@coronamed
3.27K subscribers
740 photos
45 videos
3 files
1.27K links
Изучаем и распространяем важную информацию о коронавирусе SARS-CoV2 и COVID-19

"Можете послать ваш источник к ебаной матери. Это дезинформатор, а не источник" (Сталин на донесении разведчика Старшины о том, что война начнется 22 июня)
加入频道
Помните ли вы невероятного Кари Стефанссона из Исландии и его deCODE? Он отправил министру здравоохранения мемо о том, что теперь будет каждый день отбирать образцы для секвенирования, поскольку в Исландии омикрон обнаружен сразу у троих пациентов. Вариант подтвержден у жителя портового города Акранес, строителя компании HVE, который был изолирован с симптомами ковида, а также у двоих его контактных коллег. Индексный пациент вакцинирован тремя дозами, источник инфекции не установлен.

Омикрон-дашборд обновляется здесь
Доброе утро
Апдейт нашего омикрон-дашборда:

США: 5 случаев в штате Нью-Йорк и 1 у женщины, вернувшейся из Нью-Йорка в Миннесоту (напишем об этом отдельный пост). 1 новый случай в Калифорнии, округ Лос-Анжелес: пациент летал в ЮАР через Лондон и вернулся 22 ноября, полностью вакцинирован. По 1 случаю в Колорадо (вакцинированная двумя дозами пациентка вернулась из южноафриканской страны) и на Гавайях (пациент ранее болел ковидом, не вакцинирован, не выезжал за пределы штата).

Австралия: омикрон у ученика средней школы в западном Сиднее, истории путешествий и контактов с путешественниками нет. Всего 10 случаев - 9 в Новом Южном Уэльсе, 1 прилетевший из Йоханнесбурга на карантине в Дарвине, Северная Территория.

Испания: 5 ящиков омикрона, как любезно перевел гугл, подтверждены секвенированием в Испании. По 2 вакцинированных туриста были обнаружены в Мадриде и Барселоне: полностью вакцинированные путешественники с отрицательными тестами на ковид прилетели из ЮАР со стыковкой в Европе (в двух случаях это Амстердам), но получили положительный результат экспресс-теста на антиген в аэропорту Мадрида и Барселоны соответственно. Пятый случай - вакцинированный двумя дозами АстраЗенеки 62-летний житель Мадрида без истории поездок, источник инфекции не известен. Также 1 случаю предварительно подтвердили ПЦР Майорка и Балеарские острова.

Великобритания: +7 случаев в Англии, +3 в Шотландии, всего 42. Работы в стране так много, что в гисэйд депонировано только 18 сиквенсов.

Дания: всего подтверждено секвенированием 14 случаев, из них 11 - у путешественников (10 - страны юга Африки,1 - Катар), еще 18 проб в работе. Высока доля образцов с выпадением S-гена на ПЦР, которые при секвенировании оказываются дельтой - вчера их было 3 из 11, позавчера 3 из 8, 30 ноября - 4 из 9.

Канада: пятый случай в Онтарио, контактировал с путешественником, вернувшимся с юга Африки (Нигерии), одним из подтвержденных 28 или 29 ноября. Всего 10.

Бразилия: два новых случая, пассажиры с омикроном отдельно друг от друга прилетели в Сан-Паулу из ЮАР через Эфиопию 27 ноября, оттуда внутренним рейсом в Бразилиа. В одном из случаев есть симптомы ковида, второй - бессимптомный случай у вакцинированного 3 дозами мужчины возраста 40-49.
А помните в апреле мы писали, как в Австралии приняли решение вести открытую дискуссию о рисках вакцинации (АстраЗенека и вновь выявленные VITT) вместо пропаганды? Мы тогда еще цитировали профессора Кроуфорда, директора SAEFVIC (Surveillance of Adverse Events Following Vaccination in the Community), руководителя службы иммунизации Королевского детского госпиталя в Мельбурне, главного редактора Clinical Vaccinology Update, автора главы о рисках в Австралийском справочнике по иммунизации и эксперта по работе с сомнениями по поводу вакцин.

На скрине - процент вакцинированных в штате Новый Южный Уэльс по состоянию на 1 декабря.

И да, это могли бы быть мы - но кое-кто выбрал путь мотивирующих плакатов про трусливого бегемота.
Данные по ЮАР передаются в NICD с временным лагом (к счастью, не 2-3 месяца, как в некоторых других странах), так что динамика госпитализаций в сопоставлении с предыдущими волнами после апдейта выглядит так же удручающе, как и динамика новых случаев. Очень опасный вариант, очень плохая волна, и очень глупый wishful thinking опять случился с миром.

Новые данные из ЮАР, общая ситуация тремя строками:

🔸30 ноября - 4373 новых случая, 10,7% коэффициент позитивности, 2414 (+86) в стационарах, 234 (+1) в ОРИТ, 21 умерший
🔸1 декабря - 8561 новый случай, 16,5% коэффициент позитивности, 2550 (+136) в стационаре, 235 (+1) в ОРИТ, 28 умерших
🔸2 декабря - 11535 новых случаев, 22,4% коэффициент позитивности, 2904 (+274) в стационаре, 262 (+27) в ОРИТ, 44 умерших

При таком высоком коэффициенте позитивности можно предполагать высокую долю симптомных случаев - и значительное число бессимптомников/досимптомников, которых мы не видим.

Следующая неделя в ЮАР - выходные дни. Храни их Господь, конечно.
Гипотеза Римана, уравнения Навье-Стокса и подготовка пакета документов по Спутнику V для ЕМА и ВОЗ - вот над чем бьются лучшие умы человечества.

После заявления Дмитриева (РФПИ), что ВОЗ задерживает одобрение "Спутника V" из-за бюрократии, Говорит Москва взяла комментарий у Мелиты Вуйнович, которая сообщила, что предоставленных российской стороной документов недостаточно для сертификации препарата:

ВОЗ продолжит оценку вакцины «Спутник V» и опубликует решение о её статусе в перечне продукции, допущенной для использования в условиях чрезвычайной ситуации (EUL), когда будут доступны все данные от производителя и обзор будет завершён. Подробности процедуры включения в перечень продукции, допущенной для использования в условиях чрезвычайной ситуации, чётко изложены, и в соответствии с этими правилами штаб-квартира ВОЗ публикует материалы только после завершения полной процедуры оценки. Должно быть доступно полное досье (например, все данные о качестве, относящиеся к производству, и т.д.), и, как известно, ВОЗ допускает в соответствии с EUL, чтобы документы предоставлялись заявителем поэтапно.

Может быть, пора звонить Перельману?
В очередной раз о ситуации в крупнейшем ковидном госпитале Йоханнесбурга рассказала в прямом эфире профессор Матива, зав. ОРИТ госпиталя Барагванат в Йоханнесбурге:

🔸в госпиталь Барагванат везут тяжелых и критических больных

🔸заполняемость ОРИТ растет, на ИВЛ 17-летний мальчик с ковид-пневмонией, прогрессирует ковид у 15-летнего пациента ОРИТ

🔸много детей с симптомным ковидом, которые требуют госпитализации - это возрастные группы которых врачи не видели в прошлые волны (тогда детей с ковидом в стационаре практически не было, иногда госпитализировали младенцев, но это не было тяжелое течение)

🔸дети больше не переносят болезнь легко - это указывает на новый вариант

🔸в больнице 37 ков+ беременных, в том числе 22 женщины с серьезными симптомами, все невакцинированы

🔸основной возраст больных - от 25-35 до 40-50, в основном не вакцинированные, есть небольшой процент тех, кто получил 1 дозу Файзер, но не дошел за второй, ни одного вакцинированного в ОРИТ пока нет

🔸новый вариант инфицирует вакцинированных, сотрудники госпиталя (весь персонал вакцинирован) массово получают положительные результаты ПЦР, они болеют дома, нуждаются в поддерживающей терапии, но случаев тяжелого течения пока не было

🔸в госпитале образовался дефицит персонала

🔸несмотря на это, врачи работают над соотнесением клинических случаев с данными генотипирования (поступают с временным лагом) и копят информацию по клинике нового варианта

Рекомендуем послушать эфир, английский доктора Мативы хорошо воспринимается на слух.

Предыдущие посты с информацией из больницы Барагванат 1️⃣ 2️⃣

Больше новых данных в следующем посте⬇️
Итак, вот омикрон, который сидит на очень длинной ветви филогенетического дерева (ученые считают это признаком того, что вариант возник у пациента с иммунодефицитом или иммуносупрессией, хронически инфицированного SARS-CoV-2).

Страна происхождения варианта неизвестна. Мы анализируем случаи из дашборда, и хотя большинство завозов омикрона сейчас - это импорт из ЮАР, полагаем, что вариант возник где-то еще, возможно, в Нигерии.

Однако оценивать свойства и опасность омикрона мы сегодня можем именно благодаря ЮАР, откуда сейчас приходят подробные данные (вчерашний брифинг, отчет). Их мы проанализируем ниже⬇️
Самый ранний кластер заражений фиксировался в Tshwane University of Technology начиная с 15 ноября.

Вот что происходило в городском округе Тшване в ноябре:

Увеличение количества госпитализаций впервые наблюдалось в городском округе Тшване на 45-й неделе и во всех других районах Гаутенга на 46-й неделе. С 46-й недели также увеличилось количество госпитализаций в провинциях Северо-Запад, Мпумаланга, Лимпопо и Восточный Кейп.

В городском округе Тшване с 14 по 27 ноября 2021 года было зарегистрировано 640 госпитализаций и 23 случая смерти по данным государственного и частного секторов здравоохранения. Большинство (87%) пациентов с ковидом поступили с симптомами. 11% всех госпитализаций приходились на детей младше 2 лет.

Оранжевый - случаи, серый - госпитализации. Видно, как сильно запаздывала выявляемость ковида в Тшване ноябре.

Продолжение⬇️
Омикрон распространился по всей провинции Гаутенг за 3 недели и запустил не имеющую аналогов волну заболеваемости

⬇️
Обратите внимание на прирост госпитализаций, не имеющий аналогов ни в одной из предыдущих волн, в конце первого графика.

За этот прирост практически единолично отвечает Тшване, где в первой половине ноября в среднем госпитализировали менее 10 ковидных пациентов в сутки, а во второй - более 45. Эпидемиологи говорят о росте с 18 до 49 в сутки в период с 14 по 27 ноября.

⬇️
На графике коэффициента позитивности (вся Африка) отчетливо видно, как начинает расти, а потом взлетает доля положительных тестов от всех сделанных тестов в группах детей и молодежи. Нужно помнить, что взятие биоматериала для ПЦР на ковид у младенцев - процедура, которой медики стараются избегать, и заболеваемость в этой группе может быть очень сильно недовыявлена.

График коэффициента позитивности в Гаутенге (эпицентр волны омикрона) отличается - оказывается, там в группе 10–29 лет он составлял 25% уже к 21 ноября. Не исключено, что сейчас в этой возрастной группе он уже превышает 50%, то есть большинство сдающих тест на ковид детей и подростков имеют симптомы.

⬇️
Референсы по неделям: число тестов и коэффициенты позитивности по неделям в предыдущие волны ковида в ЮАР.

⬇️
Ковид и дети.

Важно понимать, что данные по госпитализациям прошедших периодов постоянно уточняются (в большую сторону), поэтому масштаб бедствия еще не понятен даже по Тшване, но совершенно четко видно, что демографический профиль ковида уже на старте 4 волны (омикрон) разительно отличается от старта 3 волны (дельта) - то, о чем говорит профессор Матива, зав. ОРИТ госпиталя Барагванат в Йоханнесбурге.

1 слайд - данные из медиабрифинга Минздрава ЮАР 2 декабря
2 слайд - данные из брифинга 29 ноября

73 из 640 (11,6%) госпитализаций в стационары Тшване в период с 11 по 27 ноября - малыши в возрасте до 2 лет.

При виде такой тревожной статистики многочисленные страусы пытаются спрятать голову в песок. Причины детских госпитализаций ищут в мнительности родителей, в перестраховке врачей, в сопутствующих заболеваниях - как же, ведь терапевт Анжелик Кутзе, у которой в частной клинике побывали целых две дюжины пациентов, пообещала миру легкий и приятный омикрон-ковид, мягонький, как ЭпиВакКорона.

Продолжение⬇️