Chem ML/AI/Datasets
405 subscribers
16 photos
64 links
Ежедневные статьи и новости из области машинного обучения в химии от сотрудников ИОНХ РАН @chemrussia

Для связи: @levkrasnov @st613laboratory @StasBezzubov
加入频道
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥В сборе больших открытых датасетов самая приятная часть — это когда они потом используются другими исследователями для прикладных целей, а не кладутся в стол.

Когда-то давно в 2022 году мы опубликовали на Zenodo BigSolDB — крупнейший датасет (известный нам) по растворимости, содержащий 54273 значений растворимости при температурах от 243.15 до 403.15K, в котором присутствуют 138 растворителей и 830 соединений.

📕А совсем недавно на глаза попалась статья от одной из крупнейших мировых фармацевтических корпораций – GlaxoSmithKline (GSK). Они использовли ML-модель для предсказания растворимости соединений на основе BigSolDB, а затем внедрили ее в свои лабораторные процессы.

Чем были полезны наши данные со стороны авторов:
🔹 Дополнением внутренней базы GSK, которая ограничена их исследовательскими соединениями.
🔹 Доступом к разным температурным режимам, что улучшило предсказания при высоких температурах.
🔹 Добавлением редких растворителей, которые раньше модель предсказывала с высокой погрешностью.

Такие моменты сильно повышают мотивацию и далее делать открытые датасеты для более полной систематизации экспериментальных данных по разным химическим областям.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🎊Сегодня у нас наконец-то вышла статья:

Towards Accelerating the Discovery of Efficient Iridium(III) Emitters Using Novel Database and Machine Learning Based Only on Structural Formula


https://doi.org/10.1039/D5TC00305A

1. В этой статье мы собрали базу данных IrLumDB, в которой содержатся экспериментальные данные о 1287 бис-циклометалированных комлексах иридия (III) и их фотофизических свойствах (длина волны эмиссии (λmax), квантовый выход (PLQY) и время жизни).

2. На основе IrLumDB обучили XGBoost, LightGBM и Catboost предсказывать λmax и PLQY с MAE 18.26 нм и 0.13 на десятикратной кросс-валидации.

3. Протестировали работу обученных моделей на 33 синтезированных в нашей лаборатории комплексах, 12 из которых были получены для этой статьи. Комплексы были охарактеризованы с помощью ЯМР, РСА, масс-спектрометрии высокого разрешения, и частично РФА. 9 новых структур были депонированы в CCDC.

4. Сравнили на изученных нами соединениях точность предсказания длины волны эмиссии с помощью алгоритмов машинного обучения и с помощью DFT-расчетов; показали, что алгоритмы машинного обучения справляются с задачей лучше.

5. Так как нам важно искать новые комплексы с потенциально высокими квантовыми выходами, то мы разделили все комплексы на 3 класса: с низким (0-0.1), средним (0.1-0.5) и высоким PLQY (0.5-1), далее обучили классификационные модели и получили точность 72.4% на десятикратной кросс-валидации.

6. Подготовили мини-приложение IrLumDB App для того, чтобы любой исследователь смог предсказать свойства для своих комплексов. Для предсказания достаточно SMILES лигандов.

Датасет на Zenodo | IrLumDB App

📕Journal of Materials Chemistry C (IF=5.7)
#dataset #application
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM