Тем временем исследователи, активисты и ещё многие подписывают письмо о том что все данные о вакцинах от COVID-19 должны быть открыты и прозрачны [1]. Инициаторы письма The GovLab и Federation of American Scientists.

Ранее об этом же писали The Washington Post [2] то что требованием для всех вакцин должна быть полная открытость данных о проведении испытаний.

Необходимо ли аналогичное требование в России? Я считаю что безусловно необходимо. Но пока есть проблемы даже с тем чтобы получить просто достоверные данные по заболеваемости и смертности, об этом мы говорили на секции про открытые данные при COVID-19 в России на ОГФ [3]

Ссылки:
[1] https://openvaccines.thegovlab.org/
[2] https://www.washingtonpost.com/opinions/2020/12/04/fda-should-condition-any-vaccine-approval-open-trial-data/
[3] https://www.youtube.com/watch?v=W9HP2e2knog

#opendata #covid19 #data

В США опубликовали официальные данные по загрузке больниц во время эпидемии COVID-19 [1] с гранулярностью до каждой больницы и по неделям начиная с 31 июля 2020 года.

Также можно обратить внимание что на этом же портале HealthData.gov раскрывается 188 наборов данных связанных с COVID-19 [2] и 4634 по системе здравоохранения в целом [3], причём не менее половины данных поступает из систем здравоохранения отдельных штатов, а сам портал создан U.S. Department of Health которые также ведут HHS Protect Public Data Hub [4] где публикуются дашборды статистики, но сами данные, обязательно, публикуются на HealthData.gov, а уже оттуда транслируются на другие официальные государственные ресурсы.

Ссылки:
[1] https://healthdata.gov/dataset/covid-19-reported-patient-impact-and-hospital-capacity-facility
[2] https://healthdata.gov/search/type/dataset?query=covid-19&sort_by=changed&sort_order=DESC
[3] https://healthdata.gov/search/type/dataset
[4] https://protect-public.hhs.gov/

#opendata #data #covid19 #usa #health

В Nature статья о запросе учёных на полностью открытый обмен данными о коронавирусе [1]. 29 января сотнями ведущих учёных было подготовлено и подписано открытое письмо [2] о том что данные о расшифровке геномов штаммов SARS-CoV-2 должны публиковаться на портале International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC) [3] и быть доступными всем желающим.

Это необходимо потому что без этого невозможно поддерживать высокий темп разработки мер противодействия COVID-19.

Откуда возникло это письмо? В статье подробно рассматривается текущая инфраструктура раскрытия геномных данных. Основным порталом для их сбора является GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data) [4] созданный в форме государтсвенно-частной инициативы [5] правительствами Германии, США, Сингапура, Бразилии, компании Seqirus и фонда Sanofi Pasteur’s Foundation for Influenza Epidemiology.

GISAID изначально был платформой не про открытие данные, а про обмен данными (data sharing). Главная причина в том что учёные работающие над исследованиями хотят точно знать кто скачивал и использует их данные и быть уверенными что результаты их работы
не будут использованы без ссылки на них.

Авторы письма не предлагают открыть данные GISAID, но получится ли создать более полную базу данных и полностью открытую, вот в чём вопрос. Впрочем проблема COVID-19 - это, действительно, мировая проблема и хочется надеяться что принципы ограничения доступа к информации применяемые в "условно-мирное время" могут быть более открытыми во время пандемии.


Ссылки:
[1] https://www.nature.com/articles/d41586-021-00305-7
[2] https://www.covid19dataportal.org/support-data-sharing-covid19
[3] http://www.insdc.org/
[4] https://www.gisaid.org/
[5] https://www.gisaid.org/about-us/public-private-partnerships/

#opendata #openaccess #fair #covid19