходимым. У нас нет пустых коек".
@coronamed
А что делать поликлиникам? Что делать больницам? Что же, всем медработникам, раз они все контактные, уйти на карантин? Закрыть поликлиники и больницы, лишить людей медицинской помощи? Этого вы хотите, когда пишете свои гадости про инфекциониста Марину Валентиновну?…
635 миллионов рублей — столько нужно потратить, чтобы 2,14 млн. медицинских работников государственного сектора (565 тыс. врачей, 1,314 млн. среднего медицинского персонала, 264 тыс. человек младшего медицинского персонала) и еще около 400 тыс. технических работников были обеспечены комплектами респираторов FFP2 на 25 смен при закупочной цене респиратора 50 рублей. По 5 респираторов каждому.

Если все медицинские работники надели бы респираторы класса FFP2, то пациенты перестали бы заражаться от медиков, а медики друг от друга — вне зависимости от квот инфекциониста Марины Валентиновны на мазки и "статистических задач" регионов.

Но вместо этого правительство выделило почти 1,5 млрд рублей на закупку 2 тысяч автомобилей для нужд первичного звена здравоохранения в районных центрах, поселках городского типа, малых городах с населением до 50 тысяч человек и в сельской местности. Это поможет облегчить и работу служб скорой помощи. Машины будут приобретены в ближайшее время и поступят в распоряжение врачей на местах.

Пандемия кретинизма она такая, да.
Как мы и говорили, ковид сейчас - это не 50%, не 80%, не 92%, а более 100% избыточной смертности.

В октябре 2020 года в Москве по оперативным данным зарегистрировано 13 718 смертей (на 3 262 случая больше, чем в октябре 2019). Превышение смертности по отношению к среднеоктябрьской за последние три года составило 3 173 случая (10 479 в 2017, 10 701 в 2018, 10 456 в 2019).

COVID-19 в качестве основной или сопутствующей причины смерти отмечен в 3 573 случаях, что обосновывает всю избыточную смертность за октябрь.
Москва: изменения в тактике скорой помощи при работе с пациентами с подозрением на ковид
На фото — Склиф 20 сентября (и любая другая российская государственная больница в любой день). За пределами красных зон медики ведут себя как обыватели: не носят маски, не соблюдают дистанцию.
Неудивительно, что ковид распространяется в медицинских коллективах как огонь по сухой траве. Медики болеют, медики умирают, медики очень много жалуются.

А ведь прекратить внутрибольничные заражения несложно — все время пребывания в здании ЛПУ медработник должен быть в респираторе. В шлюзе, в ординаторской, в комнате отдыха, в столовой, в туалете — везде.

Казалось бы, простое решение (сколько оно стоит для всей страны, мы подсчитали здесь) — но куда проще пенять на мобильники и продолжать заражать друг друга.

Вот и эпидемиологи Национальной ассоциации специалистов по контролю инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, пришли к выводу, что основными причинами внутрибольничного инфицирования ковидом медперсонала являются:
- использование сотовых телефонов внутри «красной зоны»,
- один шлюз на вход и выход,
- наличие зон отдыха персонала, в которых допускалось пребывание без респиратора,
- использование защитных пленок при организации шлюзов внахлест,
- повторное использование СИЗ,
- ношение щитков, а не очков,
- практика изоляции заболевшего сотрудника прямо на его рабочем месте.

На наш взгляд, собранных наукой данных достаточно, чтобы говорить о крайне низком риске передачи SARS-CoV2 через фомиты (поверхности), а также через конъюнктиву — чтобы заболеть, вирус надо вдохнуть.

Исходя из этого, оставляем три сценария внутрибольничного заражения ковидом:
🚩наличие зон отдыха персонала, в которых допускалось пребывание без респиратора
🚩один шлюз на вход и выход
🚩практика изоляции заболевшего сотрудника прямо на его рабочем месте

Вот с чем надо бороться — и это подтверждает опыт частных клиник и больниц, где нет вспышек внутрибольничного ковида.

Дорогие коллеги!

Сейчас вам кажется, что вы умнее анонимов из телеграма, а еще вам кажется, что в ваших бедах виноваты третьи лица, не подстелившие вам соломку.

Прошлой зимой вы были в стадии отрицания и считали, что опасность ковида преувеличена. Весной вы гневались, потом торговались за ковидные. Лето красное вы пропели, а осенью пришло время депрессии.

Когда вам надоест страдать херней в ожидании прекращения ковида, надоест болеть и умирать, когда вы перейдёте, наконец, в стадию принятия — напишите нам. У нас есть детальные многостраничные инструкции зарубежных госпиталей, которые позволяют свести риск внутрибольничного распространения ковида к минимуму. Мы с радостью адаптируем их для вас с учетом ваших реалий. Бесплатно и, если хотите, анонимно.

Просто сохраните себе этот пост.
Крутейшая интерактивная ковидная карта России от Ильи Бояндина.
Здесь видно, как изменялась смертность по месяцам 2020 года для каждого региона страны (данные Росстата с января по сентябрь), и на сколько в каждый коронавирусный месяц в каждом регионе смертность превысила уровень аналогичного месяца 2019 года.

https://covid19-russia.netlify.app/
Почему SARS-CoV2 становится опасен после 23:00 - отличный вопрос для пятничного вечера. За прошедшие две недели наш маленький коллектив примерно 20 раз прокомментировал нелепое закрытие баров и ресторанов в 23:00. Ахаха, какой глупый Собянин, ахаха, какой смешной.

Вы смешные, когда напиваетесь. Повышаете голос, много смеетесь, бегаете курить через все заведение каждые десять минут, кучкуетесь у бара, орёте в телефон, потому что вам плохо слышно, подпеваете музыке, пляшете, потом набиваетесь в такси впятером и едете в следующее место. Знаем мы вас)

Если вы начинаете накидываться в 7, то вышеописанная феерия стартует не раньше 9-10. И если заведение закроется в 11, то кошмар эпидемиолога продлится пару часов и не успеет набрать обороты. Даже если в бар пришел суперобщительный суперраспространитель - такой, например, как в этой истории - он уедет домой в 11, не успев как следует надраться и обдышать вирусным аэрозолем сто человек за ночь.

В Лондоне, кстати, снова открывают пабы - но только те, в которых посетителям предлагаются основательные (это подчеркивается) закуски. Не потому, что вирус заражает голодных и не заражает сытых, ахаха, какой глупый Борис Джонсон и его ученые. Потому что вирусы коварны - и некоторые даже умеют влиять на нервную и эндокринную системы хозяина особым образом, чтобы делать своих хостов в инкубационном периоде более общительными, более социально активными, более заразными. Не исключено, что наш SARS-CoV2 из таких.

Так что задумайтесь - кому в данную минуту так остро не хочется домой, вам или вирусу внутри вас?
Госпиталь ветеранов, Екатеринбург, объявление в холле
А это возмущённые пациенты, которых НЕ ЛЕЧАТ, в комментариях на URA.RU
История о новой, возможно более летальной мутации V1176F (G25088T) интересна даже тем, кто далек от науки. Прежде, чем вы начнете паниковать, сразу предупредим – мы уверены только в том, что в одной выборке из 147 случаев, секвенированной в Институте Лутца в Сан-Паулу, летальность в группе с мутацией V1176F составила 89% против 75% в группе без нее. Больше ни в чем мы пока не уверены.

Помните, мы жаловались, что научные издания публикуют материалы по теме ковида в препринтах, без peer review, и поэтому всё летит куда не следует? Да кто такой этот наш peer review? В российской науке этот процесс принято называть «рецензирование» - свое мнение о статье в формате печатной рецензии высказывают научные работники из этой области, что позволяет выявить исследования с ошибочной методологией и выводами. Но нам больше нравится международный термин peer review (рассмотрение коллегами), который помимо классических рецензий включает в себя новые, нежно любимые нами форматы, например, срач ученых в Твиттере.

В конце октября группа ученых под руководством Jody Haigh из Университета Манитобы (Канада) выложила на Medrxiv препринт Large-scale population analysis of SARS-CoV-2 whole genome sequences reveals host-mediated viral evolution with emergence of mutations in the viral Spike protein associated with elevated mortality rates.

В рамках исследования они изучили более 94000 вирусных последовательностей SARS-CoV-2 из репозиториев GISAID и SRA, чтобы понять, как эволюционирует SARS-CoV2, и выявить любую повышенную смертность, связанную с новыми вариациями. Авторы пришли к выводу, что SARS-CoV-2 активно видоизменяется под действием иммунной системы хозяина: на уровне глобальной популяции некоторые белки SARS-CoV2 находятся в стадии активной эволюции. Два возникающих варианта - V1176F в сочетании с мутацией D614G в спайк-белке (о новом штамме D614G много писали в начале осени и пришли к выводу, что мутация повысила заразность вируса, но не повлияла на его летальность) и S477N в рецепторсвязывающем домене (RBD) спайк-белка - они связали с более высокой летальностью.

В середине ноября другая группа ученых под руководством Christoph Lange из Гарварда выложила на Researchsquare препринт Mutations in SARS-CoV-2 spike protein and RNA polymerase complex are associated with COVID-19 mortality risk.

В рамках исследования они проанализировали 3626 однонитевых РНК-геномов пациентов с SARS-CoV-2 из базы данных GISAID, для которых указан исход COVID-19 для пациента (выжил/умер). В общей сложности, при оценке 28 492 локусов вирусного генома на предмет ассоциации со смертью пациента два локуса - 12053 п.о. (L70F) и 25088 п.о. (V1176F) - достигли общегеномной значимости. Мутация 25088 произошла в субъединице S2 шипового белка SARS-CoV-2, который играет ключевую роль в проникновении вируса в клетки-мишени. Мутация 12053 расположена в гене ORF1ab в области, кодирующей белок nsp7, который необходим для образования комплекса РНК-полимеразы, ответственного за репликацию и транскрипцию вируса. Обе мутации изменили аминокислотные кодирующие последовательности, и обе могут быть структурными изменениями, усиливающими вирусную инфекционность и тяжесть заболевания.

Тут мы, конечно, пошли делать ревизию запасов гречки, благо с весны ждём из Латинской Америки чемоданы новых злых штаммов. Но 25 ноября на Кристофа Ланга обрушился в Твиттере эволюционный биолог Эндрю Рэмбо из Университета Эдинбурга.

Рэмбо считает, что команда Ланга (и команда Хея тоже) допустила ошибку, включив в исследование 147 случаев, секвенированных Институтом Адольфо Лутца (Instituto Adolfo Lutz) в Сан-Паулу. Всего в GISAID 168 геномов с мутацией V1176F и известным исходом болезни, 160 из них – бразильские пациенты, 131 из этих V1176F-пациентов значатся в базе как умершие (CFR 81%). 147 из 160 бразильских V1176F геномов (в том числе 131 из 131 летальных исходов) секвенированы и загружены Институтом Лутца, то есть CFR мутации V1176F в выборке от IAL составляет 89%. Помимо случаев с мутацией V1176F в GISAID есть еще 62 генома, загруженные IAL – и 47 из них от умерших пациентов (CFR 75%). C другой стороны, если из 168 бразильских V1176F-геномов исключить данные от IAL, то останется 21 случай, среди которых нет летальных исходов.

Рэмбо и Ана Гимараеш из Университета Сан-Паулу уверены, что кластер геномов, загруженный в репозиторий Институтом Лутца, нерепрезентативен, поскольку в начале пандемии приоритет намеренно отдавался секвенированию образцов от случаев с летальным исходом.

Рэмбо уже работал с данными из Бразилии - в частности, в рамках исследования Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil, опубликованном в Science в июле.
Эта работа была раскритикована учёными из Сан-Паулу (из Института Бутантан, который сотрудничает с Оксфордом по КИ вакцины AstraZeneca) в части чрезмерного доверия бразильским данным. В рецензии Noisy genome data and faulty clade statistics undermine conclusions on SARS-CoV-2 evolution and strain typing in the Brazilian epidemy: A Technical Note от 30 августа они утверждают, что низкое качество всех 427 бразильских геномов SARS-CoV-2, использованных в работе над публикацией в Science, ставит под сомнение выводы филогенетического анализа и может быть причиной неверного типирования штаммов в клады из-за опоры на некорректную статистику.

А потом в комментарии к Рэмбо пришел Ланг, и написал:
Уважаемый Эндрю! Когда вы связались с нами во время первого раунда рецензирования нашей рукописи и обозначили эти проблемы (несбалансированность выборки в GISAID), мы объяснили вам, какие методы использовали в исследовании для защиты наших результатов от таких эффектов. Со времени первой версии рукописи нам стало доступно больше данных. Ассоциация [мутаций V1176F и L70F с более высокой смертностью] в Бразилии стали более выраженной, появились данные об умерших пациентах с данными мутациями в США и Чехии.

Итого, две группы ученых из Гарварда и из Манитобы уверены, что данные из Бразилии и не только говорят о том, что у нас есть более летальная мутация, другие учёные считают, что налицо ложная корреляция и систематическая ошибка из-за неучтенного конфаундера, а третья группа утверждает, что бразильские геномы, загруженные в GISAID – в принципе барахло.

Мы не настолько математики, чтобы оценить корректность методологии исследования Ланга, так что будем следить за сюжетом с более летальной мутацией и ждать, пока все прояснится - ведь мы очень ответственный канал о ковиде.
И у нас есть новый лидер биржевой гонки вакцин со 100%. У Модерны в группе плацебо зарегистрировано 30 случаев тяжелого течения COVID-19 (в том числе 1 смерть) против ноля в группе вакцины мРНК-1273. Почему бы не вбросить в инфополе красивую цифру в 100% и не заработать на росте акций?
Вот только вся эта выборка - 196 случаев ковида, в том числе 11 случаев в группе вакцины.
Одиннадцать.
Веспасиан одобряет.
Forwarded from Znak.com
В Кремле не видят необходимости вводить новые меры господдержки бизнеса, заявил пресс-секретарь президента РФ Дмитрий Песков

По его словам, введение нового пакета мер помощи российскому бизнесу не планируется, так как экономика продолжает работать. При этом Песков не стал отрицать, что у предпринимателей есть проблемы из-за пандемии коронавируса.
Осторожно, лонгрид!

1 декабря, в День борьбы со СПИДом, мы решили рассказать о том, как 30 лет назад в США проводились клинические испытания препаратов от СПИДа. Это история о том, что случается, когда переплетаются шкурные интересы фармы, политиков и отдельных пациентов. После каждого второго предложения можно в скобках писать "Что-то напоминает, правда?" ─ это будет уместно, потому что абсолютно всё в этой истории напоминает происходящее сейчас.

Помимо прочего, в процессе написания лонгрида наткнулись на выпуск ЛГБТ-журнала The Advocate от 16 мая 1995 года с рассказами участников клинических испытаний лекарств от СПИДа, и перевели их с небольшими сокращениями, потому что круто читать свидетельства людей из 1995 года.

Но начать всё же следует с того, как США крупно облажались с ВИЧ...
Слайд из презентации главного экономиста Внешэкономбанка Андрея Клепача «Среднесрочные и долгосрочные вызовы российской экономики»